148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2294 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2294  monooxygenase, FAD-binding  100 
 
 		 407 aa  818    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.539275  hitchhiker  0.00707471 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2934  monooxygenase, FAD-binding  56.09 
 
 		 402 aa  430  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3959  monooxygenase FAD-binding  53.9 
 
 		 411 aa  418  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1150  monooxygenase FAD-binding protein  41.62 
 
 		 397 aa  258  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.862466  normal  0.995827 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3185  monooxygenase FAD-binding  39.02 
 
 		 442 aa  248  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304651  hitchhiker  0.000303065 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1725  monooxygenase, FAD-binding  38.78 
 
 		 442 aa  247  3e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.847315  normal  0.600174 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3109  monooxygenase FAD-binding  39.04 
 
 		 444 aa  230  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4487  monooxygenase FAD-binding  41.3 
 
 		 385 aa  228  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2577  monooxygenase FAD-binding  41.31 
 
 		 397 aa  206  9e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.205259 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4239  monooxygenase FAD-binding  40.36 
 
 		 407 aa  200  3e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2256  FAD-binding monooxygenase  43.82 
 
 		 399 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2944  monooxygenase, FAD-binding protein  28.71 
 
 		 436 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1178  monooxygenase FAD-binding protein  32.7 
 
 		 436 aa  82.4  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.195738  normal  0.0113639 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  28.73 
 
 		 495 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  28.29 
 
 		 413 aa  82  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  27.2 
 
 		 441 aa  74.3  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  26.97 
 
 		 398 aa  74.3  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5129  monooxygenase FAD-binding  26.91 
 
 		 411 aa  73.9  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2119  tryptophan halogenase  28.66 
 
 		 507 aa  70.9  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671126  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3116  tryptophan halogenase  26.9 
 
 		 417 aa  69.3  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  26.6 
 
 		 455 aa  67.8  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  26.01 
 
 		 470 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  27.41 
 
 		 491 aa  63.5  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  30.17 
 
 		 398 aa  63.2  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  26.14 
 
 		 403 aa  62  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5621  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  25.25 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  24.15 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4211  monooxygenase FAD-binding  27.74 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747744  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00759  putative oxidoreductase protein  23.14 
 
 		 419 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  0.0681702 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  24.14 
 
 		 419 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  25.13 
 
 		 376 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1497  tryptophan halogenase  26.28 
 
 		 406 aa  59.3  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.756039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  24.14 
 
 		 419 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  25.51 
 
 		 409 aa  58.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  22.05 
 
 		 422 aa  58.5  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  26.11 
 
 		 398 aa  58.9  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0084  putative oxidoreductase FixC  31.38 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0083  putative oxidoreductase FixC  30.85 
 
 		 428 aa  57  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0083  putative oxidoreductase FixC  30.32 
 
 		 428 aa  56.6  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.715205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0428  monooxygenase, FAD-binding  24.26 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00208516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  26.26 
 
 		 449 aa  56.6  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0086  putative oxidoreductase FixC  30.85 
 
 		 428 aa  56.2  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  22.36 
 
 		 429 aa  55.8  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0428  FAD dependent oxidoreductase  22.94 
 
 		 410 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25324  normal  0.196339 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  26.19 
 
 		 455 aa  55.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  34.12 
 
 		 409 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0087  putative oxidoreductase FixC  30.85 
 
 		 428 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  21.73 
 
 		 409 aa  55.5  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  24.46 
 
 		 407 aa  54.3  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1027  FAD dependent oxidoreductase  29.67 
 
 		 430 aa  54.7  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  24.17 
 
 		 415 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0437  hypothetical protein  27.59 
 
 		 423 aa  54.3  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  23.94 
 
 		 435 aa  54.3  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3913  monooxygenase FAD-binding  21.9 
 
 		 416 aa  53.9  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  22.36 
 
 		 429 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3927  FAD dependent oxidoreductase  32.95 
 
 		 431 aa  53.9  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  22.05 
 
 		 429 aa  53.9  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  24.07 
 
 		 444 aa  53.9  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  23.18 
 
 		 376 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  26.35 
 
 		 430 aa  53.5  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  22.05 
 
 		 429 aa  53.5  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0313  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  27.93 
 
 		 430 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.800751  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1576  putative monooxygenase  25.97 
 
 		 388 aa  52.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.472277  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0047  putative oxidoreductase FixC  28.57 
 
 		 428 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  23.64 
 
 		 435 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3616  tryptophan halogenase  24.71 
 
 		 415 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.190224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0331  monooxygenase, FAD-binding  24.4 
 
 		 435 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3389  monooxygenase FAD-binding  33.83 
 
 		 392 aa  52.4  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00047  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  28.19 
 
 		 428 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3556  FAD dependent oxidoreductase  28.19 
 
 		 428 aa  52  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4378  FAD-binding protein  23.56 
 
 		 436 aa  51.6  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  22.05 
 
 		 429 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00046  hypothetical protein  28.19 
 
 		 428 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  28.57 
 
 		 395 aa  52  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0049  putative oxidoreductase FixC  28.19 
 
 		 428 aa  52  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0047  putative oxidoreductase FixC  28.19 
 
 		 428 aa  52  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3898  tryptophan halogenase  21.41 
 
 		 429 aa  51.6  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3158  tryptophan halogenase  25.73 
 
 		 584 aa  52.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000257719 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3612  putative oxidoreductase FixC  28.19 
 
 		 428 aa  52  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0214955 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  33.52 
 
 		 418 aa  51.2  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2756  tryptophan halogenase  26.22 
 
 		 618 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0574  FAD dependent oxidoreductase  29.31 
 
 		 429 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2421  putative monooxygenase  26.89 
 
 		 388 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0945  putative oxidoreductase  25.07 
 
 		 414 aa  50.4  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.183705  normal  0.443912 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2756  FAD dependent oxidoreductase  26.99 
 
 		 417 aa  50.4  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.471979  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  23.74 
 
 		 444 aa  50.4  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1144  putative monooxygenase  26.89 
 
 		 388 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.670847  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0696  putative monooxygenase  26.89 
 
 		 388 aa  50.4  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0540721  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1615  dehydrogenase  21.95 
 
 		 405 aa  50.4  0.00006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0770  putative monooxygenase  26.89 
 
 		 388 aa  50.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.522816  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1734  putative monooxygenase  26.89 
 
 		 388 aa  50.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  26.16 
 
 		 506 aa  50.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3046  tryptophan halogenase  22.72 
 
 		 414 aa  50.1  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354433  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1219  putative monooxygenase  26.46 
 
 		 388 aa  49.7  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00380078  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09250  flavin-dependent dehydrogenase  31.52 
 
 		 442 aa  49.7  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.696714 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00330  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  26.09 
 
 		 405 aa  49.7  0.00009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  24.69 
 
 		 480 aa  49.3  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1719  hypothetical protein  23.83 
 
 		 447 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129966  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0045  putative oxidoreductase FixC  28.04 
 
 		 428 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.820288  normal  0.96055 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4091  tryptophan halogenase  23.82 
 
 		 415 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>