More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2274 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4068  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  60.95 
 
 		 790 aa  940    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5038  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  59.46 
 
 		 782 aa  919    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3831  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  60.92 
 
 		 792 aa  944    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.436537  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1826  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  57.12 
 
 		 772 aa  879    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.913059  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02007  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  61.86 
 
 		 785 aa  955    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4888  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  61.53 
 
 		 776 aa  962    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.601528 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2683  NADPH dehydrogenase  54.89 
 
 		 782 aa  822    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.292135 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2184  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  61.33 
 
 		 789 aa  941    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.19674  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2872  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  56.16 
 
 		 804 aa  882    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.347054  normal  0.96919 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5087  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  60.57 
 
 		 761 aa  941    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.608301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0307  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.39 
 
 		 790 aa  716    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1202  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.52 
 
 		 780 aa  804    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5522  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  52.28 
 
 		 791 aa  760    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.291941 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1323  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  59.48 
 
 		 764 aa  932    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.659121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0593  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  59.82 
 
 		 777 aa  937    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0282  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  61.08 
 
 		 790 aa  950    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0656  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  55.22 
 
 		 777 aa  858    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.844921  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3617  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  56.04 
 
 		 822 aa  887    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.278037 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2202  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  60.91 
 
 		 791 aa  961    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24917  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7168  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  60.95 
 
 		 790 aa  947    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.901999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3180  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  58.69 
 
 		 778 aa  909    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.344257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2243  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  61.35 
 
 		 764 aa  966    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0946349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4472  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  59.82 
 
 		 782 aa  927    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155704  normal  0.267141 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2274  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  100 
 
 		 771 aa  1598    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3944  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  60.92 
 
 		 792 aa  944    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.134026 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4014  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  56.83 
 
 		 774 aa  900    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0827  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  60.65 
 
 		 771 aa  973    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.13916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2695  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  63.93 
 
 		 761 aa  987    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0527527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2111  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  63.39 
 
 		 775 aa  977    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.452402 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2161  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.93 
 
 		 784 aa  784    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0297  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.35 
 
 		 752 aa  728    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0437387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4320  monooxygenase FAD-binding protein  52.6 
 
 		 400 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2592  monooxygenase, FAD-binding  46.93 
 
 		 404 aa  360  5e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1224  monooxygenase FAD-binding  51.82 
 
 		 413 aa  356  1e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0821266  normal  0.977549 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1385  monooxygenase FAD-binding  51.26 
 
 		 413 aa  352  2e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1109  monooxygenase FAD-binding  52.66 
 
 		 413 aa  351  4e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.529688 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4331  monooxygenase FAD-binding  42.6 
 
 		 451 aa  335  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143503  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1371  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  49.43 
 
 		 365 aa  332  1e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2577  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.58 
 
 		 355 aa  330  7e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00218003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3318  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.61 
 
 		 356 aa  318  2e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7562  NADPH dehydrogenase  45.98 
 
 		 370 aa  319  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2083  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.88 
 
 		 353 aa  317  4e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1866  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.04 
 
 		 358 aa  314  4.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2211  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  47.04 
 
 		 358 aa  314  4.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16260  putative FMN oxidoreductase  46 
 
 		 368 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1489  xenobiotic reductase, putative  46.13 
 
 		 368 aa  311  4e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1919  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.01 
 
 		 356 aa  310  5.9999999999999995e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.957099 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2134  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.74 
 
 		 353 aa  310  5.9999999999999995e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000241293  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4139  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.42 
 
 		 368 aa  310  9e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0652  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.69 
 
 		 370 aa  309  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0749879 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0611  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.98 
 
 		 370 aa  309  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.316093 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3946  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.29 
 
 		 361 aa  309  1.0000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.181914  normal  0.508638 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1398  putative FMN oxidoreductase  45.71 
 
 		 368 aa  309  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1299  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.13 
 
 		 368 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4243  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.85 
 
 		 368 aa  305  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39430  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.29 
 
 		 368 aa  304  4.0000000000000003e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1086  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.13 
 
 		 368 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.607736 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1036  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46 
 
 		 368 aa  303  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1478  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.27 
 
 		 368 aa  302  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.139205 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0702  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase protein  44.83 
 
 		 370 aa  302  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00458318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1442  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.51 
 
 		 357 aa  302  2e-80  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00181939  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0966  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.66 
 
 		 369 aa  302  2e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104436  normal  0.525672 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5101  monooxygenase, FAD-binding  42.71 
 
 		 381 aa  301  4e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.889142  normal  0.467913 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3810  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.33 
 
 		 356 aa  297  4e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3342  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  43.97 
 
 		 370 aa  297  5e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2608  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.27 
 
 		 371 aa  297  5e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.103879 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2520  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.5 
 
 		 364 aa  296  8e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984471  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7497  putative aromatic-ring hydroxylase  42.08 
 
 		 379 aa  295  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2248  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.21 
 
 		 372 aa  295  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.674578 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2523  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.21 
 
 		 372 aa  295  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0620053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5482  monooxygenase, FAD-binding  41.04 
 
 		 377 aa  295  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.942938  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1577  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase  45.72 
 
 		 370 aa  295  2e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0241871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0148  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.43 
 
 		 357 aa  295  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2205  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.66 
 
 		 372 aa  295  2e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.517852 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33410  NADH:flavin oxidoreductase  44.66 
 
 		 359 aa  294  5e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.374092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0171  monooxygenase, FAD-binding  44.09 
 
 		 381 aa  294  5e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1456  FMN oxidoreductase  46.55 
 
 		 354 aa  293  6e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0196412  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1718  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.26 
 
 		 355 aa  293  6e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.404463  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0881  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.04 
 
 		 387 aa  292  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427162  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1165  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.21 
 
 		 356 aa  292  2e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0293  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.13 
 
 		 354 aa  292  2e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.818781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4859  putative NADH-depentdent flavin oxidoreductase  40.91 
 
 		 371 aa  291  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.563143  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2881  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42 
 
 		 364 aa  291  3e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.438588  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3010  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.29 
 
 		 364 aa  291  4e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.912914  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2825  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.39 
 
 		 364 aa  291  4e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0991  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.32 
 
 		 387 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0239278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2864  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.29 
 
 		 364 aa  290  6e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.597938  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0211  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  43.1 
 
 		 370 aa  289  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1495  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42 
 
 		 364 aa  289  1e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.611411  normal  0.671157 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4082  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  43.1 
 
 		 370 aa  289  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5918  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.86 
 
 		 352 aa  288  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00164429 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2178  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.33 
 
 		 354 aa  288  2.9999999999999996e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2113  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.54 
 
 		 370 aa  288  4e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4010  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  42.82 
 
 		 370 aa  288  4e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0090  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.25 
 
 		 370 aa  287  4e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.552825 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4317  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.26 
 
 		 371 aa  287  5e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.529311  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1173  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.67 
 
 		 370 aa  287  5e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2983  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.97 
 
 		 370 aa  286  9e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0072  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.97 
 
 		 370 aa  286  9e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1527  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.04 
 
 		 368 aa  286  1.0000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>