221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03119 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03119  putative transmembrane protein  100 
 
 		 435 aa  873    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.886572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3653  monooxygenase FAD-binding  47.82 
 
 		 411 aa  350  3e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4211  monooxygenase FAD-binding  45.24 
 
 		 429 aa  333  3e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747744  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2944  monooxygenase, FAD-binding protein  32.25 
 
 		 436 aa  172  7.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5129  monooxygenase FAD-binding  30.77 
 
 		 411 aa  133  6e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1178  monooxygenase FAD-binding protein  34.44 
 
 		 436 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.195738  normal  0.0113639 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4487  monooxygenase FAD-binding  30.75 
 
 		 385 aa  93.2  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  27.07 
 
 		 455 aa  82.8  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  26.22 
 
 		 384 aa  73.2  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  28.79 
 
 		 449 aa  72  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  27.55 
 
 		 461 aa  70.9  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3185  monooxygenase FAD-binding protein  25.46 
 
 		 375 aa  70.9  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.388588  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  28.27 
 
 		 455 aa  70.1  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1644  FAD dependent oxidoreductase  26.41 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00782092 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  26.38 
 
 		 445 aa  67.4  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3806  FAD dependent oxidoreductase  23.68 
 
 		 375 aa  67  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749975  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  25.86 
 
 		 398 aa  66.6  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  24.64 
 
 		 439 aa  65.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  24.64 
 
 		 439 aa  65.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1150  monooxygenase FAD-binding protein  26.67 
 
 		 397 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.862466  normal  0.995827 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  22.78 
 
 		 444 aa  63.5  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2934  monooxygenase, FAD-binding  26.24 
 
 		 402 aa  63.5  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  24.33 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2035  FAD dependent oxidoreductase  24.56 
 
 		 379 aa  63.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2763  ubiquinone biosynthesis hydroxylase, UbiH/UbiF/VisC/COQ6  28.21 
 
 		 406 aa  62.4  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  23.97 
 
 		 444 aa  61.2  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  27.78 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  22.93 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  25.27 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2641  monooxygenase, FAD-binding  25.75 
 
 		 401 aa  59.3  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  23.44 
 
 		 429 aa  59.3  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5035  FAD dependent oxidoreductase  29.08 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.378834 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  26.28 
 
 		 398 aa  58.5  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  27.01 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  26.51 
 
 		 444 aa  58.2  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0083  putative oxidoreductase FixC  31.28 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.715205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0087  putative oxidoreductase FixC  30.41 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0086  putative oxidoreductase FixC  30.41 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0084  putative oxidoreductase FixC  30.41 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0083  putative oxidoreductase FixC  30.41 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  26.22 
 
 		 398 aa  57.4  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4493  monooxygenase FAD-binding  23.36 
 
 		 488 aa  57.4  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575117  normal  0.0380746 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  25.43 
 
 		 416 aa  57  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2543  2-octaprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase / 2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  28.28 
 
 		 413 aa  57  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402909  normal  0.0280811 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3959  monooxygenase FAD-binding  26.24 
 
 		 411 aa  56.6  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1109  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  26.1 
 
 		 388 aa  55.8  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.666485  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  24.32 
 
 		 506 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  28.12 
 
 		 395 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  24.04 
 
 		 423 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  24.52 
 
 		 457 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  26.64 
 
 		 368 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2674  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 		 443 aa  55.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.680206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  23.1 
 
 		 390 aa  55.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  24.31 
 
 		 413 aa  54.7  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  24.65 
 
 		 426 aa  54.3  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  22.92 
 
 		 429 aa  54.7  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  26.63 
 
 		 425 aa  53.9  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0957  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  24.73 
 
 		 414 aa  54.3  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1705  FAD dependent oxidoreductase  25.14 
 
 		 366 aa  53.9  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  23.08 
 
 		 435 aa  53.9  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3109  monooxygenase FAD-binding  25.34 
 
 		 444 aa  53.9  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05841  NAD binding site  23.76 
 
 		 377 aa  53.9  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1464  hypothetical protein  26.43 
 
 		 428 aa  53.5  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.682941  normal  0.67626 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1827  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  24.78 
 
 		 414 aa  53.5  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0943693  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1899  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  24.78 
 
 		 414 aa  53.1  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1448  hypothetical protein  26.43 
 
 		 428 aa  53.5  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1496  hypothetical protein  27.69 
 
 		 429 aa  53.5  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.403861 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1482  hypothetical protein  25.94 
 
 		 428 aa  53.5  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839158  normal  0.0909638 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  25.99 
 
 		 423 aa  53.1  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0331  monooxygenase, FAD-binding  23 
 
 		 435 aa  53.1  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4378  FAD-binding protein  23.67 
 
 		 436 aa  52.8  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3413  monooxygenase, FAD-binding  30.81 
 
 		 503 aa  52.8  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0619698  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  22.94 
 
 		 429 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  22.94 
 
 		 429 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0384  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  23.41 
 
 		 377 aa  52.4  0.00002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0945  putative oxidoreductase  26.51 
 
 		 414 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.183705  normal  0.443912 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3046  tryptophan halogenase  27.33 
 
 		 414 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354433  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  25.59 
 
 		 445 aa  52.4  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3259  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  24.78 
 
 		 430 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0253347  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09230  conserved hypothetical protein  24.72 
 
 		 566 aa  51.2  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01668  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  27.18 
 
 		 429 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3185  monooxygenase FAD-binding  24.39 
 
 		 442 aa  51.2  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304651  hitchhiker  0.000303065 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01657  hypothetical protein  27.18 
 
 		 429 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3311  tryptophan halogenase  23.85 
 
 		 449 aa  51.6  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3796  oxidoreductase  21.64 
 
 		 377 aa  51.6  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.204918 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1820  hypothetical protein  25.99 
 
 		 428 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1992  hypothetical protein  25.99 
 
 		 428 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.594962  normal  0.0242177 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  22.94 
 
 		 429 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1725  monooxygenase, FAD-binding  29.17 
 
 		 442 aa  51.6  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.847315  normal  0.600174 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1108  Ubiquinone biosynthesis hydroxylase, UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family  24.48 
 
 		 430 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.34769  hitchhiker  0.00000000136293 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02880  halogenase  28.5 
 
 		 540 aa  50.8  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  25.42 
 
 		 370 aa  50.8  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2416  hypothetical protein  26.67 
 
 		 429 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  22.5 
 
 		 406 aa  50.8  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  24.24 
 
 		 409 aa  50.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1943  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  27.18 
 
 		 429 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.633206  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0080  hypothetical protein  24.92 
 
 		 400 aa  50.4  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1027  FAD dependent oxidoreductase  27.75 
 
 		 430 aa  50.4  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  22.87 
 
 		 390 aa  50.4  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3301  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  24.78 
 
 		 435 aa  50.4  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000230546  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>