More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0715 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4395  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  94.25 
 
 
365 aa  703    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1736  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  83.01 
 
 
369 aa  634    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414914  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0715  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase family protein  100 
 
 
365 aa  741    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.489419 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4322  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  82.74 
 
 
369 aa  631  1e-180  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.700048  normal  0.249801 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4093  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  82.47 
 
 
369 aa  631  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4179  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  82.19 
 
 
369 aa  632  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.888395 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3701  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  82.19 
 
 
369 aa  632  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4273  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  82.47 
 
 
369 aa  631  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3244  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  81.92 
 
 
369 aa  627  1e-179  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.324542  normal  0.664985 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2190  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  81.77 
 
 
363 aa  625  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0272574  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3913  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  80.66 
 
 
363 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2405  xenobiotic reductase A  80.39 
 
 
363 aa  619  1e-176  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4137  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  80.11 
 
 
363 aa  617  1e-176  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1254  xenobiotic reductase A  79.83 
 
 
363 aa  615  1e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3235  normal  0.321595 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1281  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  80.11 
 
 
363 aa  616  1e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1551  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  79.01 
 
 
362 aa  599  1e-170  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0547796  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2716  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  78.45 
 
 
362 aa  594  1e-169  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1699  xenobiotic reductase A  78.36 
 
 
365 aa  594  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265579  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2486  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  79.18 
 
 
365 aa  587  1e-166  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0978  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  78.36 
 
 
365 aa  580  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2296  NADH:flavin oxidoreductase  78.36 
 
 
365 aa  580  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.879086  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1063  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  78.36 
 
 
365 aa  580  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0523  xenobiotic reductase A  78.08 
 
 
365 aa  578  1e-164  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.483716  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1405  xenobiotic reductase A  78.08 
 
 
365 aa  578  1e-164  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0125  xenobiotic reductase A  78.08 
 
 
365 aa  578  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1489  xenobiotic reductase A  78.08 
 
 
365 aa  578  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.812731  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2489  xenobiotic reductase, putative  71.27 
 
 
366 aa  558  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2429  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  69.78 
 
 
370 aa  548  1e-155  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786429  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2220  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  70.05 
 
 
370 aa  549  1e-155  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.708176  normal  0.437411 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2296  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  70.05 
 
 
370 aa  549  1e-155  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.559957  normal  0.67017 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2652  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  71.7 
 
 
368 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.357683  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2530  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  71.43 
 
 
368 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.805138  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1814  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  71.7 
 
 
368 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.284682  normal  0.0316292 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2537  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  71.43 
 
 
368 aa  543  1e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.693892  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2291  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  69.23 
 
 
368 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000084765  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7390  xenobiotic reductase A  70.68 
 
 
363 aa  537  9.999999999999999e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0888  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  71.23 
 
 
365 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0369  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  72.38 
 
 
368 aa  531  1e-150  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.014148  normal  0.044055 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5152  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  62.84 
 
 
402 aa  486  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.506214  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0567  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  58.68 
 
 
360 aa  414  1e-114  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4220  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.79 
 
 
364 aa  399  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0984  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.59 
 
 
387 aa  354  2e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3810  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.33 
 
 
356 aa  348  7e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2211  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  51.46 
 
 
358 aa  312  4.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1866  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.46 
 
 
358 aa  312  4.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2577  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.99 
 
 
355 aa  309  4e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00218003  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2083  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.86 
 
 
353 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1456  FMN oxidoreductase  47.32 
 
 
354 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0196412  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2113  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.22 
 
 
370 aa  303  3.0000000000000004e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3318  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.8 
 
 
356 aa  301  1e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470723  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2428  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.48 
 
 
396 aa  298  9e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4435  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46 
 
 
355 aa  298  1e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2134  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.87 
 
 
353 aa  298  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000241293  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1398  putative FMN oxidoreductase  46.72 
 
 
368 aa  296  4e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1036  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.38 
 
 
368 aa  296  4e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4139  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.82 
 
 
368 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16260  putative FMN oxidoreductase  46.15 
 
 
368 aa  295  9e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0148  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45 
 
 
357 aa  294  1e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1489  xenobiotic reductase, putative  44.82 
 
 
368 aa  293  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1299  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.54 
 
 
368 aa  294  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3890  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.81 
 
 
397 aa  293  3e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.833244  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1371  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  45.51 
 
 
365 aa  293  3e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1919  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.9 
 
 
356 aa  293  4e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.957099 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0361  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.66 
 
 
355 aa  292  5e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000624901 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0293  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.44 
 
 
354 aa  291  1e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.818781  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1478  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.26 
 
 
368 aa  289  6e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.139205 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2779  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.08 
 
 
354 aa  288  7e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.487113  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3946  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.3 
 
 
361 aa  288  9e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.181914  normal  0.508638 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1086  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.98 
 
 
368 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.607736 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4243  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.98 
 
 
368 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0381  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.22 
 
 
362 aa  287  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2202  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  42.65 
 
 
791 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24917  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0702  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase protein  45.13 
 
 
370 aa  282  7.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00458318  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1527  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.75 
 
 
368 aa  281  1e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39430  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.26 
 
 
368 aa  281  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3524  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.61 
 
 
366 aa  281  2e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.110487  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0966  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.79 
 
 
369 aa  280  2e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104436  normal  0.525672 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4472  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  45.24 
 
 
782 aa  281  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155704  normal  0.267141 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1165  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.73 
 
 
356 aa  280  3e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3776  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.27 
 
 
352 aa  280  4e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.21839  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2111  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.5 
 
 
775 aa  279  5e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.452402 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2178  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.46 
 
 
354 aa  278  8e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3859  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.69 
 
 
352 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2523  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.6 
 
 
372 aa  277  3e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0620053  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3719  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.69 
 
 
354 aa  276  3e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.717818  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2248  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.6 
 
 
372 aa  277  3e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.674578 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0991  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.78 
 
 
387 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0239278  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4973  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.66 
 
 
365 aa  276  4e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.348713  normal  0.0595836 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2825  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.05 
 
 
364 aa  276  5e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0611  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.29 
 
 
370 aa  276  5e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.316093 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4859  putative NADH-depentdent flavin oxidoreductase  42.54 
 
 
371 aa  275  9e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.563143  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0652  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.01 
 
 
370 aa  272  6e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0749879 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2205  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.65 
 
 
372 aa  272  7e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.517852 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2520  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.05 
 
 
364 aa  271  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984471  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1577  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase  43.29 
 
 
370 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0241871  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1059  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.55 
 
 
386 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0160422  normal  0.54744 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1826  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  40.92 
 
 
772 aa  270  4e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.913059  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33410  NADH:flavin oxidoreductase  43.73 
 
 
359 aa  270  4e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.374092  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5918  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.06 
 
 
352 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00164429 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1709  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.13 
 
 
369 aa  269  7e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.069385  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>