81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A3336 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0159  FAD dependent oxidoreductase  87.61 
 
 		 461 aa  851    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.542085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0146  FAD dependent oxidoreductase  87.61 
 
 		 461 aa  849    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3336  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 461 aa  951    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4405  FAD dependent oxidoreductase  49.38 
 
 		 484 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1370  FAD dependent oxidoreductase  34.86 
 
 		 491 aa  253  7e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3371  FAD dependent oxidoreductase  29.42 
 
 		 488 aa  172  7.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0604216 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3505  FAD dependent oxidoreductase  25.92 
 
 		 465 aa  83.2  0.000000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  27.64 
 
 		 372 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  25 
 
 		 382 aa  65.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  26.52 
 
 		 361 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1932  FAD dependent oxidoreductase  25.56 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  25.13 
 
 		 363 aa  61.6  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  26.58 
 
 		 392 aa  59.7  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  23.66 
 
 		 375 aa  59.7  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  26.36 
 
 		 365 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  21.07 
 
 		 372 aa  58.9  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  23.79 
 
 		 368 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7518  glycine oxidase ThiO  24.79 
 
 		 402 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316675  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1152  glycine oxidase ThiO  28.57 
 
 		 360 aa  58.5  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  25.84 
 
 		 365 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  23.39 
 
 		 379 aa  56.2  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  25.45 
 
 		 404 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  25.58 
 
 		 365 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0054  FAD dependent oxidoreductase  29.54 
 
 		 371 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327919 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  25 
 
 		 375 aa  55.8  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3818  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  26.03 
 
 		 373 aa  53.9  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0193828  hitchhiker  0.0039585 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4797  glycine oxidase ThiO  23.84 
 
 		 684 aa  53.5  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.937607  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2502  glycine oxidase ThiO  25.4 
 
 		 454 aa  53.5  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131028 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  25.1 
 
 		 410 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31544  predicted protein  24.7 
 
 		 1033 aa  52.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4550  glycine oxidase ThiO  25.59 
 
 		 365 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  24.46 
 
 		 387 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0094  glycine oxidase ThiO  27.18 
 
 		 368 aa  51.6  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.883041  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1878  FAD dependent oxidoreductase  26.76 
 
 		 379 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.386717 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  27.47 
 
 		 384 aa  51.2  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  24.21 
 
 		 388 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  26.22 
 
 		 349 aa  50.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0284  glycine oxidase ThiO  23.62 
 
 		 334 aa  50.4  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  26.25 
 
 		 371 aa  50.4  0.00007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  24.78 
 
 		 376 aa  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0895  FAD dependent oxidoreductase  22.19 
 
 		 365 aa  50.1  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00321446  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  23.79 
 
 		 652 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0817  oxidoreductase, FAD-binding protein  25.57 
 
 		 367 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  27.18 
 
 		 364 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5918  glycine oxidase ThiO  27.31 
 
 		 330 aa  48.9  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2697  D-amino-acid dehydrogenase  23.97 
 
 		 419 aa  48.5  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.402587  normal  0.380863 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0495  glycine oxidase ThiO  27.32 
 
 		 395 aa  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233014 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2712  FAD dependent oxidoreductase  21.52 
 
 		 415 aa  47.8  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  21.19 
 
 		 374 aa  47.8  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0245  D-amino acid dehydrogenase small subunit  22.57 
 
 		 432 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0721  FAD dependent oxidoreductase  24.59 
 
 		 367 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18850  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  24.9 
 
 		 819 aa  47  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  25.75 
 
 		 401 aa  47  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0038  FAD dependent oxidoreductase  22.8 
 
 		 353 aa  47  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3856  sarcosine oxidase subunit beta  24.47 
 
 		 408 aa  47  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.014492  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2715  oxidoreductase, FAD-binding  22.96 
 
 		 361 aa  46.6  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725073  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1818  D-amino-acid dehydrogenase  26.42 
 
 		 419 aa  46.6  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23290  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  25.65 
 
 		 420 aa  46.6  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2498  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  24.43 
 
 		 355 aa  46.6  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.373577  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28291  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  23.23 
 
 		 371 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2709  D-nopaline dehydrogenase  26 
 
 		 364 aa  46.2  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.933901  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  26.25 
 
 		 405 aa  46.6  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  22.73 
 
 		 666 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  29.83 
 
 		 391 aa  45.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2797  d-amino-acid dehydrogenase  25.55 
 
 		 419 aa  45.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337327  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5548  oxidoreductase  22.47 
 
 		 373 aa  45.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2192  FAD dependent oxidoreductase  21.65 
 
 		 375 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0097  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  28.38 
 
 		 623 aa  45.1  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0795977 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0804  D-amino acid dehydrogenase small subunit  21.81 
 
 		 433 aa  44.7  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1656  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  29.57 
 
 		 624 aa  45.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.715348  normal  0.183279 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4708  D-amino-acid dehydrogenase  28.43 
 
 		 416 aa  45.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0268741 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4390  glycine oxidase ThiO  25 
 
 		 361 aa  44.3  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1862  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  30.11 
 
 		 624 aa  44.3  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.167859 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0009  glycine oxidase ThiO  25.55 
 
 		 338 aa  44.3  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1583  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  28.7 
 
 		 624 aa  44.3  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.149623 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18810  sarcosine oxidase, beta subunit family, heterotetrameric form  23.46 
 
 		 412 aa  43.1  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0165  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  28.41 
 
 		 625 aa  43.5  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70040  D-amino acid dehydrogenase small subunit  22.17 
 
 		 432 aa  43.1  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1936  FAD dependent oxidoreductase  23.87 
 
 		 374 aa  43.1  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.969419  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  27.74 
 
 		 385 aa  43.1  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3583  FAD dependent oxidoreductase  28.33 
 
 		 390 aa  43.1  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.445103 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>