189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3389 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3389  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 		 392 aa  759    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2674  FAD dependent oxidoreductase  44.7 
 
 		 443 aa  280  4e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.680206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3806  FAD dependent oxidoreductase  27.6 
 
 		 375 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749975  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5035  FAD dependent oxidoreductase  29.72 
 
 		 374 aa  122  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.378834 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3185  monooxygenase FAD-binding protein  26.61 
 
 		 375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.388588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3796  oxidoreductase  25.07 
 
 		 377 aa  110  5e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.204918 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  29.63 
 
 		 398 aa  106  6e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2035  FAD dependent oxidoreductase  27.22 
 
 		 379 aa  106  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1644  FAD dependent oxidoreductase  26.37 
 
 		 378 aa  103  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00782092 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10918  putative oxidoreductase  24 
 
 		 374 aa  102  9e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.183929  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1512  FAD dependent oxidoreductase  30.59 
 
 		 365 aa  100  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.193117  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  28.16 
 
 		 398 aa  94.4  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  27.53 
 
 		 398 aa  83.2  0.000000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  29.55 
 
 		 413 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  25.86 
 
 		 455 aa  77.4  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3131  geranylgeranyl reductase  31.19 
 
 		 444 aa  76.3  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  26.65 
 
 		 424 aa  75.1  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  26.58 
 
 		 506 aa  74.3  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  25.53 
 
 		 457 aa  73.2  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  26.92 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  26.61 
 
 		 411 aa  70.9  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  33.95 
 
 		 393 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  25.75 
 
 		 384 aa  70.1  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  32.5 
 
 		 393 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  22.59 
 
 		 444 aa  68.9  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  27.01 
 
 		 418 aa  68.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2826  geranylgeranyl reductase  27.73 
 
 		 443 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0858816 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  24 
 
 		 439 aa  67.8  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  24 
 
 		 439 aa  67.8  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  28.14 
 
 		 423 aa  67  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  24.55 
 
 		 425 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  25.51 
 
 		 423 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  27.46 
 
 		 431 aa  64.7  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  28 
 
 		 445 aa  63.5  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  27.18 
 
 		 431 aa  63.5  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  27.22 
 
 		 414 aa  63.2  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1294  geranylgeranyl reductase  25.91 
 
 		 420 aa  62.4  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.730528  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  27.36 
 
 		 444 aa  62.4  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  25.49 
 
 		 444 aa  62.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  26.88 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  28.83 
 
 		 425 aa  62.4  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  28.09 
 
 		 419 aa  62  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2189  geranylgeranyl reductase  33.33 
 
 		 383 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  30.67 
 
 		 409 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  30.69 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  25.85 
 
 		 430 aa  60.5  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  25.38 
 
 		 389 aa  60.1  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  27.02 
 
 		 445 aa  59.7  0.00000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  25.81 
 
 		 434 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  24.79 
 
 		 426 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  32.04 
 
 		 368 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  45.16 
 
 		 461 aa  58.9  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4493  monooxygenase FAD-binding  28.98 
 
 		 488 aa  59.3  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575117  normal  0.0380746 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  23.81 
 
 		 435 aa  58.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  27.01 
 
 		 370 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  26.15 
 
 		 382 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  21.07 
 
 		 409 aa  57.8  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3959  monooxygenase FAD-binding  32.28 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  25 
 
 		 435 aa  57  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2944  monooxygenase, FAD-binding protein  28.57 
 
 		 436 aa  56.2  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  28.35 
 
 		 424 aa  56.2  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  24.93 
 
 		 429 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4710  FAD dependent oxidoreductase  31 
 
 		 358 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  24.73 
 
 		 435 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0331  monooxygenase, FAD-binding  25 
 
 		 435 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  22.5 
 
 		 429 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  26.47 
 
 		 376 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  24.93 
 
 		 429 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3481  geranylgeranyl reductase  32.73 
 
 		 374 aa  54.7  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18731  NAD binding site  28.25 
 
 		 385 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.413657 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  27.65 
 
 		 470 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  24.85 
 
 		 385 aa  54.3  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  24.93 
 
 		 429 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0135  tryptophan halogenase  22.41 
 
 		 417 aa  53.9  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2294  monooxygenase, FAD-binding  34.03 
 
 		 407 aa  53.9  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.539275  hitchhiker  0.00707471 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1725  monooxygenase, FAD-binding  31.3 
 
 		 442 aa  53.9  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.847315  normal  0.600174 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4378  FAD-binding protein  24.48 
 
 		 436 aa  53.5  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4211  monooxygenase FAD-binding  26.09 
 
 		 429 aa  53.5  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747744  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03920  Monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:Tryptophanhalogenase  29.38 
 
 		 415 aa  53.5  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.117201  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2702  geranylgeranyl reductase  40.91 
 
 		 401 aa  53.1  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3311  tryptophan halogenase  23.77 
 
 		 449 aa  53.1  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0770  geranylgeranyl reductase  25.15 
 
 		 400 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  22.38 
 
 		 424 aa  52.4  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  24.33 
 
 		 429 aa  52.8  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1852  NAD binding site  22.43 
 
 		 376 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  26.89 
 
 		 480 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  26.15 
 
 		 443 aa  51.6  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1739  geranylgeranyl reductase  42.86 
 
 		 358 aa  51.6  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.539865  normal  0.0147858 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1826  geranylgeranyl reductase  33.95 
 
 		 393 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0784  geranylgeranyl reductase  27.01 
 
 		 406 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1873  geranylgeranyl reductase  33.95 
 
 		 393 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700646  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  22.85 
 
 		 434 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1099  geranylgeranyl reductase  33.15 
 
 		 435 aa  51.6  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.997696  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3185  monooxygenase FAD-binding  30.53 
 
 		 442 aa  51.6  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304651  hitchhiker  0.000303065 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4276  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  35.29 
 
 		 434 aa  51.6  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0388  geranylgeranyl reductase  41.38 
 
 		 362 aa  51.6  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  38.57 
 
 		 455 aa  51.2  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0765  geranylgeranyl reductase  27.01 
 
 		 406 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.616022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1807  geranylgeranyl reductase  33.95 
 
 		 393 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  34.34 
 
 		 441 aa  51.6  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>