88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2743 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_2773  FAD dependent oxidoreductase  99.11 
 
 		 447 aa  865    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308714  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2787  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 447 aa  872    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2743  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 447 aa  872    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.211141  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6664  FAD dependent oxidoreductase  31.9 
 
 		 518 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00617853  normal  0.854513 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2498  FAD dependent oxidoreductase  29.53 
 
 		 500 aa  141  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268478  hitchhiker  0.000580756 
 
 
-
 
NC_003296  RS01754  putative signal peptide protein  30.1 
 
 		 497 aa  125  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.95051  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4171  NADPH-dependent glutamate synthase beta chain  33.33 
 
 		 490 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4116  FAD dependent oxidoreductase  29.34 
 
 		 476 aa  117  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3863  FAD dependent oxidoreductase  31.99 
 
 		 437 aa  91.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520485  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6384  monooxygenase FAD-binding  30.11 
 
 		 444 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00239538 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2091  monooxygenase, FAD-binding  28.25 
 
 		 436 aa  69.7  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849976 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2710  monooxygenase, FAD-binding  29.46 
 
 		 459 aa  62  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2517  hypothetical protein  21.94 
 
 		 440 aa  61.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.16456  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2702  hypothetical protein  21.94 
 
 		 440 aa  61.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4305  monooxygenase FAD-binding  26.11 
 
 		 460 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1000  hypothetical protein  26.39 
 
 		 460 aa  60.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0842  hypothetical protein  27.3 
 
 		 443 aa  60.5  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1135  FAD dependent oxidoreductase  26.86 
 
 		 447 aa  59.3  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2716  hypothetical protein  21.51 
 
 		 440 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000407728 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2478  hypothetical protein  21.67 
 
 		 440 aa  57.4  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00689698  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5929  hypothetical protein  26.63 
 
 		 458 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2721  hypothetical protein  21.23 
 
 		 440 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2587  hypothetical protein  21.63 
 
 		 440 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.064334 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2443  hypothetical protein  21.67 
 
 		 440 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3479  monooxygenase FAD-binding  26.42 
 
 		 446 aa  54.7  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4956  monooxygenase, FAD-binding  26.05 
 
 		 443 aa  52.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4358  monooxygenase FAD-binding  28.33 
 
 		 447 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00255024  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1239  monooxygenase FAD-binding protein  28.33 
 
 		 484 aa  52.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2441  hypothetical protein  21.7 
 
 		 440 aa  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109464  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2731  hypothetical protein  20.06 
 
 		 440 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00924641  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3971  putative phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  26.53 
 
 		 468 aa  50.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163754  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4723  hypothetical protein  24.14 
 
 		 449 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.486773 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1777  monooxygenase FAD-binding  24.39 
 
 		 471 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1825  hypothetical protein  21.88 
 
 		 469 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0830  monooxygenase FAD-binding  26.88 
 
 		 453 aa  48.5  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0650  monooxygenase FAD-binding  29.48 
 
 		 487 aa  48.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4777  D-amino acid dehydrogenase small subunit  39.66 
 
 		 416 aa  47  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565064  normal  0.111911 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4135  monooxygenase FAD-binding  29.86 
 
 		 460 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2093  D-amino acid dehydrogenase small subunit  37.93 
 
 		 416 aa  46.2  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.59754  normal  0.0350619 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0730  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  41.18 
 
 		 391 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.11675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1828  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  39.71 
 
 		 393 aa  45.8  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3004  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  39.71 
 
 		 393 aa  45.8  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000162425  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2746  D-amino acid dehydrogenase small subunit  60 
 
 		 434 aa  45.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0984937  decreased coverage  0.0000603863 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0825  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  41.18 
 
 		 391 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00167325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1178  monooxygenase FAD-binding protein  29.57 
 
 		 436 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.195738  normal  0.0113639 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2914  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  39.71 
 
 		 393 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000488899  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0716  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  41.18 
 
 		 391 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000335906  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1632  hypothetical protein  24.59 
 
 		 447 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0777  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  41.18 
 
 		 391 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000759163  normal  0.821116 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1719  hypothetical protein  24.59 
 
 		 447 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129966  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2184  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  34.58 
 
 		 541 aa  45.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.544077  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1331  hypothetical protein  24.03 
 
 		 462 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.199255  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  25.83 
 
 		 506 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0217  hypothetical protein  24.67 
 
 		 476 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1348  hypothetical protein  24.03 
 
 		 462 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.885775 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3091  FAD dependent oxidoreductase  23.95 
 
 		 410 aa  44.7  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.275239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1187  monooxygenase FAD-binding protein  24.44 
 
 		 463 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1934  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.85 
 
 		 691 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  hitchhiker  0.00000161131 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0238  hypothetical protein  32.74 
 
 		 480 aa  44.7  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4178  D-amino acid dehydrogenase small subunit  60 
 
 		 428 aa  44.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2974  D-amino acid dehydrogenase small subunit  60 
 
 		 428 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1656  D-amino acid dehydrogenase small subunit  60 
 
 		 428 aa  44.3  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1042  hypothetical protein  32.04 
 
 		 482 aa  44.3  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.142247  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2925  D-amino acid dehydrogenase small subunit  60 
 
 		 428 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0585  D-amino acid dehydrogenase small subunit  60 
 
 		 428 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4831  D-amino acid dehydrogenase small subunit  37.93 
 
 		 416 aa  44.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0419861  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2864  D-amino acid dehydrogenase small subunit  60 
 
 		 428 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.367842  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0222  D-amino acid dehydrogenase small subunit  60 
 
 		 428 aa  44.3  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0927  D-amino acid dehydrogenase small subunit  60 
 
 		 428 aa  44.3  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1064  D-amino acid dehydrogenase small subunit  60 
 
 		 428 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2551  D-amino acid dehydrogenase small subunit  60 
 
 		 428 aa  44.3  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1023  D-amino acid dehydrogenase small subunit  60 
 
 		 428 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2240  D-amino acid dehydrogenase small subunit  60 
 
 		 428 aa  44.3  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4331  monooxygenase FAD-binding  45.28 
 
 		 451 aa  44.3  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143503  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0408  D-amino acid dehydrogenase small subunit  60 
 
 		 428 aa  44.3  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2099  monooxygenase FAD-binding  25.83 
 
 		 463 aa  44.3  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00870813 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1367  hypothetical protein  24.02 
 
 		 462 aa  44.3  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1109  monooxygenase FAD-binding  31.4 
 
 		 413 aa  44.3  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.529688 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1500  monooxygenase FAD-binding  23.61 
 
 		 441 aa  43.9  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2257  TrkA-N domain protein  57.58 
 
 		 220 aa  43.9  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222998  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1385  monooxygenase FAD-binding  24.14 
 
 		 413 aa  43.9  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2262  D-amino acid dehydrogenase small subunit  37.25 
 
 		 425 aa  43.5  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.66021  normal  0.350308 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2441  putative oxidoreductase  39.58 
 
 		 412 aa  43.5  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6079  D-amino acid dehydrogenase small subunit  37.93 
 
 		 421 aa  43.5  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3133  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  55 
 
 		 388 aa  43.5  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.113474  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0789  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  39.71 
 
 		 391 aa  43.1  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.129538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3055  monooxygenase FAD-binding  58.82 
 
 		 408 aa  43.1  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1198  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  55 
 
 		 388 aa  43.1  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0271465  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>