More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0656 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc1826  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  74.87 
 
 
772 aa  1219    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.913059  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02007  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  66.2 
 
 
785 aa  1043    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4014  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  58.69 
 
 
774 aa  942    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2111  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  64.77 
 
 
775 aa  1041    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.452402 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1202  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.61 
 
 
780 aa  724    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2184  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  70.06 
 
 
789 aa  1118    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.19674  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2161  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.16 
 
 
784 aa  704    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172901  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3617  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  61.36 
 
 
822 aa  1015    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.278037 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5087  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  54.12 
 
 
761 aa  833    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.608301  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0827  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  53.31 
 
 
771 aa  835    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.13916  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3944  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  64.74 
 
 
792 aa  1028    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.134026 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0297  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.7 
 
 
752 aa  652    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0437387  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0307  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.9 
 
 
790 aa  649    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1323  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  53.98 
 
 
764 aa  828    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.659121  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5522  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  48.64 
 
 
791 aa  697    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.291941 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0593  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  63.66 
 
 
777 aa  1036    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0282  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  61.79 
 
 
790 aa  1016    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4888  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.17 
 
 
776 aa  853    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.601528 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4068  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  62.18 
 
 
790 aa  1010    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2683  NADPH dehydrogenase  48.19 
 
 
782 aa  720    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.292135 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2202  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  68.97 
 
 
791 aa  1136    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24917  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2243  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  56.25 
 
 
764 aa  850    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0946349  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7168  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  61.66 
 
 
790 aa  1014    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.901999  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2274  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  55.22 
 
 
771 aa  858    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3831  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  64.74 
 
 
792 aa  1028    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.436537  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2872  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  56.12 
 
 
804 aa  890    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.347054  normal  0.96919 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2695  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  56.53 
 
 
761 aa  872    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0527527  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3180  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  59.82 
 
 
778 aa  929    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.344257  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0656  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  100 
 
 
777 aa  1602    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.844921  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4472  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  73.78 
 
 
782 aa  1191    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155704  normal  0.267141 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5038  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  63.89 
 
 
782 aa  1003    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2577  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.74 
 
 
355 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00218003  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0966  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.61 
 
 
369 aa  295  2e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104436  normal  0.525672 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1866  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.76 
 
 
358 aa  294  4e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2211  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  46.76 
 
 
358 aa  294  4e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3810  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.39 
 
 
356 aa  292  2e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3775  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.21 
 
 
379 aa  289  1e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.797165  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5482  monooxygenase, FAD-binding  40.41 
 
 
377 aa  288  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.942938  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2817  monooxygenase FAD-binding protein  41.73 
 
 
712 aa  288  2e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.606317  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0702  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase protein  44.29 
 
 
370 aa  287  4e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00458318  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1299  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.85 
 
 
368 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3318  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.11 
 
 
356 aa  285  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470723  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1489  xenobiotic reductase, putative  43.02 
 
 
368 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4320  monooxygenase FAD-binding protein  43.58 
 
 
400 aa  284  5.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1165  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.79 
 
 
356 aa  284  5.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7562  NADPH dehydrogenase  42.29 
 
 
370 aa  284  5.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2083  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.92 
 
 
353 aa  283  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0611  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.73 
 
 
370 aa  283  1e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.316093 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3342  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  42.12 
 
 
370 aa  281  4e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4859  putative NADH-depentdent flavin oxidoreductase  41.45 
 
 
371 aa  281  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.563143  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1371  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  43.06 
 
 
365 aa  280  5e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2178  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.51 
 
 
354 aa  280  7e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0652  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.9 
 
 
370 aa  278  2e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0749879 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1398  putative FMN oxidoreductase  43.06 
 
 
368 aa  279  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4902  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.45 
 
 
358 aa  277  6e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16260  putative FMN oxidoreductase  42.49 
 
 
368 aa  277  6e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4317  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.71 
 
 
371 aa  276  9e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.529311  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3946  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41 
 
 
361 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.181914  normal  0.508638 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1919  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.63 
 
 
356 aa  275  3e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.957099 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7497  putative aromatic-ring hydroxylase  40.3 
 
 
379 aa  273  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1478  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.06 
 
 
368 aa  272  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.139205 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4243  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.78 
 
 
368 aa  272  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2134  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.94 
 
 
353 aa  272  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000241293  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2608  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.43 
 
 
371 aa  271  2e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.103879 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1086  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.06 
 
 
368 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.607736 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2779  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.06 
 
 
354 aa  271  4e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.487113  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4139  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.49 
 
 
368 aa  271  5e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1036  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.46 
 
 
368 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1577  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase  43.24 
 
 
370 aa  269  1e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0241871  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1715  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.33 
 
 
359 aa  269  1e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.148075  normal  0.0532635 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1456  FMN oxidoreductase  44.19 
 
 
354 aa  267  5.999999999999999e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0196412  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0211  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  40.11 
 
 
370 aa  267  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4082  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  40.11 
 
 
370 aa  266  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4010  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  40.11 
 
 
370 aa  266  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5101  monooxygenase, FAD-binding  38.9 
 
 
381 aa  265  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.889142  normal  0.467913 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3253  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.97 
 
 
370 aa  265  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0144  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.34 
 
 
367 aa  264  4.999999999999999e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39430  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.93 
 
 
368 aa  264  4.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3060  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.97 
 
 
376 aa  264  4.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.455155  normal  0.826511 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0567  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.87 
 
 
360 aa  264  6e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7390  xenobiotic reductase A  38.73 
 
 
363 aa  263  8e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0171  monooxygenase, FAD-binding  39.07 
 
 
381 aa  263  8.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0090  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.83 
 
 
370 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.552825 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0655  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.51 
 
 
367 aa  261  4e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.208433  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2983  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.55 
 
 
370 aa  261  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0063  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.26 
 
 
370 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0072  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.55 
 
 
370 aa  261  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2825  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  37.64 
 
 
364 aa  259  1e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5918  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.15 
 
 
352 aa  259  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00164429 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0072  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.4 
 
 
370 aa  258  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4123  monooxygenase, FAD-binding  38.11 
 
 
374 aa  258  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.058408  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1173  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.88 
 
 
370 aa  259  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4903  monooxygenase, FAD-binding  37.19 
 
 
379 aa  258  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2687  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.69 
 
 
373 aa  258  4e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.340404 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0071  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.97 
 
 
370 aa  257  4e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282645  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2592  monooxygenase, FAD-binding  41.4 
 
 
404 aa  257  5e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33410  NADH:flavin oxidoreductase  42.7 
 
 
359 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.374092  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2326  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.41 
 
 
365 aa  256  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000134358 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3719  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.76 
 
 
354 aa  256  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.717818  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3776  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.48 
 
 
352 aa  256  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.21839  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>