More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1826 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2683  NADPH dehydrogenase  51.1 
 
 		 782 aa  762    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.292135 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2111  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  64.68 
 
 		 775 aa  1047    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.452402 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1826  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  100 
 
 		 772 aa  1577    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.913059  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02007  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  67.75 
 
 		 785 aa  1074    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0827  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  55.73 
 
 		 771 aa  857    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.13916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2184  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  71.06 
 
 		 789 aa  1134    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.19674  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3831  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  66.45 
 
 		 792 aa  1061    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.436537  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3944  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  66.45 
 
 		 792 aa  1061    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.134026 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7168  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  65.07 
 
 		 790 aa  1068    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.901999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5522  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  49.42 
 
 		 791 aa  728    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.291941 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1323  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  53.7 
 
 		 764 aa  821    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.659121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5038  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  63.84 
 
 		 782 aa  1023    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0656  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  74.87 
 
 		 777 aa  1219    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.844921  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0593  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  65.98 
 
 		 777 aa  1079    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0307  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.56 
 
 		 790 aa  674    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0282  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  65.46 
 
 		 790 aa  1069    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0297  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.36 
 
 		 752 aa  697    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0437387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2202  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  71.48 
 
 		 791 aa  1173    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24917  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4014  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  59.23 
 
 		 774 aa  953    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3617  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  63.28 
 
 		 822 aa  1049    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.278037 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2243  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  56.28 
 
 		 764 aa  848    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0946349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4888  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  56.4 
 
 		 776 aa  876    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.601528 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2274  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  57.12 
 
 		 771 aa  879    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4472  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  74.48 
 
 		 782 aa  1198    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155704  normal  0.267141 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1202  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.48 
 
 		 780 aa  733    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2695  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  56.75 
 
 		 761 aa  878    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0527527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4068  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  64.81 
 
 		 790 aa  1049    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2161  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.78 
 
 		 784 aa  729    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2872  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  56.6 
 
 		 804 aa  890    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.347054  normal  0.96919 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5087  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  54.46 
 
 		 761 aa  847    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.608301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3180  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  61.39 
 
 		 778 aa  951    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.344257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1299  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.86 
 
 		 368 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3810  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.57 
 
 		 356 aa  307  5.0000000000000004e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1489  xenobiotic reductase, putative  47.29 
 
 		 368 aa  307  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2577  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.19 
 
 		 355 aa  307  6e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00218003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0611  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.28 
 
 		 370 aa  303  7.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.316093 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0966  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.86 
 
 		 369 aa  303  8.000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104436  normal  0.525672 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0702  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase protein  46.99 
 
 		 370 aa  302  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00458318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1165  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.19 
 
 		 356 aa  301  3e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1456  FMN oxidoreductase  49 
 
 		 354 aa  300  5e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0196412  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3342  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  46.72 
 
 		 370 aa  300  8e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1371  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  47.43 
 
 		 365 aa  299  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0652  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.99 
 
 		 370 aa  299  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0749879 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7562  NADPH dehydrogenase  46.13 
 
 		 370 aa  295  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3946  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45 
 
 		 361 aa  296  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.181914  normal  0.508638 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4902  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.59 
 
 		 358 aa  296  1e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4139  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.87 
 
 		 368 aa  294  4e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4243  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.87 
 
 		 368 aa  293  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5482  monooxygenase, FAD-binding  41.75 
 
 		 377 aa  293  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.942938  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1866  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.76 
 
 		 358 aa  291  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2211  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  46.76 
 
 		 358 aa  291  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4320  monooxygenase FAD-binding protein  43.67 
 
 		 400 aa  291  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2817  monooxygenase FAD-binding protein  41.61 
 
 		 712 aa  291  4e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.606317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1715  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.6 
 
 		 359 aa  290  1e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.148075  normal  0.0532635 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3775  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.3 
 
 		 379 aa  289  2e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.797165  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1478  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.73 
 
 		 368 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.139205 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3318  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.94 
 
 		 356 aa  288  4e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2178  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.1 
 
 		 354 aa  286  1.0000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7497  putative aromatic-ring hydroxylase  42.36 
 
 		 379 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1036  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.73 
 
 		 368 aa  286  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2083  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.48 
 
 		 353 aa  285  3.0000000000000004e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1398  putative FMN oxidoreductase  45.71 
 
 		 368 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16260  putative FMN oxidoreductase  45.14 
 
 		 368 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1086  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.44 
 
 		 368 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.607736 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0655  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.1 
 
 		 367 aa  283  7.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.208433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2779  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.89 
 
 		 354 aa  283  8.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.487113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33410  NADH:flavin oxidoreductase  45.81 
 
 		 359 aa  283  1e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.374092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0211  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  44.89 
 
 		 370 aa  281  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2405  xenobiotic reductase A  42.36 
 
 		 363 aa  281  4e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2190  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.36 
 
 		 363 aa  281  5e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0272574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1577  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase  46.76 
 
 		 370 aa  281  5e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0241871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4082  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  44.89 
 
 		 370 aa  281  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2608  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.43 
 
 		 371 aa  280  6e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.103879 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4010  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  44.6 
 
 		 370 aa  280  8e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39430  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.71 
 
 		 368 aa  280  9e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5101  monooxygenase, FAD-binding  41.1 
 
 		 381 aa  279  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.889142  normal  0.467913 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1699  xenobiotic reductase A  42.82 
 
 		 365 aa  279  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265579  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2134  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.92 
 
 		 353 aa  278  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000241293  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4859  putative NADH-depentdent flavin oxidoreductase  41.89 
 
 		 371 aa  279  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.563143  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0171  monooxygenase, FAD-binding  40.41 
 
 		 381 aa  278  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0567  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.67 
 
 		 360 aa  276  7e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0881  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.8 
 
 		 387 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427162  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7390  xenobiotic reductase A  41.04 
 
 		 363 aa  274  4.0000000000000004e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1281  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.63 
 
 		 363 aa  274  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4317  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.4 
 
 		 371 aa  273  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.529311  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4137  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.35 
 
 		 363 aa  273  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3253  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.7 
 
 		 370 aa  273  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1254  xenobiotic reductase A  40.35 
 
 		 363 aa  272  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3235  normal  0.321595 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4903  monooxygenase, FAD-binding  38.99 
 
 		 379 aa  272  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0005  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase  45.56 
 
 		 370 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0063  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.99 
 
 		 370 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5918  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.59 
 
 		 352 aa  271  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00164429 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3913  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.35 
 
 		 363 aa  270  5e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3060  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.27 
 
 		 376 aa  270  7e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.455155  normal  0.826511 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0144  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.13 
 
 		 367 aa  269  1e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0715  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase family protein  40.92 
 
 		 365 aa  270  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.489419 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1173  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.94 
 
 		 370 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1514  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.74 
 
 		 371 aa  267  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4973  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.79 
 
 		 365 aa  266  8e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.348713  normal  0.0595836 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0720  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.22 
 
 		 367 aa  266  8.999999999999999e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.90981 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>