289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4487 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4487  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 
385 aa  749    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1150  monooxygenase FAD-binding protein  52.53 
 
 
397 aa  361  1e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.862466  normal  0.995827 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3959  monooxygenase FAD-binding  41.07 
 
 
411 aa  255  8e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2934  monooxygenase, FAD-binding  41.25 
 
 
402 aa  241  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2294  monooxygenase, FAD-binding  40.87 
 
 
407 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.539275  hitchhiker  0.00707471 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4239  monooxygenase FAD-binding  43.8 
 
 
407 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3185  monooxygenase FAD-binding  37.2 
 
 
442 aa  207  3e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304651  hitchhiker  0.000303065 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1725  monooxygenase, FAD-binding  37.14 
 
 
442 aa  206  7e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.847315  normal  0.600174 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2577  monooxygenase FAD-binding  40.31 
 
 
397 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.205259 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3109  monooxygenase FAD-binding  37.75 
 
 
444 aa  194  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2256  FAD-binding monooxygenase  41.39 
 
 
399 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2944  monooxygenase, FAD-binding protein  32.08 
 
 
436 aa  110  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  32.08 
 
 
441 aa  100  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00330  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  29.29 
 
 
405 aa  88.2  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1178  monooxygenase FAD-binding protein  33.65 
 
 
436 aa  88.6  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.195738  normal  0.0113639 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4211  monooxygenase FAD-binding  29.38 
 
 
429 aa  86.3  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747744  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  28.84 
 
 
398 aa  83.6  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03119  putative transmembrane protein  30.75 
 
 
435 aa  83.2  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.886572  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  26.99 
 
 
455 aa  76.6  0.0000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  25.56 
 
 
495 aa  76.3  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  28.06 
 
 
376 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  25.6 
 
 
416 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  28.48 
 
 
413 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3882  monooxygenase FAD-binding protein  23.44 
 
 
410 aa  73.6  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  26.33 
 
 
409 aa  73.2  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3116  tryptophan halogenase  26.16 
 
 
417 aa  71.2  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5129  monooxygenase FAD-binding  30.16 
 
 
411 aa  70.5  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  25.63 
 
 
419 aa  70.5  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  29.33 
 
 
398 aa  70.5  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  25.63 
 
 
419 aa  70.5  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2603  monooxygenase FAD-binding  28.09 
 
 
377 aa  68.9  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.425135  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2065  tryptophan halogenase  28.15 
 
 
439 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  23.58 
 
 
406 aa  67  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  26.15 
 
 
470 aa  66.6  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3556  FAD dependent oxidoreductase  34.66 
 
 
432 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  25.62 
 
 
408 aa  65.9  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  23.53 
 
 
409 aa  65.1  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5621  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  25.39 
 
 
409 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2763  ubiquinone biosynthesis hydroxylase, UbiH/UbiF/VisC/COQ6  28.34 
 
 
406 aa  64.3  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1497  tryptophan halogenase  26.52 
 
 
406 aa  63.9  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.756039  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0437  hypothetical protein  27.7 
 
 
423 aa  63.9  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3913  monooxygenase FAD-binding  24.3 
 
 
416 aa  63.2  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445041  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2049  hypothetical protein  25.57 
 
 
409 aa  63.2  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961619  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  24.26 
 
 
444 aa  63.2  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  32.8 
 
 
414 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  33.33 
 
 
434 aa  62.4  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  26.38 
 
 
395 aa  62.8  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004059  FAD-binding protein inferred for ABFAE pathway  23.24 
 
 
414 aa  61.6  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  23.77 
 
 
491 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1898  monooxygenase FAD-binding protein  28.99 
 
 
391 aa  61.6  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  32.01 
 
 
413 aa  62  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0945  putative oxidoreductase  25.93 
 
 
414 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.183705  normal  0.443912 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3046  tryptophan halogenase  25.93 
 
 
414 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354433  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  26.98 
 
 
444 aa  60.8  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0714  geranylgeranyl reductase  26.89 
 
 
415 aa  60.8  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2848  monooxygenase FAD-binding  26.17 
 
 
404 aa  60.5  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2119  tryptophan halogenase  26.71 
 
 
507 aa  60.5  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671126  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_003296  RS00759  putative oxidoreductase protein  26.11 
 
 
419 aa  60.1  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  0.0681702 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  36.76 
 
 
425 aa  60.1  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1109  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  25.84 
 
 
388 aa  59.7  0.00000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.666485  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  28.16 
 
 
445 aa  59.7  0.00000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0428  monooxygenase, FAD-binding  24.76 
 
 
415 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00208516  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  24.45 
 
 
415 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0075  hypothetical protein  24.13 
 
 
404 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  25.53 
 
 
439 aa  58.9  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  25.53 
 
 
439 aa  58.9  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3972  monooxygenase FAD-binding  27.38 
 
 
416 aa  58.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0762736  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0428  FAD dependent oxidoreductase  26.33 
 
 
410 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25324  normal  0.196339 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  27.38 
 
 
398 aa  57  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  35.33 
 
 
384 aa  57  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  26.11 
 
 
449 aa  57  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  27.78 
 
 
457 aa  57  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  22.66 
 
 
370 aa  56.6  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4276  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  31.61 
 
 
434 aa  56.6  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  23.6 
 
 
390 aa  56.2  0.0000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01668  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  31.53 
 
 
429 aa  56.2  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2756  FAD dependent oxidoreductase  28.01 
 
 
417 aa  56.2  0.0000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.471979  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01657  hypothetical protein  31.53 
 
 
429 aa  56.2  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1943  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  31.12 
 
 
429 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.633206  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  34.9 
 
 
409 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2299  geranylgeranyl reductase  24.74 
 
 
374 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.650791  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1503  hypothetical protein  24.59 
 
 
405 aa  55.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1902  hypothetical protein  31.12 
 
 
429 aa  55.5  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2674  FAD dependent oxidoreductase  32.14 
 
 
443 aa  55.8  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.680206  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2416  hypothetical protein  31.03 
 
 
429 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  32.76 
 
 
435 aa  54.7  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  26.43 
 
 
407 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  35.67 
 
 
431 aa  55.5  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1916  hypothetical protein  31.12 
 
 
429 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0064  geranylgeranyl reductase  26.35 
 
 
373 aa  54.3  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.535363  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1932  hypothetical protein  31.03 
 
 
429 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0346212 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1496  hypothetical protein  31.53 
 
 
429 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.403861 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2174  hypothetical protein  27.55 
 
 
405 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  32.37 
 
 
403 aa  54.7  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  25.23 
 
 
461 aa  54.3  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2544  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  30.19 
 
 
407 aa  53.9  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0687247 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  37.79 
 
 
419 aa  54.3  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2315  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  24.79 
 
 
436 aa  53.9  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0377746  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  31.67 
 
 
424 aa  53.5  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10540  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase, FixC  25.69 
 
 
432 aa  53.9  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106956  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>