More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4068 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc1826  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  64.81 
 
 
772 aa  1049    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.913059  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02007  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  76.08 
 
 
785 aa  1243    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2683  NADPH dehydrogenase  50.32 
 
 
782 aa  760    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.292135 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0827  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  56.06 
 
 
771 aa  883    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.13916  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4068  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  100 
 
 
790 aa  1640    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5522  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  51.73 
 
 
791 aa  773    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.291941 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4472  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  68.49 
 
 
782 aa  1096    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155704  normal  0.267141 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5038  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  65.49 
 
 
782 aa  1034    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2872  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  63.76 
 
 
804 aa  1021    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.347054  normal  0.96919 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2184  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  71.35 
 
 
789 aa  1137    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.19674  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1202  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.29 
 
 
780 aa  764    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7168  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  87.22 
 
 
790 aa  1450    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.901999  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1323  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  58.43 
 
 
764 aa  901    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.659121  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4014  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  63.73 
 
 
774 aa  1007    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0593  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  66.5 
 
 
777 aa  1080    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0282  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  86.46 
 
 
790 aa  1442    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3831  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  75.63 
 
 
792 aa  1233    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.436537  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5087  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  55.97 
 
 
761 aa  875    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.608301  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3617  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  62.91 
 
 
822 aa  1037    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.278037 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3944  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  75.63 
 
 
792 aa  1233    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.134026 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2202  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  69.91 
 
 
791 aa  1150    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24917  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0656  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  62.18 
 
 
777 aa  1010    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.844921  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2243  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  59.84 
 
 
764 aa  919    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0946349  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2274  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  60.95 
 
 
771 aa  940    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3180  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  68.16 
 
 
778 aa  1083    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.344257  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2161  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.58 
 
 
784 aa  721    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172901  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2695  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  58.52 
 
 
761 aa  903    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0527527  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0307  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.9 
 
 
790 aa  701    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2111  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  66.54 
 
 
775 aa  1085    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.452402 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4888  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  59.8 
 
 
776 aa  923    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.601528 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0297  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.03 
 
 
752 aa  709    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0437387  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1165  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.33 
 
 
356 aa  313  6.999999999999999e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3810  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.34 
 
 
356 aa  311  4e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2817  monooxygenase FAD-binding protein  43.57 
 
 
712 aa  305  2.0000000000000002e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.606317  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5482  monooxygenase, FAD-binding  40.93 
 
 
377 aa  298  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.942938  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2577  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.07 
 
 
355 aa  298  4e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00218003  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4139  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.22 
 
 
368 aa  296  8e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2083  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.61 
 
 
353 aa  296  9e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1866  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.94 
 
 
358 aa  296  1e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2211  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  46.94 
 
 
358 aa  296  1e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3946  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.34 
 
 
361 aa  296  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.181914  normal  0.508638 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0611  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.15 
 
 
370 aa  294  5e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.316093 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0652  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.28 
 
 
370 aa  293  1e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0749879 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2134  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.32 
 
 
353 aa  291  3e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000241293  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16260  putative FMN oxidoreductase  44.99 
 
 
368 aa  291  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1398  putative FMN oxidoreductase  45.58 
 
 
368 aa  291  4e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2178  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.98 
 
 
354 aa  291  5.0000000000000004e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1299  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.26 
 
 
368 aa  289  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1489  xenobiotic reductase, putative  43.7 
 
 
368 aa  288  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4243  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.63 
 
 
368 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3318  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.22 
 
 
356 aa  288  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470723  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1086  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.63 
 
 
368 aa  288  4e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.607736 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1036  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.19 
 
 
368 aa  287  5e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1478  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.09 
 
 
368 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.139205 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5101  monooxygenase, FAD-binding  39.74 
 
 
381 aa  286  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.889142  normal  0.467913 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39430  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.48 
 
 
368 aa  286  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4320  monooxygenase FAD-binding protein  41.96 
 
 
400 aa  285  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1919  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.04 
 
 
356 aa  285  3.0000000000000004e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.957099 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1371  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  44.76 
 
 
365 aa  284  4.0000000000000003e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2592  monooxygenase, FAD-binding  44.41 
 
 
404 aa  283  6.000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0881  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.69 
 
 
387 aa  284  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427162  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0171  monooxygenase, FAD-binding  40.62 
 
 
381 aa  284  6.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0991  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.23 
 
 
387 aa  283  8.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0239278  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2779  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.3 
 
 
354 aa  282  1e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.487113  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7562  NADPH dehydrogenase  45.14 
 
 
370 aa  282  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3342  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  44.35 
 
 
370 aa  280  6e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0702  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase protein  45.87 
 
 
370 aa  279  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00458318  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4902  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.59 
 
 
358 aa  277  7e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2205  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.84 
 
 
372 aa  276  9e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.517852 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7497  putative aromatic-ring hydroxylase  41.71 
 
 
379 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1577  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase  45.33 
 
 
370 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0241871  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2248  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44 
 
 
372 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.674578 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33410  NADH:flavin oxidoreductase  44.35 
 
 
359 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.374092  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2523  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44 
 
 
372 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0620053  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0148  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.9 
 
 
357 aa  275  3e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0211  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  43.79 
 
 
370 aa  275  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5174  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.56 
 
 
387 aa  275  3e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4317  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42 
 
 
371 aa  274  5.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.529311  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4082  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  43.79 
 
 
370 aa  274  6e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4010  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  43.5 
 
 
370 aa  273  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0090  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.57 
 
 
370 aa  272  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.552825 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1715  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.06 
 
 
359 aa  272  2e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.148075  normal  0.0532635 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5918  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.43 
 
 
352 aa  272  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00164429 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2983  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.29 
 
 
370 aa  271  4e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0072  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.29 
 
 
370 aa  271  4e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2113  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.84 
 
 
370 aa  270  5.9999999999999995e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5152  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.66 
 
 
402 aa  270  7e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.506214  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1456  FMN oxidoreductase  43.63 
 
 
354 aa  270  8e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0196412  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4123  monooxygenase, FAD-binding  38.5 
 
 
374 aa  270  8e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.058408  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0063  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44 
 
 
370 aa  270  8e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3253  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.84 
 
 
370 aa  269  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4859  putative NADH-depentdent flavin oxidoreductase  40.62 
 
 
371 aa  269  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.563143  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2687  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.78 
 
 
373 aa  268  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.340404 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0655  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.54 
 
 
367 aa  268  4e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.208433  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0966  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.83 
 
 
369 aa  267  4e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104436  normal  0.525672 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0005  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase  44 
 
 
370 aa  267  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0071  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.41 
 
 
370 aa  267  7e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282645  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2882  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.51 
 
 
360 aa  266  8.999999999999999e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.458184  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7390  xenobiotic reductase A  41.81 
 
 
363 aa  266  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0072  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.43 
 
 
370 aa  266  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>