167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3371 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3371  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 488 aa  976    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0604216 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1370  FAD dependent oxidoreductase  40.65 
 
 		 491 aa  296  6e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4405  FAD dependent oxidoreductase  29.89 
 
 		 484 aa  187  4e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3336  FAD dependent oxidoreductase  28.91 
 
 		 461 aa  184  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0159  FAD dependent oxidoreductase  28.79 
 
 		 461 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.542085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0146  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 461 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  33.88 
 
 		 372 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  30.81 
 
 		 374 aa  92  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  30.81 
 
 		 405 aa  90.5  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2172  FAD dependent oxidoreductase  26.83 
 
 		 380 aa  87.4  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  28.27 
 
 		 382 aa  87.4  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  31.5 
 
 		 391 aa  87  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  31.99 
 
 		 392 aa  82  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  35.02 
 
 		 384 aa  78.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7518  glycine oxidase ThiO  31.72 
 
 		 402 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316675  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2715  oxidoreductase, FAD-binding  32 
 
 		 361 aa  75.1  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725073  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23290  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  27.23 
 
 		 420 aa  74.3  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2797  d-amino-acid dehydrogenase  27.27 
 
 		 419 aa  74.3  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337327  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3977  FAD dependent oxidoreductase  31.02 
 
 		 377 aa  73.9  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  28.53 
 
 		 379 aa  73.2  0.000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  33.47 
 
 		 388 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  24.93 
 
 		 369 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  22.61 
 
 		 372 aa  71.2  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3116  glycine oxidase ThiO  35.09 
 
 		 393 aa  70.9  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  28.31 
 
 		 361 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  31.25 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3505  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 		 465 aa  70.9  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604467 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  28.52 
 
 		 365 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  33.49 
 
 		 375 aa  70.5  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31544  predicted protein  25.83 
 
 		 1033 aa  69.7  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  29.1 
 
 		 365 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  23.14 
 
 		 367 aa  68.2  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0964  glycine oxidase ThiO  31.78 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  29.25 
 
 		 385 aa  67  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  28.76 
 
 		 365 aa  66.6  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  27.63 
 
 		 375 aa  66.2  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2389  D-amino-acid dehydrogenase  25.52 
 
 		 439 aa  66.6  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  30.75 
 
 		 410 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  29.02 
 
 		 363 aa  65.5  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  28.76 
 
 		 411 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  30.35 
 
 		 375 aa  65.1  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2498  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  31.8 
 
 		 355 aa  64.3  0.000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.373577  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3219  thiazole synthase  25.73 
 
 		 652 aa  63.9  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3470  D-amino-acid dehydrogenase  28.17 
 
 		 458 aa  63.5  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1152  glycine oxidase ThiO  27.5 
 
 		 360 aa  63.5  0.000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0817  oxidoreductase, FAD-binding protein  26.64 
 
 		 367 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0721  FAD dependent oxidoreductase  28.08 
 
 		 367 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  25.13 
 
 		 652 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4841  FAD dependent oxidoreductase  29.65 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.388467  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4550  glycine oxidase ThiO  27.52 
 
 		 365 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0495  glycine oxidase ThiO  29.79 
 
 		 395 aa  62  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233014 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00611  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  29.72 
 
 		 367 aa  61.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.741936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  32.09 
 
 		 386 aa  61.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1380  glycine/D-amino acid oxidase family protein  28.24 
 
 		 367 aa  60.8  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  28.31 
 
 		 440 aa  60.8  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5880  FAD dependent oxidoreductase  27.01 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0408226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1818  D-amino-acid dehydrogenase  30.34 
 
 		 419 aa  60.1  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  31.28 
 
 		 349 aa  59.3  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0094  glycine oxidase ThiO  32.72 
 
 		 368 aa  59.7  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.883041  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  29.96 
 
 		 368 aa  58.9  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  24.14 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1878  FAD dependent oxidoreductase  28.78 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.386717 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2431  D-amino-acid dehydrogenase  26.57 
 
 		 416 aa  58.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0276149 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  27.2 
 
 		 367 aa  58.5  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  29.13 
 
 		 371 aa  58.5  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  24.32 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0139  FAD dependent oxidoreductase  31.2 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.297271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  29.87 
 
 		 364 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  23.61 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0146  glycine oxidase ThiO  30.75 
 
 		 376 aa  57.4  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473112  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  25.58 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  29.22 
 
 		 404 aa  56.6  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0647  D-amino-acid dehydrogenase  25.89 
 
 		 452 aa  56.2  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.685795  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2597  FAD dependent oxidoreductase  25.24 
 
 		 415 aa  55.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  27.92 
 
 		 378 aa  55.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  23.61 
 
 		 369 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  23.34 
 
 		 369 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0157  glycine oxidase ThiO  31 
 
 		 376 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28291  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  31.82 
 
 		 371 aa  55.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  23.34 
 
 		 369 aa  54.3  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  23.34 
 
 		 369 aa  54.3  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  34.86 
 
 		 666 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  27.48 
 
 		 360 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2502  glycine oxidase ThiO  27.03 
 
 		 454 aa  53.9  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131028 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  26.96 
 
 		 368 aa  53.9  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0146  FAD dependent oxidoreductase  30.53 
 
 		 346 aa  53.9  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00168666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0176  FAD dependent oxidoreductase  29.56 
 
 		 373 aa  53.9  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  25.39 
 
 		 378 aa  53.5  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4797  glycine oxidase ThiO  26.59 
 
 		 684 aa  53.1  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.937607  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  23.34 
 
 		 369 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4843  FAD dependent oxidoreductase  29.17 
 
 		 416 aa  53.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570392  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2335  FAD dependent oxidoreductase  36.61 
 
 		 338 aa  52.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0387808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  28.33 
 
 		 404 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  34.02 
 
 		 401 aa  53.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  23.34 
 
 		 369 aa  52.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5548  oxidoreductase  23.61 
 
 		 373 aa  52.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  33.94 
 
 		 666 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4780  D-amino-acid dehydrogenase  26.71 
 
 		 432 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.778742 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  24.89 
 
 		 387 aa  51.2  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1275  FAD dependent oxidoreductase  28.04 
 
 		 482 aa  50.8  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189046  normal  0.90193 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>