More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3185 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3185  monooxygenase FAD-binding protein  100 
 
 		 375 aa  776    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.388588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3806  FAD dependent oxidoreductase  55.47 
 
 		 375 aa  446  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749975  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5035  FAD dependent oxidoreductase  55.43 
 
 		 374 aa  440  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.378834 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1644  FAD dependent oxidoreductase  53.64 
 
 		 378 aa  411  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00782092 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10918  putative oxidoreductase  49.03 
 
 		 374 aa  350  3e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.183929  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2035  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 		 379 aa  260  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3796  oxidoreductase  37.5 
 
 		 377 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.204918 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1512  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 		 365 aa  132  7.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.193117  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3389  monooxygenase FAD-binding  26.61 
 
 		 392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  28.87 
 
 		 424 aa  107  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2674  FAD dependent oxidoreductase  28.32 
 
 		 443 aa  107  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.680206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  27.93 
 
 		 425 aa  106  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  26.02 
 
 		 398 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  28.74 
 
 		 418 aa  101  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  26.33 
 
 		 375 aa  99.8  8e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0255  FAD dependent oxidoreductase  24.47 
 
 		 352 aa  97.4  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.794372 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  25 
 
 		 384 aa  95.9  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  26.85 
 
 		 423 aa  95.1  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  26.14 
 
 		 435 aa  93.6  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  26.72 
 
 		 423 aa  92.4  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0420  hypothetical protein  24.2 
 
 		 363 aa  91.3  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.299605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  26.89 
 
 		 423 aa  91.3  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  24.71 
 
 		 434 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 434 aa  90.9  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  26.82 
 
 		 430 aa  89  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  26.13 
 
 		 426 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  23.72 
 
 		 393 aa  86.3  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  25.38 
 
 		 445 aa  85.5  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  25.87 
 
 		 384 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  23.99 
 
 		 393 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  22.55 
 
 		 430 aa  81.3  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  24.93 
 
 		 368 aa  80.9  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 413 aa  80.5  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 457 aa  80.1  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  24.13 
 
 		 431 aa  80.5  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  25.5 
 
 		 403 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3634  putative electron transfer oxidoreductase  29.09 
 
 		 340 aa  79.3  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.822942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  23.31 
 
 		 431 aa  79.3  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2826  geranylgeranyl reductase  22.57 
 
 		 443 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0858816 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07370  geranylgeranyl reductase family protein  23.96 
 
 		 431 aa  78.6  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0284516 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  26.14 
 
 		 379 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  26.44 
 
 		 419 aa  77.8  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  24.69 
 
 		 398 aa  77.8  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3131  geranylgeranyl reductase  22.95 
 
 		 444 aa  77.8  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  24.92 
 
 		 443 aa  76.3  0.0000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4182  monooxygenase FAD-binding  25.28 
 
 		 362 aa  73.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.787993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  26 
 
 		 370 aa  72.8  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  26.78 
 
 		 376 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18731  NAD binding site  24.35 
 
 		 385 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.413657 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1873  geranylgeranyl reductase  24.87 
 
 		 393 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  24.43 
 
 		 424 aa  71.2  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0660  geranylgeranyl reductase  25.96 
 
 		 406 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1826  geranylgeranyl reductase  24.87 
 
 		 393 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  25.07 
 
 		 379 aa  71.2  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05771  NAD binding site  25.28 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.161819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  26.02 
 
 		 403 aa  70.1  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1807  geranylgeranyl reductase  24.6 
 
 		 393 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  23.88 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  25.72 
 
 		 461 aa  68.6  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1852  NAD binding site  24.72 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4710  FAD dependent oxidoreductase  26.64 
 
 		 358 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5142  monooxygenase, FAD-binding  26 
 
 		 348 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0418  monooxygenase FAD-binding  29.1 
 
 		 364 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1194  FAD dependent oxidoreductase  25.6 
 
 		 340 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.232264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3158  tryptophan halogenase  21.81 
 
 		 584 aa  66.6  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000257719 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  23.37 
 
 		 384 aa  66.6  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  25.38 
 
 		 440 aa  66.6  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05461  NAD binding site  23.03 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3521  tryptophan halogenase  21.95 
 
 		 424 aa  65.9  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.956189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  25.3 
 
 		 341 aa  65.5  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  24.27 
 
 		 378 aa  65.1  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0390  FAD-binding monooxygenase  24.86 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5951  monooxygenase FAD-binding protein  26.26 
 
 		 337 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0365  geranylgeranyl reductase  22.35 
 
 		 386 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.230405  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5969  geranylgeranyl reductase  23.36 
 
 		 409 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.365894  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1090  bacteriochlorophyll synthase 43 kDa subunit  32.34 
 
 		 385 aa  64.3  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 395 aa  64.3  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  22.32 
 
 		 387 aa  64.3  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  25.72 
 
 		 380 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2102  monooxygenase FAD-binding  25.55 
 
 		 340 aa  64.3  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  23.88 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  22.93 
 
 		 429 aa  63.5  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05841  NAD binding site  22.47 
 
 		 377 aa  63.5  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  24.12 
 
 		 398 aa  63.5  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  22.93 
 
 		 429 aa  63.2  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  26.33 
 
 		 365 aa  63.2  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0114  FAD dependent oxidoreductase  24.44 
 
 		 399 aa  63.2  0.000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00154267  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  24.21 
 
 		 380 aa  63.2  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05761  NAD binding site  22.03 
 
 		 377 aa  63.2  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.680324  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  22.93 
 
 		 429 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  22.65 
 
 		 429 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1188  monooxygenase, FAD-binding  25.64 
 
 		 378 aa  62.4  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0630  geranylgeranyl reductase  26.05 
 
 		 373 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.685888 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  22.8 
 
 		 390 aa  62  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0828  FAD dependent oxidoreductase  20.65 
 
 		 356 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.491479  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  25.23 
 
 		 380 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  22.13 
 
 		 392 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17730  geranylgeranyl reductase family protein  24.02 
 
 		 466 aa  61.2  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1077  monooxygenase, FAD-binding  23.85 
 
 		 338 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0754157 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  23.85 
 
 		 422 aa  61.2  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>