More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3831 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_2683  NADPH dehydrogenase  52.71 
 
 
782 aa  788    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.292135 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4068  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  75.63 
 
 
790 aa  1236    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3831  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  100 
 
 
792 aa  1645    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.436537  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1826  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  66.45 
 
 
772 aa  1076    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.913059  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02007  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  90.15 
 
 
785 aa  1448    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0656  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  64.74 
 
 
777 aa  1053    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.844921  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2872  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  64.96 
 
 
804 aa  1032    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.347054  normal  0.96919 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2111  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  68.91 
 
 
775 aa  1100    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.452402 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4014  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  64.88 
 
 
774 aa  1023    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7168  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  75.63 
 
 
790 aa  1250    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.901999  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2184  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  76.09 
 
 
789 aa  1195    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.19674  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5087  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  57.5 
 
 
761 aa  889    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.608301  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0297  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.13 
 
 
752 aa  710    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0437387  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5038  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  66.19 
 
 
782 aa  1041    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5522  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  52.08 
 
 
791 aa  764    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.291941 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1323  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  56.72 
 
 
764 aa  882    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.659121  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4472  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  73.11 
 
 
782 aa  1156    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155704  normal  0.267141 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0827  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  57.98 
 
 
771 aa  918    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.13916  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0307  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.61 
 
 
790 aa  704    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0593  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  65.27 
 
 
777 aa  1063    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0282  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  76.38 
 
 
790 aa  1253    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2202  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  74.72 
 
 
791 aa  1214    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24917  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2243  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  59.35 
 
 
764 aa  924    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0946349  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3180  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  69.62 
 
 
778 aa  1085    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.344257  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2274  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  60.92 
 
 
771 aa  954    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4888  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  59.01 
 
 
776 aa  926    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.601528 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1202  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.81 
 
 
780 aa  753    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2695  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  60.91 
 
 
761 aa  931    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0527527  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3617  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  63.48 
 
 
822 aa  1038    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.278037 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2161  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.81 
 
 
784 aa  739    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172901  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3944  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  100 
 
 
792 aa  1645    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.134026 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2577  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.89 
 
 
355 aa  326  1e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00218003  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0611  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.88 
 
 
370 aa  313  7.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.316093 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0652  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.01 
 
 
370 aa  310  5e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0749879 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3318  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.35 
 
 
356 aa  309  1.0000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470723  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2083  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.03 
 
 
353 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1165  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.66 
 
 
356 aa  308  3e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2134  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.31 
 
 
353 aa  307  6e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000241293  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3810  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.2 
 
 
356 aa  305  3.0000000000000004e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3946  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.9 
 
 
361 aa  303  1e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.181914  normal  0.508638 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0702  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase protein  45.61 
 
 
370 aa  298  3e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00458318  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1299  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.02 
 
 
368 aa  298  3e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5482  monooxygenase, FAD-binding  41.34 
 
 
377 aa  298  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.942938  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1456  FMN oxidoreductase  46.2 
 
 
354 aa  296  1e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0196412  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1489  xenobiotic reductase, putative  45.45 
 
 
368 aa  295  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1036  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.59 
 
 
368 aa  295  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1866  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.91 
 
 
358 aa  295  2e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2211  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  46.91 
 
 
358 aa  295  2e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1478  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.31 
 
 
368 aa  294  5e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.139205 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2178  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.94 
 
 
354 aa  293  9e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2817  monooxygenase FAD-binding protein  42.93 
 
 
712 aa  293  9e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.606317  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4139  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.74 
 
 
368 aa  293  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4902  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.35 
 
 
358 aa  292  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39430  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.87 
 
 
368 aa  291  5.0000000000000004e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4320  monooxygenase FAD-binding protein  42.35 
 
 
400 aa  290  7e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1398  putative FMN oxidoreductase  44.73 
 
 
368 aa  290  7e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0881  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.15 
 
 
387 aa  290  8e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427162  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1371  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  44.57 
 
 
365 aa  289  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1086  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.45 
 
 
368 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.607736 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7562  NADPH dehydrogenase  42.45 
 
 
370 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0567  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.88 
 
 
360 aa  286  1.0000000000000001e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5152  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.26 
 
 
402 aa  285  2.0000000000000002e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.506214  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3342  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  43.02 
 
 
370 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2523  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.71 
 
 
372 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0620053  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2248  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.71 
 
 
372 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.674578 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2779  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.19 
 
 
354 aa  284  4.0000000000000003e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.487113  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2113  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.05 
 
 
370 aa  284  5.000000000000001e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4243  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.6 
 
 
368 aa  284  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16260  putative FMN oxidoreductase  43.55 
 
 
368 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0991  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.81 
 
 
387 aa  283  8.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0239278  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5918  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.01 
 
 
352 aa  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00164429 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4317  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.43 
 
 
371 aa  283  9e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.529311  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1577  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase  44.6 
 
 
370 aa  282  1e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0241871  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0148  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.16 
 
 
357 aa  283  1e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3253  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.59 
 
 
370 aa  282  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0966  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.19 
 
 
369 aa  281  3e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104436  normal  0.525672 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7390  xenobiotic reductase A  43.77 
 
 
363 aa  281  4e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0888  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44 
 
 
365 aa  281  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2608  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.63 
 
 
371 aa  280  6e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.103879 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2405  xenobiotic reductase A  42.65 
 
 
363 aa  280  7e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5174  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.88 
 
 
387 aa  278  3e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33410  NADH:flavin oxidoreductase  44.13 
 
 
359 aa  278  3e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.374092  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2687  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.61 
 
 
373 aa  278  3e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.340404 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2205  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.61 
 
 
372 aa  278  3e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.517852 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3060  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.74 
 
 
376 aa  278  4e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.455155  normal  0.826511 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2190  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.07 
 
 
363 aa  277  5e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0272574  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4395  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.36 
 
 
365 aa  277  6e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1919  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.51 
 
 
356 aa  277  6e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.957099 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0090  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.32 
 
 
370 aa  276  7e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.552825 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4859  putative NADH-depentdent flavin oxidoreductase  40.23 
 
 
371 aa  276  7e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.563143  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3927  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.47 
 
 
370 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0013465  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1715  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.7 
 
 
359 aa  276  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.148075  normal  0.0532635 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1573  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.2 
 
 
365 aa  276  1.0000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0211  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  42.17 
 
 
370 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4010  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  42.17 
 
 
370 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0005  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase  44.03 
 
 
370 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0715  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase family protein  42.94 
 
 
365 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.489419 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4082  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  42.17 
 
 
370 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0063  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.59 
 
 
370 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0072  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.03 
 
 
370 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>