291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0139 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0139  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
348 aa  693    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.297271  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0146  FAD dependent oxidoreductase  56.14 
 
 
346 aa  349  5e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00168666  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2540  FAD dependent oxidoreductase  55.98 
 
 
353 aa  328  7e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0170113  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0880  oxidoreductase  55.69 
 
 
353 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0153  FAD dependent oxidoreductase  56.69 
 
 
352 aa  312  5.999999999999999e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2335  FAD dependent oxidoreductase  56.34 
 
 
338 aa  308  5.9999999999999995e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0387808  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0141  FAD dependent oxidoreductase  53.94 
 
 
353 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3154  FAD dependent oxidoreductase  39.4 
 
 
392 aa  219  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.358247 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4487  FAD dependent oxidoreductase  37.43 
 
 
376 aa  203  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2890  FAD dependent oxidoreductase  40.55 
 
 
392 aa  202  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0610119 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3358  oxidoreductase  39.46 
 
 
417 aa  179  7e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  27.86 
 
 
378 aa  102  8e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  29.32 
 
 
376 aa  99  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1956  oxidoreductase, FAD-binding  25.96 
 
 
363 aa  98.2  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.034563  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0136  FAD dependent oxidoreductase  26.11 
 
 
361 aa  97.8  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1624  FAD dependent oxidoreductase  25.96 
 
 
363 aa  98.2  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.909673  hitchhiker  0.0000164974 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  26.16 
 
 
367 aa  95.5  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  31.74 
 
 
385 aa  95.1  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  27.3 
 
 
361 aa  94  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  28.96 
 
 
382 aa  94  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  28.61 
 
 
375 aa  92.4  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  29.92 
 
 
404 aa  92.4  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  29.75 
 
 
398 aa  92.4  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  28.27 
 
 
378 aa  91.7  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  30.05 
 
 
384 aa  86.7  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2172  FAD dependent oxidoreductase  26.56 
 
 
380 aa  84.7  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  28.33 
 
 
405 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  26.84 
 
 
368 aa  84  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  24.36 
 
 
369 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0817  oxidoreductase, FAD-binding protein  27.22 
 
 
367 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  30.14 
 
 
379 aa  82.4  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  27.52 
 
 
374 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  25.28 
 
 
369 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  24.93 
 
 
369 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4841  FAD dependent oxidoreductase  35.71 
 
 
366 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.388467  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  35.71 
 
 
363 aa  81.6  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  25.91 
 
 
368 aa  80.9  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  25.28 
 
 
369 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  25.28 
 
 
369 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31544  predicted protein  31.6 
 
 
1033 aa  80.5  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  25.28 
 
 
369 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  28.25 
 
 
365 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0721  FAD dependent oxidoreductase  26.8 
 
 
367 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  25 
 
 
369 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  25 
 
 
369 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  27.7 
 
 
365 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  27.7 
 
 
365 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  28.22 
 
 
364 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  23.86 
 
 
369 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  24.15 
 
 
369 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2562  glycine oxidase ThiO  27.64 
 
 
331 aa  76.3  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.185136  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  28.22 
 
 
404 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  25.96 
 
 
411 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  20.49 
 
 
372 aa  74.3  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  26.78 
 
 
440 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2715  oxidoreductase, FAD-binding  34.81 
 
 
361 aa  73.6  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725073  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  29.19 
 
 
349 aa  73.9  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  22.51 
 
 
369 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3234  glycine oxidase ThiO  26.06 
 
 
372 aa  72.4  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6396  glycine oxidase ThiO  28.15 
 
 
316 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  24.63 
 
 
417 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  24.34 
 
 
417 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4550  glycine oxidase ThiO  27.71 
 
 
365 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  34.38 
 
 
410 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  36.11 
 
 
371 aa  69.3  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1893  FAD dependent oxidoreductase  27.37 
 
 
375 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1848  FAD dependent oxidoreductase  25.97 
 
 
373 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.344381  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  32.82 
 
 
401 aa  68.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2777  oxidoreductase, DadA family  26.11 
 
 
371 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.848486  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2742  DadA family oxidoreductase  26.54 
 
 
371 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00153462  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1426  FAD dependent oxidoreductase  28.3 
 
 
374 aa  67.8  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0313349  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0914  glycine oxidase ThiO  30.18 
 
 
325 aa  67.4  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.173839  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0445  thiamine biosynthesis oxidoreductase  25.37 
 
 
316 aa  67.8  0.0000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  27.35 
 
 
652 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  26.76 
 
 
375 aa  66.6  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  27.17 
 
 
372 aa  66.6  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  26.5 
 
 
375 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  25.9 
 
 
375 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2529  DadA family oxidoreductase  26.11 
 
 
371 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0933493  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2728  oxidoreductase, DadA family  26.11 
 
 
371 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000981681 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2715  DadA family oxidoreductase  26.11 
 
 
371 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1415  glycine oxidase ThiO  29.69 
 
 
377 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2192  FAD dependent oxidoreductase  26.63 
 
 
375 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2489  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  25.83 
 
 
371 aa  65.1  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000926626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2454  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.83 
 
 
371 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295637  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0964  glycine oxidase ThiO  26.67 
 
 
373 aa  64.7  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2569  oxidoreductase, DadA family  25.2 
 
 
371 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0599885 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2732  oxidoreductase, DadA family  25.2 
 
 
371 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  26.1 
 
 
375 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  23.14 
 
 
367 aa  63.5  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00611  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  27.59 
 
 
367 aa  63.5  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.741936  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2430  FAD dependent oxidoreductase  25.56 
 
 
371 aa  63.2  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0834847  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  30.08 
 
 
419 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2166  glycine oxidase ThiO  29.41 
 
 
337 aa  63.2  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.232699  normal  0.765835 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1380  glycine/D-amino acid oxidase family protein  26.9 
 
 
367 aa  62.8  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3748  glycine oxidase ThiO  27.87 
 
 
342 aa  62.4  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2483  glycine oxidase ThiO  28.53 
 
 
385 aa  62.4  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  31.3 
 
 
371 aa  61.6  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4173  glycine oxidase ThiO  28.11 
 
 
334 aa  62  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.269428 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1286  glycine oxidase ThiO  23.24 
 
 
356 aa  61.6  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>