More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3109 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3109  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 		 444 aa  905    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3185  monooxygenase FAD-binding  66.06 
 
 		 442 aa  584  1e-166  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304651  hitchhiker  0.000303065 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1725  monooxygenase, FAD-binding  66.29 
 
 		 442 aa  580  1e-164  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.847315  normal  0.600174 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2934  monooxygenase, FAD-binding  39.42 
 
 		 402 aa  237  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2294  monooxygenase, FAD-binding  39.04 
 
 		 407 aa  226  8e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.539275  hitchhiker  0.00707471 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3959  monooxygenase FAD-binding  38.98 
 
 		 411 aa  217  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1150  monooxygenase FAD-binding protein  36.86 
 
 		 397 aa  198  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.862466  normal  0.995827 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4487  monooxygenase FAD-binding  38.85 
 
 		 385 aa  177  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4239  monooxygenase FAD-binding  37.46 
 
 		 407 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2577  monooxygenase FAD-binding  33.5 
 
 		 397 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.205259 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2256  FAD-binding monooxygenase  36.49 
 
 		 399 aa  137  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  32.6 
 
 		 441 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2944  monooxygenase, FAD-binding protein  26.44 
 
 		 436 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  29.84 
 
 		 413 aa  96.3  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  28.24 
 
 		 398 aa  88.6  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  27.3 
 
 		 423 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  26.52 
 
 		 423 aa  84.7  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  27.32 
 
 		 416 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  25.23 
 
 		 423 aa  84  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  26.61 
 
 		 461 aa  82.8  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  27.85 
 
 		 430 aa  82  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  26.2 
 
 		 376 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4211  monooxygenase FAD-binding  28.27 
 
 		 429 aa  80.5  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747744  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  28.33 
 
 		 495 aa  80.1  0.00000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1178  monooxygenase FAD-binding protein  29.61 
 
 		 436 aa  79.3  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.195738  normal  0.0113639 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1497  tryptophan halogenase  27.19 
 
 		 406 aa  77.8  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.756039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  27.52 
 
 		 440 aa  78.2  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  26.27 
 
 		 455 aa  77  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  26.38 
 
 		 425 aa  74.7  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  32.8 
 
 		 424 aa  72.4  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  24.2 
 
 		 429 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3653  monooxygenase FAD-binding  28.81 
 
 		 411 aa  72.4  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  27.34 
 
 		 431 aa  70.9  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  29.38 
 
 		 398 aa  71.2  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  24.71 
 
 		 429 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  25.73 
 
 		 368 aa  70.5  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  29.84 
 
 		 434 aa  70.1  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  24.71 
 
 		 429 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  24.55 
 
 		 439 aa  70.1  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  24.71 
 
 		 429 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  24.55 
 
 		 439 aa  70.1  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00759  putative oxidoreductase protein  25.37 
 
 		 419 aa  70.1  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  0.0681702 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  28 
 
 		 434 aa  69.7  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  25.85 
 
 		 419 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1615  dehydrogenase  24.12 
 
 		 405 aa  69.7  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  25.85 
 
 		 419 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  25.29 
 
 		 445 aa  69.3  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  24.71 
 
 		 429 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  21.71 
 
 		 444 aa  68.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  24.72 
 
 		 435 aa  67.8  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  28.33 
 
 		 393 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3131  geranylgeranyl reductase  27.69 
 
 		 444 aa  67.8  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  25.42 
 
 		 424 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  26.43 
 
 		 415 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  26 
 
 		 419 aa  67  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  27.78 
 
 		 393 aa  67  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  26.48 
 
 		 418 aa  66.6  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  23.29 
 
 		 455 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  25.59 
 
 		 431 aa  66.6  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  24.77 
 
 		 449 aa  66.6  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0428  monooxygenase, FAD-binding  25.55 
 
 		 415 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00208516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  24.18 
 
 		 444 aa  65.9  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  25.54 
 
 		 426 aa  66.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3046  tryptophan halogenase  25.44 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354433  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  28.44 
 
 		 413 aa  66.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  23.6 
 
 		 435 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  30.37 
 
 		 457 aa  65.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3116  tryptophan halogenase  25.71 
 
 		 417 aa  64.7  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  23.3 
 
 		 435 aa  64.7  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  27.99 
 
 		 378 aa  64.3  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2756  FAD dependent oxidoreductase  27.81 
 
 		 417 aa  64.3  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.471979  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5129  monooxygenase FAD-binding  26.05 
 
 		 411 aa  64.3  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0945  putative oxidoreductase  23.75 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.183705  normal  0.443912 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004059  FAD-binding protein inferred for ABFAE pathway  22.79 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2826  geranylgeranyl reductase  27.45 
 
 		 443 aa  63.9  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0858816 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3477  dehydrogenase (flavoprotein)  24.03 
 
 		 356 aa  63.9  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00015718  normal  0.0486362 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2626  monooxygenase FAD-binding  24.46 
 
 		 356 aa  63.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3913  monooxygenase FAD-binding  26.22 
 
 		 416 aa  63.2  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  26.3 
 
 		 470 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  25.7 
 
 		 480 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  33.15 
 
 		 375 aa  62.8  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0331  monooxygenase, FAD-binding  23.3 
 
 		 435 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2119  tryptophan halogenase  25.94 
 
 		 507 aa  62.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671126  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4378  FAD-binding protein  23.6 
 
 		 436 aa  62.4  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00330  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  26.6 
 
 		 405 aa  62.4  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  28 
 
 		 455 aa  62  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07370  geranylgeranyl reductase family protein  27.41 
 
 		 431 aa  61.6  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0284516 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  26.49 
 
 		 430 aa  61.2  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  25.08 
 
 		 491 aa  61.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3106  FAD dependent oxidoreductase  30.53 
 
 		 472 aa  60.8  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000790545 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  25.67 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09250  flavin-dependent dehydrogenase  31.07 
 
 		 442 aa  60.5  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.696714 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4276  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  32.07 
 
 		 434 aa  60.1  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1397  hypothetical protein  29.32 
 
 		 429 aa  60.1  0.00000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.222986  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1822  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  31.05 
 
 		 431 aa  59.7  0.00000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154  normal  0.170222 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2108  FAD dependent oxidoreductase  21.47 
 
 		 413 aa  59.3  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  25.21 
 
 		 424 aa  59.7  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1826  geranylgeranyl reductase  29.49 
 
 		 393 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1873  geranylgeranyl reductase  29.49 
 
 		 393 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0087  putative oxidoreductase FixC  29.79 
 
 		 428 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.458255 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>