177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5482 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5482  monooxygenase, FAD-binding  100 
 
 
377 aa  778    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.942938  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4123  monooxygenase, FAD-binding  64.61 
 
 
374 aa  503  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.058408  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4903  monooxygenase, FAD-binding  63.71 
 
 
379 aa  500  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5101  monooxygenase, FAD-binding  44.54 
 
 
381 aa  324  1e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.889142  normal  0.467913 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1202  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.01 
 
 
780 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7497  putative aromatic-ring hydroxylase  43.77 
 
 
379 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0171  monooxygenase, FAD-binding  40.97 
 
 
381 aa  302  6.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2683  NADPH dehydrogenase  42.36 
 
 
782 aa  302  7.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.292135 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7168  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  40.93 
 
 
790 aa  299  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.901999  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5087  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  41.16 
 
 
761 aa  298  8e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.608301  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0282  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  40.93 
 
 
790 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4068  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  40.93 
 
 
790 aa  298  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3831  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  41.34 
 
 
792 aa  298  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.436537  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3944  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  41.34 
 
 
792 aa  298  1e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.134026 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2111  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.34 
 
 
775 aa  297  2e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.452402 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2274  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  41.04 
 
 
771 aa  295  6e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2202  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  39.95 
 
 
791 aa  295  7e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24917  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0827  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  39.58 
 
 
771 aa  295  7e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.13916  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02007  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  40.68 
 
 
785 aa  293  4e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1826  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  41.75 
 
 
772 aa  293  5e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.913059  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2695  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  39.68 
 
 
761 aa  291  9e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0527527  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4888  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.02 
 
 
776 aa  290  3e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.601528 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0656  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  40.41 
 
 
777 aa  288  8e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.844921  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2184  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  39.44 
 
 
789 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.19674  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4472  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  39.54 
 
 
782 aa  285  7e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155704  normal  0.267141 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5522  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  40.94 
 
 
791 aa  285  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.291941 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3779  putative monooxygenase, FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  41.82 
 
 
386 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1323  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  39.42 
 
 
764 aa  283  4.0000000000000003e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.659121  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0307  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  39.74 
 
 
790 aa  281  2e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2243  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  38.62 
 
 
764 aa  277  2e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0946349  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3617  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  38.66 
 
 
822 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.278037 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0297  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  39.58 
 
 
752 aa  274  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0437387  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3180  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  37.89 
 
 
778 aa  273  3e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.344257  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4014  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  37.92 
 
 
774 aa  273  3e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0593  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  37.97 
 
 
777 aa  272  6e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3101  monooxygenase, FAD-binding  40.1 
 
 
384 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5038  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  38.6 
 
 
782 aa  270  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2161  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.05 
 
 
784 aa  269  5.9999999999999995e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172901  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2817  monooxygenase FAD-binding protein  41.84 
 
 
712 aa  265  7e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.606317  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2872  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  36.08 
 
 
804 aa  255  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.347054  normal  0.96919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4320  monooxygenase FAD-binding protein  39.37 
 
 
400 aa  236  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2592  monooxygenase, FAD-binding  38.1 
 
 
404 aa  231  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1224  monooxygenase FAD-binding  36.62 
 
 
413 aa  223  3e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0821266  normal  0.977549 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1385  monooxygenase FAD-binding  36.34 
 
 
413 aa  223  6e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1109  monooxygenase FAD-binding  37.36 
 
 
413 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.529688 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4331  monooxygenase FAD-binding  34.22 
 
 
451 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143503  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2043  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase and related FAD-dependent oxidoreductases-like  27.5 
 
 
479 aa  84  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4393  monooxygenase FAD-binding  26.01 
 
 
377 aa  73.9  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2680  monooxygenase, FAD-binding  26.65 
 
 
384 aa  67.8  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.156834  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2343  monooxygenase FAD-binding protein  25.69 
 
 
392 aa  63.5  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  28.36 
 
 
400 aa  63.5  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  25.08 
 
 
373 aa  62  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  25.68 
 
 
392 aa  59.7  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  23.45 
 
 
397 aa  58.9  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5812  monooxygenase, FAD-binding protein  27.11 
 
 
408 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2779  monooxygenase FAD-binding  26.61 
 
 
411 aa  57  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0421282 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  29.83 
 
 
400 aa  57  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0355  salicylate hydroxylase  26.44 
 
 
427 aa  56.6  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19150  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  27.54 
 
 
351 aa  55.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0319604  normal  0.370849 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0733  hypothetical protein  27.07 
 
 
369 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1002  hypothetical protein  27.07 
 
 
369 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.132346  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31126  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  22.39 
 
 
411 aa  54.7  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0982  monooxygenase FAD-binding  27.96 
 
 
369 aa  54.3  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240273  decreased coverage  0.000117397 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1462  monooxygenase FAD-binding  24.46 
 
 
390 aa  54.3  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000001589  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3328  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.57 
 
 
407 aa  53.5  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150159  normal  0.347251 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4138  monooxygenase, FAD-binding protein  26.37 
 
 
408 aa  53.9  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145497  normal  0.0296411 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  27.78 
 
 
398 aa  53.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3612  monooxygenase FAD-binding  26.29 
 
 
430 aa  53.5  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0302868  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  25.74 
 
 
371 aa  53.1  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  28.03 
 
 
408 aa  53.5  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1625  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  24.11 
 
 
395 aa  53.1  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3438  monooxygenase, FAD-binding  26.36 
 
 
399 aa  53.1  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  24.32 
 
 
393 aa  53.1  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2552  monooxygenase FAD-binding protein  24.8 
 
 
376 aa  52.8  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  26.09 
 
 
386 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  25.7 
 
 
378 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3144  salicylate hydroxylase  26.89 
 
 
400 aa  52.4  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403778  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3140  hypothetical protein  21.11 
 
 
376 aa  52.4  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3547  hypothetical protein  23.85 
 
 
374 aa  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0588  monooxygenase FAD-binding  28.02 
 
 
397 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395887  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2957  monooxygenase FAD-binding  36 
 
 
372 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.00000079656 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2927  hypothetical protein  26.17 
 
 
424 aa  51.2  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.27992  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5237  putative salicylate 1-monooxygenase  26.92 
 
 
399 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.192496 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2786  monooxygenase FAD-binding protein  25.31 
 
 
408 aa  51.2  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00390244  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3524  monooxygenase FAD-binding protein  25.91 
 
 
401 aa  50.8  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894226  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  25.99 
 
 
389 aa  50.8  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4777  monooxygenase FAD-binding protein  40 
 
 
496 aa  50.4  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.712751  hitchhiker  0.00463722 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2480  monooxygenase FAD-binding  27.63 
 
 
395 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  26.09 
 
 
391 aa  50.1  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0896  monooxygenase, FAD-binding  28.35 
 
 
389 aa  50.4  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  40.28 
 
 
395 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  23.92 
 
 
383 aa  50.1  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26790  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  27.87 
 
 
398 aa  49.7  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15237  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  25.41 
 
 
377 aa  49.7  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  25.59 
 
 
403 aa  49.7  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56402  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  22.39 
 
 
426 aa  49.3  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.476468  normal  0.198075 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  23.27 
 
 
374 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21010  putative FAD-dependent monooxygenase  39.13 
 
 
388 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.12929  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1494  monooxygenase, FAD-binding  25.46 
 
 
386 aa  48.5  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.379752  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5376  hypothetical protein  27.08 
 
 
438 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.819759 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>