124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4405 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4405  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 484 aa  1000    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3336  FAD dependent oxidoreductase  49.9 
 
 		 461 aa  462  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0159  FAD dependent oxidoreductase  49.69 
 
 		 461 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.542085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0146  FAD dependent oxidoreductase  49.48 
 
 		 461 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1370  FAD dependent oxidoreductase  32.77 
 
 		 491 aa  236  9e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3371  FAD dependent oxidoreductase  29.93 
 
 		 488 aa  170  5e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0604216 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3505  FAD dependent oxidoreductase  25.81 
 
 		 465 aa  91.7  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604467 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0495  glycine oxidase ThiO  27.38 
 
 		 395 aa  80.1  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233014 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  27.39 
 
 		 372 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  26.18 
 
 		 382 aa  72  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  27.46 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  25.98 
 
 		 375 aa  68.2  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  27.18 
 
 		 361 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  26.6 
 
 		 384 aa  63.9  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  25.88 
 
 		 375 aa  63.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  23.32 
 
 		 367 aa  62.4  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03073  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27 
 
 		 428 aa  60.1  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  29.43 
 
 		 365 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  27.23 
 
 		 391 aa  58.9  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  29.79 
 
 		 365 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  29.47 
 
 		 365 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1094  FAD dependent oxidoreductase  24.91 
 
 		 421 aa  57  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.293126  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  22.74 
 
 		 388 aa  56.6  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  25.1 
 
 		 379 aa  56.6  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2742  DadA family oxidoreductase  23.02 
 
 		 371 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00153462  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2529  DadA family oxidoreductase  23.02 
 
 		 371 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0933493  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2715  DadA family oxidoreductase  23.02 
 
 		 371 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  26.44 
 
 		 375 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2728  oxidoreductase, DadA family  23.02 
 
 		 371 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000981681 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2502  glycine oxidase ThiO  25.12 
 
 		 454 aa  55.1  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131028 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2489  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  23.02 
 
 		 371 aa  55.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000926626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2454  D-amino acid dehydrogenase small subunit  23.02 
 
 		 371 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295637  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  25.19 
 
 		 404 aa  54.7  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  24.3 
 
 		 405 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2122  D-amino-acid dehydrogenase  27.17 
 
 		 421 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17481  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0750  glycine oxidase ThiO  23.33 
 
 		 365 aa  55.1  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2777  oxidoreductase, DadA family  23.27 
 
 		 371 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.848486  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0935  FAD dependent oxidoreductase  25.53 
 
 		 376 aa  54.7  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.311284  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  23.13 
 
 		 417 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0817  oxidoreductase, FAD-binding protein  26.83 
 
 		 367 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2304  D-amino-acid dehydrogenase  24.72 
 
 		 421 aa  53.9  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.018021 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1286  glycine oxidase ThiO  22.59 
 
 		 356 aa  53.9  0.000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  24.18 
 
 		 666 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  23.34 
 
 		 417 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70040  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.77 
 
 		 432 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  25.12 
 
 		 440 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  28.67 
 
 		 363 aa  53.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0721  FAD dependent oxidoreductase  24.86 
 
 		 367 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2430  FAD dependent oxidoreductase  22.28 
 
 		 371 aa  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0834847  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  24.35 
 
 		 368 aa  51.6  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0146  glycine oxidase ThiO  26.12 
 
 		 376 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473112  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2732  oxidoreductase, DadA family  22.77 
 
 		 371 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  21.07 
 
 		 369 aa  52  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  28.18 
 
 		 364 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6078  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.38 
 
 		 432 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2569  oxidoreductase, DadA family  22.77 
 
 		 371 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0599885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3219  thiazole synthase  22.96 
 
 		 652 aa  50.4  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  20.81 
 
 		 369 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3748  glycine oxidase ThiO  25.79 
 
 		 342 aa  50.4  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  25.75 
 
 		 392 aa  50.1  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2746  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.54 
 
 		 434 aa  50.4  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0984937  decreased coverage  0.0000603863 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  23.91 
 
 		 666 aa  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  22.17 
 
 		 419 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1456  glycine oxidase ThiO  25.85 
 
 		 389 aa  49.3  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.307588  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  23.08 
 
 		 360 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2781  glycine oxidase ThiO  25.37 
 
 		 450 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.207412  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  25.99 
 
 		 371 aa  49.7  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004326  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.51 
 
 		 418 aa  49.7  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1997  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.35 
 
 		 434 aa  49.7  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.990336  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2361  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.35 
 
 		 434 aa  49.7  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0438978  normal  0.320379 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2107  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.35 
 
 		 434 aa  49.7  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.625399  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  23.85 
 
 		 652 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1963  FAD dependent oxidoreductase  30.61 
 
 		 365 aa  49.3  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.416429  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  28.46 
 
 		 410 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0157  glycine oxidase ThiO  26.12 
 
 		 376 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0813  FAD dependent oxidoreductase  26.98 
 
 		 441 aa  48.5  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4550  glycine oxidase ThiO  24.64 
 
 		 365 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4821  D-amino-acid dehydrogenase  23.45 
 
 		 419 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052408 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  27.89 
 
 		 349 aa  48.5  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0235  D-amino acid dehydrogenase small subunit  24.65 
 
 		 433 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3545  D-amino acid dehydrogenase  28.89 
 
 		 462 aa  47.8  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  24.63 
 
 		 411 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5270  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.76 
 
 		 434 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0829502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0964  glycine oxidase ThiO  24.93 
 
 		 373 aa  47.8  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  20.81 
 
 		 369 aa  47.8  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0136  FAD dependent oxidoreductase  23.18 
 
 		 361 aa  47.4  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1848  FAD dependent oxidoreductase  24.46 
 
 		 373 aa  47  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.344381  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5322  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.76 
 
 		 434 aa  47  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116126 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4841  FAD dependent oxidoreductase  25.37 
 
 		 366 aa  46.2  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.388467  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1796  D-amino acid oxidase  21.65 
 
 		 360 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229908  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3384  hypothetical protein  21.26 
 
 		 705 aa  46.6  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2363  D-amino acid dehydrogenase small subunit  23.19 
 
 		 432 aa  46.6  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.28713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5180  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.38 
 
 		 434 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0763537 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0101  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  24.3 
 
 		 433 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2464  FAD dependent oxidoreductase  24.91 
 
 		 338 aa  45.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.750874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3230  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.78 
 
 		 657 aa  45.8  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  27.23 
 
 		 386 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0200  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.38 
 
 		 433 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229652 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1924  D-amino acid dehydrogenase small subunit  23.68 
 
 		 435 aa  45.4  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.385338  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1818  D-amino-acid dehydrogenase  25 
 
 		 419 aa  45.1  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>