More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_2240 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_2048  putative tryptophan halogenase  99.38 
 
 
480 aa  984    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826968  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1005  FAD binding domain-containing protein  99.79 
 
 
480 aa  987    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0347975  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2240  alkylhalidase  100 
 
 
480 aa  989    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345155  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  93.54 
 
 
480 aa  931    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2103  putative tryptophan halogenase  99.58 
 
 
480 aa  986    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0674783  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  46.36 
 
 
470 aa  405  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  46.01 
 
 
491 aa  396  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  41.65 
 
 
506 aa  353  2.9999999999999997e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10884  conserved hypothetical protein  35.39 
 
 
647 aa  252  1e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  37.82 
 
 
413 aa  227  4e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  36.39 
 
 
495 aa  226  9e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2119  tryptophan halogenase  36.48 
 
 
507 aa  212  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671126  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  34.29 
 
 
441 aa  196  7e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01623  conserved hypothetical protein  31.97 
 
 
476 aa  187  3e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.282796 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  34.77 
 
 
439 aa  180  4e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  34.77 
 
 
439 aa  180  4e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  35.29 
 
 
455 aa  178  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  34.02 
 
 
444 aa  177  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  37.17 
 
 
455 aa  176  9e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  36.62 
 
 
445 aa  173  5e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  32.52 
 
 
444 aa  172  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  34.76 
 
 
449 aa  171  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  34.53 
 
 
461 aa  171  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  31.32 
 
 
422 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3116  tryptophan halogenase  33.41 
 
 
417 aa  162  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3311  tryptophan halogenase  34.18 
 
 
449 aa  159  9e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  32.07 
 
 
429 aa  159  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5510  tryptophan halogenase  31.65 
 
 
587 aa  158  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  34.13 
 
 
415 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0428  monooxygenase, FAD-binding  31.3 
 
 
415 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00208516  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  31.83 
 
 
444 aa  156  6e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  31.36 
 
 
429 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  31.93 
 
 
409 aa  154  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  31.65 
 
 
424 aa  154  4e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  31.11 
 
 
429 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  31.11 
 
 
429 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  31.94 
 
 
435 aa  153  7e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  31.11 
 
 
429 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  31.06 
 
 
435 aa  152  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0331  monooxygenase, FAD-binding  31.94 
 
 
435 aa  152  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0428  FAD dependent oxidoreductase  34.64 
 
 
410 aa  151  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25324  normal  0.196339 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03920  Monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:Tryptophanhalogenase  30.65 
 
 
415 aa  150  6e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.117201  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5621  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  32.89 
 
 
409 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4378  FAD-binding protein  28.24 
 
 
436 aa  147  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2003  tryptophan halogenase  30.2 
 
 
415 aa  147  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.923769 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004059  FAD-binding protein inferred for ABFAE pathway  31.52 
 
 
414 aa  146  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2108  FAD dependent oxidoreductase  29.55 
 
 
413 aa  143  8e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  32.06 
 
 
409 aa  143  8e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3898  tryptophan halogenase  29.59 
 
 
429 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3521  tryptophan halogenase  29.95 
 
 
424 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.956189  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2065  tryptophan halogenase  29.34 
 
 
439 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  31.68 
 
 
416 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3913  monooxygenase FAD-binding  29.77 
 
 
416 aa  141  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445041  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1497  tryptophan halogenase  33.94 
 
 
406 aa  140  6e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.756039  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4606  tryptophan halogenase  28.83 
 
 
420 aa  138  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2822  flavoprotein/dehydrogenase  28.12 
 
 
413 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1863  tryptophan halogenase  28.1 
 
 
415 aa  136  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  31.28 
 
 
419 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0315  tryptophan halogenase  29.23 
 
 
420 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  31.28 
 
 
419 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0135  tryptophan halogenase  25.93 
 
 
417 aa  133  6e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4091  tryptophan halogenase  30.4 
 
 
415 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1615  dehydrogenase  30.3 
 
 
405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3616  tryptophan halogenase  30.38 
 
 
415 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.190224  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3158  tryptophan halogenase  30.58 
 
 
584 aa  127  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000257719 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  23.53 
 
 
455 aa  124  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2756  tryptophan halogenase  30.94 
 
 
618 aa  124  4e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00759  putative oxidoreductase protein  29.68 
 
 
419 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  0.0681702 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2756  FAD dependent oxidoreductase  29.39 
 
 
417 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.471979  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3046  tryptophan halogenase  30.77 
 
 
414 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354433  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0945  putative oxidoreductase  29.85 
 
 
414 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.183705  normal  0.443912 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1110  tryptophan halogenase  27.76 
 
 
416 aa  104  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  26.89 
 
 
445 aa  98.2  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2083  FAD dependent oxidoreductase  25.59 
 
 
344 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4493  monooxygenase FAD-binding  25.75 
 
 
488 aa  90.9  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575117  normal  0.0380746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  24.32 
 
 
425 aa  88.2  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  25.22 
 
 
387 aa  87.8  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  28.86 
 
 
376 aa  87  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  26.38 
 
 
423 aa  86.3  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  24.94 
 
 
424 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  27.25 
 
 
398 aa  85.1  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  28.8 
 
 
419 aa  84.7  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  24.83 
 
 
434 aa  84.3  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  26.27 
 
 
423 aa  81.6  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01926  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 
335 aa  80.9  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0983003 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  25.65 
 
 
423 aa  80.9  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  25.21 
 
 
457 aa  80.9  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2641  monooxygenase, FAD-binding  28.65 
 
 
401 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  26.37 
 
 
431 aa  77.4  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  24.21 
 
 
418 aa  77  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  25.24 
 
 
382 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  25.08 
 
 
434 aa  75.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2826  geranylgeranyl reductase  30.21 
 
 
443 aa  73.9  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0858816 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  27.64 
 
 
398 aa  73.6  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  25.77 
 
 
431 aa  73.2  0.000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3131  geranylgeranyl reductase  34.13 
 
 
444 aa  73.2  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  23.03 
 
 
384 aa  72.8  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  33.54 
 
 
425 aa  72  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  24.7 
 
 
376 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  27.27 
 
 
413 aa  71.2  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>