209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1109 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1109  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 		 413 aa  839    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.529688 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1385  monooxygenase FAD-binding  90.53 
 
 		 413 aa  715    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1224  monooxygenase FAD-binding  90.05 
 
 		 413 aa  709    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0821266  normal  0.977549 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4320  monooxygenase FAD-binding protein  49.64 
 
 		 400 aa  383  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2274  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  52.19 
 
 		 771 aa  375  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2592  monooxygenase, FAD-binding  50.28 
 
 		 404 aa  334  1e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2695  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  49.17 
 
 		 761 aa  330  3e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0527527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0827  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  45.78 
 
 		 771 aa  329  6e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.13916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4331  monooxygenase FAD-binding  50 
 
 		 451 aa  321  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4888  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.42 
 
 		 776 aa  310  2.9999999999999997e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.601528 
 
 
-
 
NC_003296  RS02007  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  43.51 
 
 		 785 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5087  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  43.77 
 
 		 761 aa  302  7.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.608301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2243  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  43.06 
 
 		 764 aa  297  2e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0946349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1323  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  42.78 
 
 		 764 aa  296  4e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.659121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2202  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  40.39 
 
 		 791 aa  286  5e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24917  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2111  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.2 
 
 		 775 aa  285  8e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.452402 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4472  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  41.44 
 
 		 782 aa  283  3.0000000000000004e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155704  normal  0.267141 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3944  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  40.81 
 
 		 792 aa  282  7.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.134026 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3831  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  40.81 
 
 		 792 aa  282  7.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.436537  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3617  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  38.92 
 
 		 822 aa  281  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.278037 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1826  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  40.34 
 
 		 772 aa  281  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.913059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2184  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  40.2 
 
 		 789 aa  280  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.19674  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5038  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  41.18 
 
 		 782 aa  280  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4068  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  42.82 
 
 		 790 aa  280  5e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0593  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  42.71 
 
 		 777 aa  276  7e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7168  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  40.97 
 
 		 790 aa  275  8e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.901999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0282  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  40.89 
 
 		 790 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0656  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  39.32 
 
 		 777 aa  269  5.9999999999999995e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.844921  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4014  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  41.53 
 
 		 774 aa  266  5.999999999999999e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7497  putative aromatic-ring hydroxylase  40.5 
 
 		 379 aa  263  4.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2872  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  38.23 
 
 		 804 aa  256  4e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.347054  normal  0.96919 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0307  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  39.67 
 
 		 790 aa  256  5e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5101  monooxygenase, FAD-binding  37.2 
 
 		 381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.889142  normal  0.467913 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3180  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  39.51 
 
 		 778 aa  250  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.344257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0171  monooxygenase, FAD-binding  40.18 
 
 		 381 aa  241  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2683  NADPH dehydrogenase  36.67 
 
 		 782 aa  241  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.292135 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2817  monooxygenase FAD-binding protein  41.26 
 
 		 712 aa  237  3e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.606317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2161  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40 
 
 		 784 aa  236  5.0000000000000005e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5522  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  39.24 
 
 		 791 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.291941 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0297  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  39.34 
 
 		 752 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0437387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5482  monooxygenase, FAD-binding  36.77 
 
 		 377 aa  232  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.942938  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1202  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  38.84 
 
 		 780 aa  230  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4903  monooxygenase, FAD-binding  36.66 
 
 		 379 aa  224  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3779  putative monooxygenase, FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  34.49 
 
 		 386 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4123  monooxygenase, FAD-binding  37.6 
 
 		 374 aa  207  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.058408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3101  monooxygenase, FAD-binding  34.51 
 
 		 384 aa  182  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2043  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase and related FAD-dependent oxidoreductases-like  28.11 
 
 		 479 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  23.42 
 
 		 374 aa  76.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  28.73 
 
 		 376 aa  73.6  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  25.48 
 
 		 371 aa  72.4  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  26.12 
 
 		 393 aa  72.4  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2552  monooxygenase FAD-binding protein  26.27 
 
 		 376 aa  66.6  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2343  monooxygenase FAD-binding protein  28.33 
 
 		 392 aa  67  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  25.71 
 
 		 379 aa  65.1  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0588  monooxygenase FAD-binding  34.11 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  25.71 
 
 		 377 aa  64.7  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3417  monooxygenase, FAD-binding  25 
 
 		 379 aa  61.6  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0807578 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2786  monooxygenase FAD-binding protein  27.83 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00390244  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  26.5 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5812  monooxygenase, FAD-binding protein  25.98 
 
 		 408 aa  60.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5386  monooxygenase FAD-binding  27.19 
 
 		 392 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.336288 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3199  hypothetical protein  26.44 
 
 		 374 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1576  putative monooxygenase  26.75 
 
 		 388 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.472277  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0896  monooxygenase, FAD-binding  28.17 
 
 		 389 aa  58.9  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3466  monooxygenase, FAD-binding  26.22 
 
 		 392 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1762  monooxygenase FAD-binding  28.24 
 
 		 384 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4900  monooxygenase, FAD-binding  26.22 
 
 		 392 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.99121 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4828  hypothetical protein  27.41 
 
 		 376 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.454319 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56402  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  26.47 
 
 		 426 aa  58.2  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.476468  normal  0.198075 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1565  monooxygenase FAD-binding  28.97 
 
 		 384 aa  58.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156985 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0733  hypothetical protein  26.52 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3547  hypothetical protein  25.19 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1002  hypothetical protein  26.52 
 
 		 369 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.132346  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  22.96 
 
 		 385 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3836  monooxygenase FAD-binding  26.69 
 
 		 351 aa  56.6  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0338  monooxygenase FAD-binding  25.61 
 
 		 372 aa  55.8  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0304  hypothetical protein  26.32 
 
 		 361 aa  56.2  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.741519  normal  0.196732 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4393  monooxygenase FAD-binding  26.22 
 
 		 377 aa  55.8  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3438  monooxygenase, FAD-binding  25.51 
 
 		 399 aa  56.2  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1936  hypothetical protein  26.26 
 
 		 376 aa  56.2  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  26.41 
 
 		 406 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4138  monooxygenase, FAD-binding protein  25.22 
 
 		 408 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145497  normal  0.0296411 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1528  monooxygenase FAD-binding  22.13 
 
 		 362 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.392805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  25.69 
 
 		 397 aa  54.7  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0809  monooxygenase, FAD-binding  25.45 
 
 		 396 aa  54.7  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.21546 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4013  monooxygenase FAD-binding  21.29 
 
 		 362 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0834664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3428  monooxygenase, FAD-binding  24.52 
 
 		 372 aa  54.7  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21010  putative FAD-dependent monooxygenase  28.88 
 
 		 388 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.12929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1219  putative monooxygenase  26.87 
 
 		 388 aa  53.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00380078  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2421  putative monooxygenase  26.87 
 
 		 388 aa  53.5  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1144  putative monooxygenase  26.87 
 
 		 388 aa  53.5  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.670847  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2599  Kynurenine 3-monooxygenase  26.79 
 
 		 455 aa  53.1  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0833412  normal  0.344661 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  27.98 
 
 		 395 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0399  FAD dependent oxidoreductase  32 
 
 		 357 aa  52.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0918847  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4971  monooxygenase FAD-binding  27.98 
 
 		 384 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415719  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  30.08 
 
 		 389 aa  51.6  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0696  putative monooxygenase  26.43 
 
 		 388 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0540721  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  22.73 
 
 		 385 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  27 
 
 		 376 aa  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0770  putative monooxygenase  26.43 
 
 		 388 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.522816  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>