More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_5087 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_2683  NADPH dehydrogenase  50.85 
 
 
782 aa  761    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.292135 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0297  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.8 
 
 
752 aa  664    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0437387  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3944  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  57.5 
 
 
792 aa  873    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.134026 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1826  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  54.46 
 
 
772 aa  847    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.913059  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02007  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  58.34 
 
 
785 aa  878    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0307  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.87 
 
 
790 aa  694    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0827  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  59.66 
 
 
771 aa  946    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.13916  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1202  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.98 
 
 
780 aa  753    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3180  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  56.54 
 
 
778 aa  842    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.344257  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2184  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  58.53 
 
 
789 aa  896    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.19674  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5522  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  49.34 
 
 
791 aa  721    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.291941 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0656  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  54.12 
 
 
777 aa  833    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.844921  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2161  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50 
 
 
784 aa  702    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172901  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7168  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  56.21 
 
 
790 aa  885    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.901999  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3831  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  57.5 
 
 
792 aa  873    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.436537  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4068  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  55.97 
 
 
790 aa  875    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4888  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  57.51 
 
 
776 aa  892    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.601528 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1323  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  70.08 
 
 
764 aa  1137    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.659121  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0593  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  55.98 
 
 
777 aa  893    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0282  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  56.08 
 
 
790 aa  882    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2202  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  58.17 
 
 
791 aa  911    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24917  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3617  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  52.98 
 
 
822 aa  854    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.278037 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5038  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  57.84 
 
 
782 aa  892    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2243  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  71.37 
 
 
764 aa  1171    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0946349  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2274  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  60.57 
 
 
771 aa  941    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2695  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  61 
 
 
761 aa  944    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0527527  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2111  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  57.44 
 
 
775 aa  889    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.452402 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4014  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  53.3 
 
 
774 aa  830    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5087  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  100 
 
 
761 aa  1574    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.608301  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4472  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  58.15 
 
 
782 aa  891    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155704  normal  0.267141 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2872  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  53.97 
 
 
804 aa  812    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.347054  normal  0.96919 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16260  putative FMN oxidoreductase  46.72 
 
 
368 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7562  NADPH dehydrogenase  46.53 
 
 
370 aa  306  9.000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2205  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.83 
 
 
372 aa  306  9.000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.517852 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2248  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.12 
 
 
372 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.674578 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2523  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.12 
 
 
372 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0620053  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1398  putative FMN oxidoreductase  46.44 
 
 
368 aa  305  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39430  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.09 
 
 
368 aa  301  3e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1577  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase  48.12 
 
 
370 aa  301  4e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0241871  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5482  monooxygenase, FAD-binding  41.16 
 
 
377 aa  298  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.942938  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3946  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.9 
 
 
361 aa  298  3e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.181914  normal  0.508638 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1036  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.43 
 
 
368 aa  296  9e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4243  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.71 
 
 
368 aa  296  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1173  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.32 
 
 
370 aa  296  1e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1086  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.43 
 
 
368 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.607736 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4139  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.43 
 
 
368 aa  295  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4317  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.93 
 
 
371 aa  293  7e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.529311  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1478  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.14 
 
 
368 aa  293  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.139205 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1919  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.46 
 
 
356 aa  292  1e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.957099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3318  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44 
 
 
356 aa  292  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470723  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2687  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.76 
 
 
373 aa  291  3e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.340404 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2211  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  47.14 
 
 
358 aa  290  7e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1866  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.14 
 
 
358 aa  290  7e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1165  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42 
 
 
356 aa  289  1e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2178  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.69 
 
 
354 aa  288  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1371  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  44.44 
 
 
365 aa  288  4e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1299  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.17 
 
 
368 aa  288  4e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2577  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.14 
 
 
355 aa  287  4e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00218003  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2083  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.43 
 
 
353 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4859  putative NADH-depentdent flavin oxidoreductase  43.82 
 
 
371 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.563143  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1489  xenobiotic reductase, putative  43.33 
 
 
368 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2082  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.88 
 
 
373 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1456  FMN oxidoreductase  45.3 
 
 
354 aa  281  3e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0196412  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1224  monooxygenase FAD-binding  44.02 
 
 
413 aa  281  4e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0821266  normal  0.977549 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5918  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.01 
 
 
352 aa  280  7e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00164429 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2134  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.7 
 
 
353 aa  279  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000241293  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1069  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45 
 
 
372 aa  279  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1109  monooxygenase FAD-binding  44 
 
 
413 aa  278  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.529688 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0611  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.38 
 
 
370 aa  278  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.316093 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0148  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.14 
 
 
357 aa  279  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1385  monooxygenase FAD-binding  44.02 
 
 
413 aa  278  3e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4320  monooxygenase FAD-binding protein  43.06 
 
 
400 aa  278  4e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0171  monooxygenase, FAD-binding  39.89 
 
 
381 aa  277  4e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7497  putative aromatic-ring hydroxylase  39.95 
 
 
379 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0652  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.8 
 
 
370 aa  275  3e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0749879 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3810  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.6 
 
 
356 aa  275  3e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5101  monooxygenase, FAD-binding  39.68 
 
 
381 aa  275  3e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.889142  normal  0.467913 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2592  monooxygenase, FAD-binding  42.78 
 
 
404 aa  273  6e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2608  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.09 
 
 
371 aa  273  7e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.103879 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4902  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.98 
 
 
358 aa  273  8.000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1649  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.27 
 
 
365 aa  273  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3253  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.06 
 
 
370 aa  273  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0293  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.43 
 
 
354 aa  271  2e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.818781  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0881  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.09 
 
 
387 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427162  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0072  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.06 
 
 
370 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3775  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.51 
 
 
379 aa  271  2.9999999999999997e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.797165  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2520  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.61 
 
 
364 aa  271  4e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984471  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1715  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.82 
 
 
359 aa  271  5e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.148075  normal  0.0532635 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3839  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.74 
 
 
352 aa  270  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.431413 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2779  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.8 
 
 
354 aa  270  8e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.487113  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0361  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.87 
 
 
355 aa  270  8.999999999999999e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000624901 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0655  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.43 
 
 
367 aa  269  2e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.208433  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33410  NADH:flavin oxidoreductase  43.14 
 
 
359 aa  269  2e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.374092  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2817  monooxygenase FAD-binding protein  38.88 
 
 
712 aa  268  2.9999999999999995e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.606317  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1442  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.39 
 
 
357 aa  267  4e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00181939  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0090  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.35 
 
 
370 aa  267  5e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.552825 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3342  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  42.2 
 
 
370 aa  267  5.999999999999999e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0888  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.02 
 
 
365 aa  266  8.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2983  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.06 
 
 
370 aa  266  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0072  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.06 
 
 
370 aa  266  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>