229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3796 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3796  oxidoreductase  100 
 
 		 377 aa  778    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.204918 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2035  FAD dependent oxidoreductase  57.78 
 
 		 379 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3806  FAD dependent oxidoreductase  37.98 
 
 		 375 aa  255  8e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749975  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3185  monooxygenase FAD-binding protein  37.5 
 
 		 375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.388588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5035  FAD dependent oxidoreductase  37.87 
 
 		 374 aa  246  4e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.378834 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1644  FAD dependent oxidoreductase  36.63 
 
 		 378 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00782092 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10918  putative oxidoreductase  36.69 
 
 		 374 aa  222  9.999999999999999e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.183929  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3389  monooxygenase FAD-binding  25.07 
 
 		 392 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1512  FAD dependent oxidoreductase  24.68 
 
 		 365 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.193117  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2674  FAD dependent oxidoreductase  23.72 
 
 		 443 aa  99.8  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.680206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  25.14 
 
 		 398 aa  88.2  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  24.93 
 
 		 431 aa  83.2  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  22.63 
 
 		 384 aa  82.4  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0255  FAD dependent oxidoreductase  22.31 
 
 		 352 aa  76.3  0.0000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.794372 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  25.56 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  24.72 
 
 		 376 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0420  hypothetical protein  22.07 
 
 		 363 aa  74.7  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.299605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  24.1 
 
 		 423 aa  73.6  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  24.32 
 
 		 424 aa  73.6  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  22.85 
 
 		 443 aa  72.4  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  24.27 
 
 		 382 aa  72  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  23.51 
 
 		 418 aa  71.6  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  24.32 
 
 		 435 aa  70.9  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  23.68 
 
 		 398 aa  71.2  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2626  monooxygenase FAD-binding  23.78 
 
 		 356 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0390  FAD-binding monooxygenase  20.73 
 
 		 368 aa  70.1  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  23.08 
 
 		 431 aa  69.7  0.00000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  22.37 
 
 		 425 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  22.19 
 
 		 445 aa  68.9  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3477  dehydrogenase (flavoprotein)  23.5 
 
 		 356 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00015718  normal  0.0486362 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  23.79 
 
 		 430 aa  68.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07370  geranylgeranyl reductase family protein  22.22 
 
 		 431 aa  68.2  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0284516 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4182  monooxygenase FAD-binding  23.24 
 
 		 362 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.787993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  23.06 
 
 		 426 aa  67.4  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0418  monooxygenase FAD-binding  20.73 
 
 		 364 aa  66.6  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  22.91 
 
 		 434 aa  66.6  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2102  monooxygenase FAD-binding  25.23 
 
 		 340 aa  66.6  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  21.8 
 
 		 419 aa  66.2  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  22.67 
 
 		 440 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  20.48 
 
 		 413 aa  65.1  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5951  monooxygenase FAD-binding protein  24.11 
 
 		 337 aa  63.9  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  21.34 
 
 		 457 aa  63.5  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1194  FAD dependent oxidoreductase  23.37 
 
 		 340 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.232264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  23.28 
 
 		 449 aa  61.6  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5142  monooxygenase, FAD-binding  24.27 
 
 		 348 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  23.88 
 
 		 434 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0828  FAD dependent oxidoreductase  20.66 
 
 		 356 aa  60.8  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.491479  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1061  monooxygenase, FAD-binding protein  24.14 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1077  monooxygenase, FAD-binding  24.14 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0754157 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1366  hypothetical protein  22.58 
 
 		 418 aa  60.5  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.496364 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1161  geranylgeranyl reductase  24.75 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2826  geranylgeranyl reductase  22.98 
 
 		 443 aa  60.1  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0858816 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  19.84 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  20.74 
 
 		 393 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  22.33 
 
 		 430 aa  58.9  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0323  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  22.16 
 
 		 409 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.97579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1088  monooxygenase, FAD-binding  23.46 
 
 		 338 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.129242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10571  oxidoreductase  22.67 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.649109  normal  0.274108 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  27.63 
 
 		 384 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1505  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  24.8 
 
 		 419 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1532  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  24.32 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.367837 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  23.22 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  22.12 
 
 		 444 aa  57.8  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4604  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  20.71 
 
 		 432 aa  57.4  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3131  geranylgeranyl reductase  22.06 
 
 		 444 aa  56.6  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5221  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  21.82 
 
 		 409 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1226  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  21.49 
 
 		 419 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17730  geranylgeranyl reductase family protein  21.3 
 
 		 466 aa  55.5  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  23.14 
 
 		 374 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00330  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  19.94 
 
 		 405 aa  55.1  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  27.68 
 
 		 403 aa  54.3  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0437  FAD dependent oxidoreductase  23.23 
 
 		 549 aa  54.3  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4710  FAD dependent oxidoreductase  19.09 
 
 		 358 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00520  flavin-dependent dehydrogenase  21.29 
 
 		 363 aa  53.5  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.845908  normal  0.877711 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0714  geranylgeranyl reductase  22.15 
 
 		 415 aa  53.5  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1188  monooxygenase, FAD-binding  22.83 
 
 		 378 aa  53.5  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  21.25 
 
 		 495 aa  53.1  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  20.74 
 
 		 423 aa  53.1  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1220  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  23.72 
 
 		 378 aa  53.1  0.000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1340  hypothetical protein  21.84 
 
 		 381 aa  53.1  0.000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3104  monooxygenase, FAD-binding  19.93 
 
 		 373 aa  53.1  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1496  geranylgeranyl reductase  20.67 
 
 		 361 aa  53.1  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.963353  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9233  Monooxygenase FAD-binding  24.1 
 
 		 376 aa  53.1  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4149  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  21.85 
 
 		 399 aa  52.8  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.435936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  20.82 
 
 		 506 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1139  ubiquinone biosynthesis hydroxylase  22.7 
 
 		 422 aa  52.8  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254878  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  22.84 
 
 		 375 aa  52.4  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3170  hypothetical protein  22.16 
 
 		 406 aa  52.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3634  putative electron transfer oxidoreductase  20.57 
 
 		 340 aa  52.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.822942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2117  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  21.5 
 
 		 439 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0692  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  22.71 
 
 		 391 aa  52  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000811141  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2943  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  21.04 
 
 		 424 aa  52  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0419  monooxygenase FAD-binding  21.01 
 
 		 363 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1156  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  24.85 
 
 		 388 aa  51.6  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  21.26 
 
 		 385 aa  51.2  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  32 
 
 		 424 aa  51.6  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0057  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase / 2-octaprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase  23.27 
 
 		 408 aa  50.8  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.680846  normal  0.68112 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2946  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  20.97 
 
 		 398 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0163  2-polyprenyl-6-methoxyphenol 4-hydroxylase  21.11 
 
 		 410 aa  50.4  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2543  2-octaprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase / 2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  21.65 
 
 		 413 aa  50.4  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402909  normal  0.0280811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>