106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0159 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A3336  FAD dependent oxidoreductase  87.61 
 
 		 461 aa  851    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0146  FAD dependent oxidoreductase  98.48 
 
 		 461 aa  934    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0159  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 461 aa  947    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.542085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4405  FAD dependent oxidoreductase  49.06 
 
 		 484 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1370  FAD dependent oxidoreductase  33.99 
 
 		 491 aa  245  9.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3371  FAD dependent oxidoreductase  29.3 
 
 		 488 aa  171  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0604216 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3505  FAD dependent oxidoreductase  27.15 
 
 		 465 aa  92  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  28.73 
 
 		 372 aa  83.2  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  26.49 
 
 		 382 aa  77  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  26.87 
 
 		 392 aa  68.6  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  24.87 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  26.45 
 
 		 384 aa  63.5  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  23.22 
 
 		 379 aa  62.8  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  26.42 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1932  FAD dependent oxidoreductase  24.77 
 
 		 410 aa  60.1  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0495  glycine oxidase ThiO  29.48 
 
 		 395 aa  59.7  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233014 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  25.13 
 
 		 388 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  21.03 
 
 		 372 aa  58.9  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  25.92 
 
 		 361 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0094  glycine oxidase ThiO  27.99 
 
 		 368 aa  57  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.883041  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3470  D-amino-acid dehydrogenase  26.52 
 
 		 458 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  25.27 
 
 		 401 aa  54.3  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2502  glycine oxidase ThiO  24.89 
 
 		 454 aa  54.3  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131028 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  26.54 
 
 		 376 aa  53.5  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1152  glycine oxidase ThiO  27.59 
 
 		 360 aa  53.9  0.000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  22.19 
 
 		 368 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  25.32 
 
 		 387 aa  53.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  24.87 
 
 		 363 aa  52.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0038  FAD dependent oxidoreductase  24.61 
 
 		 353 aa  52  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  24.23 
 
 		 365 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0284  glycine oxidase ThiO  23.56 
 
 		 334 aa  52.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0054  FAD dependent oxidoreductase  26.16 
 
 		 371 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327919 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31544  predicted protein  26.32 
 
 		 1033 aa  51.2  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7518  glycine oxidase ThiO  27.91 
 
 		 402 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316675  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  24.93 
 
 		 349 aa  50.4  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  23.1 
 
 		 375 aa  50.1  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  23.71 
 
 		 365 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3818  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  23.63 
 
 		 373 aa  49.7  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0193828  hitchhiker  0.0039585 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  23.45 
 
 		 365 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  25.41 
 
 		 375 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4550  glycine oxidase ThiO  23.67 
 
 		 365 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2715  oxidoreductase, FAD-binding  23.96 
 
 		 361 aa  47.8  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725073  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2890  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  35.05 
 
 		 621 aa  47.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.787622 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0895  FAD dependent oxidoreductase  24.58 
 
 		 365 aa  47.8  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00321446  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0208  glycine oxidase ThiO  22.76 
 
 		 334 aa  47.8  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1324  FAD dependent oxidoreductase  23.72 
 
 		 375 aa  47.8  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4797  glycine oxidase ThiO  22.46 
 
 		 684 aa  47.4  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.937607  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5526  D-amino acid dehydrogenase small subunit  23.71 
 
 		 434 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2431  FAD dependent oxidoreductase  26.94 
 
 		 367 aa  47.8  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.779457 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  25.93 
 
 		 411 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_004310  BR0217  D-amino acid oxidase family protein  22.76 
 
 		 334 aa  47.4  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  23.36 
 
 		 440 aa  47  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2536  FAD dependent oxidoreductase  22.56 
 
 		 364 aa  47  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  24.8 
 
 		 405 aa  47  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2498  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  25.62 
 
 		 355 aa  46.6  0.0008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.373577  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70040  D-amino acid dehydrogenase small subunit  23.46 
 
 		 432 aa  46.6  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0097  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  30 
 
 		 623 aa  46.6  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0795977 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0165  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  29.82 
 
 		 625 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3583  FAD dependent oxidoreductase  26.29 
 
 		 390 aa  45.8  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.445103 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6078  D-amino acid dehydrogenase small subunit  23.46 
 
 		 432 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1748  glycine oxidase  22.25 
 
 		 340 aa  46.6  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0438  glycine oxidase ThiO  22.25 
 
 		 340 aa  46.6  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017801  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1583  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  34 
 
 		 624 aa  45.8  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.149623 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  25.88 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1656  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  35 
 
 		 624 aa  46.6  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.715348  normal  0.183279 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1862  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  34 
 
 		 624 aa  46.2  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.167859 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3967  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.21 
 
 		 433 aa  46.2  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.194472  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18850  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  24.9 
 
 		 819 aa  46.6  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2701  D-amino-acid dehydrogenase  24.14 
 
 		 433 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0406  D-amino-acid dehydrogenase  24.14 
 
 		 433 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.696057  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28291  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  24.27 
 
 		 371 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1431  FAD dependent oxidoreductase  23.5 
 
 		 394 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0107924 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00501  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  22.12 
 
 		 369 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0176  FAD dependent oxidoreductase  34.31 
 
 		 373 aa  45.8  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4708  D-amino-acid dehydrogenase  23.69 
 
 		 416 aa  45.8  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0268741 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  22.75 
 
 		 652 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4390  glycine oxidase ThiO  25.27 
 
 		 361 aa  45.8  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3977  FAD dependent oxidoreductase  23.26 
 
 		 377 aa  45.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3643  FAD dependent oxidoreductase  31.91 
 
 		 381 aa  45.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6079  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.83 
 
 		 421 aa  45.1  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3319  FAD dependent oxidoreductase  31.91 
 
 		 381 aa  45.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1456  glycine oxidase ThiO  27.01 
 
 		 389 aa  44.7  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.307588  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0721  FAD dependent oxidoreductase  23.56 
 
 		 367 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2862  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  23.5 
 
 		 394 aa  44.3  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0385  D-amino-acid dehydrogenase  25 
 
 		 433 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3856  sarcosine oxidase subunit beta  26.48 
 
 		 408 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.014492  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  24.27 
 
 		 378 aa  44.3  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00481  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  21.63 
 
 		 369 aa  43.9  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.254103  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3842  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.06 
 
 		 436 aa  44.3  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.190955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03073  D-amino acid dehydrogenase small subunit  21.58 
 
 		 428 aa  43.9  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5918  glycine oxidase ThiO  24.05 
 
 		 330 aa  43.9  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47980  D-amino acid dehydrogenase small subunit  23.5 
 
 		 432 aa  43.9  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23290  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  27.98 
 
 		 420 aa  43.9  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3113  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.96 
 
 		 436 aa  43.9  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  23.93 
 
 		 666 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1005  hydroxyglutarate oxidase  24.22 
 
 		 410 aa  43.5  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.127914  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1275  FAD dependent oxidoreductase  26.62 
 
 		 482 aa  43.5  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189046  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1380  glycine/D-amino acid oxidase family protein  21.24 
 
 		 367 aa  43.1  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00611  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  22.71 
 
 		 367 aa  43.5  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.741936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0947  hydroxyglutarate oxidase  24.22 
 
 		 410 aa  43.5  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>