270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3653 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3653  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 
411 aa  845    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03119  putative transmembrane protein  47.82 
 
 
435 aa  345  7e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.886572  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4211  monooxygenase FAD-binding  42.93 
 
 
429 aa  309  5e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747744  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2944  monooxygenase, FAD-binding protein  33.25 
 
 
436 aa  182  8.000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1178  monooxygenase FAD-binding protein  33.86 
 
 
436 aa  137  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.195738  normal  0.0113639 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5129  monooxygenase FAD-binding  29.33 
 
 
411 aa  136  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2934  monooxygenase, FAD-binding  28.02 
 
 
402 aa  87.4  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3109  monooxygenase FAD-binding  28.81 
 
 
444 aa  83.2  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0331  monooxygenase, FAD-binding  26.19 
 
 
435 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  23.9 
 
 
418 aa  77.8  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4378  FAD-binding protein  26.13 
 
 
436 aa  77  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  26.32 
 
 
429 aa  77  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  26.12 
 
 
429 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  26.12 
 
 
429 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  25.86 
 
 
429 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0428  monooxygenase, FAD-binding  25.6 
 
 
415 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00208516  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  25.14 
 
 
429 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3185  monooxygenase FAD-binding  27.64 
 
 
442 aa  75.1  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304651  hitchhiker  0.000303065 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  25.6 
 
 
435 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  25.6 
 
 
435 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  26.55 
 
 
422 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  26.86 
 
 
413 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  27.33 
 
 
409 aa  72.4  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  26.32 
 
 
416 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  23.99 
 
 
445 aa  72.4  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1725  monooxygenase, FAD-binding  27.07 
 
 
442 aa  72  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.847315  normal  0.600174 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  26.49 
 
 
415 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  23.32 
 
 
425 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  26.87 
 
 
419 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  26.87 
 
 
419 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  21.39 
 
 
409 aa  70.5  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3521  tryptophan halogenase  26.45 
 
 
424 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.956189  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0135  tryptophan halogenase  22.97 
 
 
417 aa  69.3  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  25.28 
 
 
398 aa  67.8  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  23.92 
 
 
423 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1150  monooxygenase FAD-binding protein  23.62 
 
 
397 aa  66.6  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.862466  normal  0.995827 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3959  monooxygenase FAD-binding  26.1 
 
 
411 aa  66.2  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5621  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  25.7 
 
 
409 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4493  monooxygenase FAD-binding  22.51 
 
 
488 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575117  normal  0.0380746 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  24.11 
 
 
424 aa  65.5  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  23.64 
 
 
424 aa  65.5  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3806  FAD dependent oxidoreductase  23.01 
 
 
375 aa  63.9  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749975  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1644  FAD dependent oxidoreductase  24.02 
 
 
378 aa  63.5  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00782092 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  23.32 
 
 
439 aa  63.5  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  23.32 
 
 
439 aa  63.5  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  23.17 
 
 
434 aa  63.2  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  25.16 
 
 
408 aa  63.2  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2036  monooxygenase FAD-binding  25.23 
 
 
388 aa  63.2  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2256  FAD-binding monooxygenase  25.29 
 
 
399 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2641  monooxygenase, FAD-binding  25.64 
 
 
401 aa  62.8  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0428  FAD dependent oxidoreductase  27.41 
 
 
410 aa  62  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25324  normal  0.196339 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3476  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  24.52 
 
 
392 aa  62.4  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.934756  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  22.19 
 
 
455 aa  61.2  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3898  tryptophan halogenase  23.84 
 
 
429 aa  60.8  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  24.78 
 
 
440 aa  60.1  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004059  FAD-binding protein inferred for ABFAE pathway  23.98 
 
 
414 aa  60.5  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0315  tryptophan halogenase  25.36 
 
 
420 aa  60.1  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3046  tryptophan halogenase  26.8 
 
 
414 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354433  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4239  monooxygenase FAD-binding  23.26 
 
 
407 aa  59.7  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2108  FAD dependent oxidoreductase  22.52 
 
 
413 aa  59.7  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00759  putative oxidoreductase protein  27.38 
 
 
419 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  0.0681702 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  21.69 
 
 
382 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4091  tryptophan halogenase  25.53 
 
 
415 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1705  FAD dependent oxidoreductase  24.46 
 
 
366 aa  58.9  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2822  flavoprotein/dehydrogenase  23.58 
 
 
413 aa  58.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  22.54 
 
 
423 aa  58.9  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  21.59 
 
 
390 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  22.11 
 
 
389 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  23.08 
 
 
423 aa  58.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  23.96 
 
 
434 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  23.12 
 
 
444 aa  58.2  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  24.73 
 
 
419 aa  57.8  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03920  Monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:Tryptophanhalogenase  21.31 
 
 
415 aa  57.8  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.117201  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  26.25 
 
 
461 aa  57.8  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  23.26 
 
 
426 aa  57.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  23.21 
 
 
398 aa  57.4  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0828  FAD dependent oxidoreductase  26.74 
 
 
356 aa  57.4  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.491479  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3616  tryptophan halogenase  25.2 
 
 
415 aa  57  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.190224  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4606  tryptophan halogenase  23.15 
 
 
420 aa  57  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2496  putative oxidoreductase  23.74 
 
 
374 aa  57  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0291  FAD dependent oxidoreductase  24.85 
 
 
361 aa  57  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0945  putative oxidoreductase  26.32 
 
 
414 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.183705  normal  0.443912 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  24.16 
 
 
431 aa  56.6  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  22.58 
 
 
435 aa  56.6  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  23.84 
 
 
457 aa  56.6  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3131  geranylgeranyl reductase  29.51 
 
 
444 aa  56.6  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  23.87 
 
 
430 aa  56.6  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  23.91 
 
 
393 aa  56.6  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  21.46 
 
 
390 aa  56.2  0.0000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  21.92 
 
 
445 aa  55.8  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1497  tryptophan halogenase  24.43 
 
 
406 aa  56.2  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.756039  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01380  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  26.49 
 
 
378 aa  55.8  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2826  geranylgeranyl reductase  29.83 
 
 
443 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0858816 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  23.62 
 
 
431 aa  55.5  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  24.8 
 
 
409 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  21.94 
 
 
390 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  22.7 
 
 
406 aa  55.1  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3239  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  26.14 
 
 
415 aa  55.5  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  25.22 
 
 
393 aa  55.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  24.34 
 
 
495 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>