More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2111 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0307  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.93 
 
 
790 aa  700    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4888  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  62.63 
 
 
776 aa  987    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.601528 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1826  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  64.68 
 
 
772 aa  1047    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.913059  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02007  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  70.83 
 
 
785 aa  1111    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4014  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  62 
 
 
774 aa  1009    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3180  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  64.33 
 
 
778 aa  1000    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.344257  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5522  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  53.07 
 
 
791 aa  775    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.291941 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5038  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  70.42 
 
 
782 aa  1121    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2683  NADPH dehydrogenase  52.11 
 
 
782 aa  810    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.292135 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5087  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  57.44 
 
 
761 aa  889    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.608301  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1202  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.72 
 
 
780 aa  759    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2184  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  69.46 
 
 
789 aa  1114    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.19674  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7168  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  67.43 
 
 
790 aa  1107    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.901999  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3831  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  68.91 
 
 
792 aa  1083    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.436537  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0656  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  64.77 
 
 
777 aa  1041    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.844921  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0297  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.96 
 
 
752 aa  706    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0437387  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2111  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  100 
 
 
775 aa  1609    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.452402 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1323  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  57.63 
 
 
764 aa  884    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.659121  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0593  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  71.06 
 
 
777 aa  1144    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0282  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  67.43 
 
 
790 aa  1104    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3944  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  68.91 
 
 
792 aa  1083    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.134026 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2202  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  69.47 
 
 
791 aa  1136    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24917  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0827  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  56.81 
 
 
771 aa  910    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.13916  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2243  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  59 
 
 
764 aa  907    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0946349  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3617  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  67.19 
 
 
822 aa  1120    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.278037 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2274  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  63.39 
 
 
771 aa  977    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4472  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  66.58 
 
 
782 aa  1068    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155704  normal  0.267141 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2161  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.7 
 
 
784 aa  758    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172901  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2695  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  60.44 
 
 
761 aa  931    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0527527  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2872  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  61.45 
 
 
804 aa  970    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.347054  normal  0.96919 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4068  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  66.54 
 
 
790 aa  1085    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1919  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.72 
 
 
356 aa  331  4e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.957099 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0966  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.43 
 
 
369 aa  321  3e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104436  normal  0.525672 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3318  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.18 
 
 
356 aa  320  9e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470723  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1398  putative FMN oxidoreductase  47.27 
 
 
368 aa  319  1e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2083  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.44 
 
 
353 aa  317  4e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1371  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  48 
 
 
365 aa  317  5e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3946  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.68 
 
 
361 aa  316  9e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.181914  normal  0.508638 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16260  putative FMN oxidoreductase  46.45 
 
 
368 aa  316  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3810  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.59 
 
 
356 aa  315  1.9999999999999998e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0652  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.52 
 
 
370 aa  315  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0749879 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0611  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.8 
 
 
370 aa  314  3.9999999999999997e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.316093 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2577  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.16 
 
 
355 aa  313  7.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00218003  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1299  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.7 
 
 
368 aa  312  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2134  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.31 
 
 
353 aa  311  4e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000241293  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0702  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase protein  46.8 
 
 
370 aa  310  6.999999999999999e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00458318  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1036  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.85 
 
 
368 aa  310  6.999999999999999e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4139  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.42 
 
 
368 aa  310  8e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39430  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.86 
 
 
368 aa  310  9e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1165  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.91 
 
 
356 aa  309  1.0000000000000001e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1489  xenobiotic reductase, putative  46.13 
 
 
368 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7562  NADPH dehydrogenase  44.29 
 
 
370 aa  307  4.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3342  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  45.69 
 
 
370 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4243  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.85 
 
 
368 aa  304  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1866  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.48 
 
 
358 aa  303  6.000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2211  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  46.48 
 
 
358 aa  303  6.000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1577  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase  47.28 
 
 
370 aa  303  1e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0241871  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1086  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.56 
 
 
368 aa  299  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.607736 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1442  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.87 
 
 
357 aa  299  1e-79  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00181939  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0211  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  45.11 
 
 
370 aa  298  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5482  monooxygenase, FAD-binding  41.34 
 
 
377 aa  297  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.942938  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4010  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  45.11 
 
 
370 aa  297  5e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4082  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  45.11 
 
 
370 aa  297  7e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1478  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.99 
 
 
368 aa  296  8e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.139205 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4317  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.55 
 
 
371 aa  295  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.529311  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2817  monooxygenase FAD-binding protein  41.57 
 
 
712 aa  295  2e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.606317  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0148  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.83 
 
 
357 aa  294  4e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2178  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.33 
 
 
354 aa  294  5e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1173  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.5 
 
 
370 aa  293  8e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1456  FMN oxidoreductase  47.13 
 
 
354 aa  292  1e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0196412  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0881  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.18 
 
 
387 aa  292  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427162  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0991  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.73 
 
 
387 aa  293  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0239278  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2608  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.85 
 
 
371 aa  293  1e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.103879 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3253  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.54 
 
 
370 aa  292  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7390  xenobiotic reductase A  43.23 
 
 
363 aa  291  3e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0063  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.54 
 
 
370 aa  291  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4859  putative NADH-depentdent flavin oxidoreductase  41.48 
 
 
371 aa  290  9e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.563143  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2779  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.73 
 
 
354 aa  289  1e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.487113  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0072  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.83 
 
 
370 aa  288  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5918  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.86 
 
 
352 aa  288  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00164429 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0090  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.25 
 
 
370 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.552825 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3060  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.18 
 
 
376 aa  288  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.455155  normal  0.826511 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4322  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.39 
 
 
369 aa  287  4e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.700048  normal  0.249801 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2394  NADH--flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.57 
 
 
354 aa  287  5e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2983  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.97 
 
 
370 aa  287  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0072  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.97 
 
 
370 aa  287  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0071  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.54 
 
 
370 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282645  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1718  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.97 
 
 
355 aa  283  8.000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.404463  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2825  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.83 
 
 
364 aa  282  2e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0005  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase  42.34 
 
 
370 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1573  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.55 
 
 
365 aa  281  3e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2520  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.38 
 
 
364 aa  281  3e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984471  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1699  xenobiotic reductase A  42.53 
 
 
365 aa  281  5e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265579  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3839  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.73 
 
 
352 aa  280  5e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.431413 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4179  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.95 
 
 
369 aa  280  7e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.888395 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0720  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.8 
 
 
367 aa  280  7e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3701  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.95 
 
 
369 aa  280  7e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3244  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.24 
 
 
369 aa  280  9e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.324542  normal  0.664985 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0715  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase family protein  41.5 
 
 
365 aa  279  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.489419 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2523  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.74 
 
 
372 aa  278  2e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0620053  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>