100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1370 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1370  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 491 aa  1011    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3371  FAD dependent oxidoreductase  40.18 
 
 		 488 aa  271  2e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0604216 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3336  FAD dependent oxidoreductase  34.86 
 
 		 461 aa  253  8.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0159  FAD dependent oxidoreductase  33.99 
 
 		 461 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.542085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0146  FAD dependent oxidoreductase  33.99 
 
 		 461 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4405  FAD dependent oxidoreductase  32.77 
 
 		 484 aa  237  5.0000000000000005e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3505  FAD dependent oxidoreductase  29.06 
 
 		 465 aa  107  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604467 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  26.37 
 
 		 372 aa  83.6  0.000000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  29.56 
 
 		 384 aa  74.7  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19131  NAD binding site:D-amino acid oxidase  23.12 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.119558  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  29.34 
 
 		 361 aa  67.8  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  24.94 
 
 		 382 aa  67  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0964  glycine oxidase ThiO  28.74 
 
 		 373 aa  66.2  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  25.56 
 
 		 374 aa  66.6  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18941  NAD binding site:D-amino acid oxidase  21.81 
 
 		 360 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4841  FAD dependent oxidoreductase  28.87 
 
 		 366 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.388467  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  29.29 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  28.87 
 
 		 364 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2536  FAD dependent oxidoreductase  28.45 
 
 		 364 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  27.27 
 
 		 405 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  28.07 
 
 		 372 aa  61.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3977  FAD dependent oxidoreductase  25.84 
 
 		 377 aa  60.8  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  29.11 
 
 		 388 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  24.74 
 
 		 369 aa  59.7  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  24.74 
 
 		 369 aa  59.7  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  23.62 
 
 		 369 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4550  glycine oxidase ThiO  28.45 
 
 		 365 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1796  D-amino acid oxidase  21.81 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  24.22 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  24.54 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  23.96 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  26.28 
 
 		 363 aa  58.2  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  24.02 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  23.76 
 
 		 369 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  26.56 
 
 		 365 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0020  glycine oxidase ThiO  24.02 
 
 		 355 aa  56.2  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.504997 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  36.43 
 
 		 404 aa  55.8  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  24.02 
 
 		 369 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  23.96 
 
 		 369 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 365 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  26.06 
 
 		 375 aa  55.1  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  32.81 
 
 		 391 aa  55.1  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  24.09 
 
 		 369 aa  55.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  26.93 
 
 		 375 aa  55.1  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0750  glycine oxidase ThiO  24.29 
 
 		 365 aa  54.7  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  25.71 
 
 		 368 aa  53.9  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0495  glycine oxidase ThiO  26.68 
 
 		 395 aa  53.9  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233014 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  27.45 
 
 		 392 aa  53.5  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0038  FAD dependent oxidoreductase  24.51 
 
 		 353 aa  53.5  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  26.56 
 
 		 365 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2166  glycine oxidase ThiO  24.16 
 
 		 337 aa  53.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.232699  normal  0.765835 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2715  oxidoreductase, FAD-binding  25.19 
 
 		 361 aa  52.8  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725073  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  23.68 
 
 		 367 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  25.07 
 
 		 410 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  28.46 
 
 		 376 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  23.06 
 
 		 379 aa  50.4  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2597  FAD dependent oxidoreductase  25.52 
 
 		 415 aa  50.4  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0721  FAD dependent oxidoreductase  26.36 
 
 		 367 aa  50.4  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23290  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  25.42 
 
 		 420 aa  50.4  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  25.31 
 
 		 440 aa  50.1  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2891  glycine oxidase ThiO  22.43 
 
 		 338 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.894969  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1415  glycine oxidase ThiO  28.37 
 
 		 377 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  31.07 
 
 		 371 aa  49.3  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  23.51 
 
 		 371 aa  49.3  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  24.36 
 
 		 367 aa  48.9  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  24.88 
 
 		 386 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  26.87 
 
 		 375 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2483  glycine oxidase ThiO  27.56 
 
 		 385 aa  48.5  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  32.49 
 
 		 401 aa  48.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0570  FAD dependent oxidoreductase  21.7 
 
 		 353 aa  48.5  0.0003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4708  D-amino-acid dehydrogenase  25.54 
 
 		 416 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0268741 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0139  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 		 348 aa  47.8  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.297271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  25.44 
 
 		 411 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2464  FAD dependent oxidoreductase  26.36 
 
 		 338 aa  47.4  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.750874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  26.48 
 
 		 652 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2074  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.46 
 
 		 422 aa  47.4  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00739126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  25.56 
 
 		 349 aa  47  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00481  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  24.27 
 
 		 369 aa  47  0.0008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.254103  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5125  FAD dependent oxidoreductase  23.7 
 
 		 378 aa  47  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.78521  normal  0.0962359 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0817  oxidoreductase, FAD-binding protein  28.69 
 
 		 367 aa  47  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2797  d-amino-acid dehydrogenase  31.32 
 
 		 419 aa  46.6  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337327  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1380  glycine/D-amino acid oxidase family protein  23.16 
 
 		 367 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28291  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  41.79 
 
 		 371 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5421  FAD dependent oxidoreductase  25.3 
 
 		 378 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594548  hitchhiker  0.00675978 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0048  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  23.79 
 
 		 369 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4831  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.77 
 
 		 416 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0419861  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  26.5 
 
 		 400 aa  45.8  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00501  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  23.53 
 
 		 369 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1523  hypothetical protein  23.34 
 
 		 356 aa  44.3  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1414  glycine oxidase ThiO  26.76 
 
 		 339 aa  43.9  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4487  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 376 aa  44.3  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0867  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.77 
 
 		 429 aa  43.9  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.872467  normal  0.695937 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1456  glycine oxidase ThiO  27.54 
 
 		 389 aa  43.9  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.307588  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1813  FAD dependent oxidoreductase  25.77 
 
 		 417 aa  43.5  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2781  glycine oxidase ThiO  23.85 
 
 		 450 aa  43.5  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.207412  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0147  FAD dependent oxidoreductase  22.11 
 
 		 350 aa  43.5  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0284  glycine oxidase ThiO  22.46 
 
 		 334 aa  43.5  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  21.74 
 
 		 401 aa  43.5  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4173  glycine oxidase ThiO  26.94 
 
 		 334 aa  43.5  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.269428 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  31.19 
 
 		 360 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>