More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2428 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2428  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  100 
 
 
396 aa  811    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3890  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  64.27 
 
 
397 aa  479  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.833244  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0984  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.86 
 
 
387 aa  349  4e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0567  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.38 
 
 
360 aa  325  7e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2716  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.66 
 
 
362 aa  319  7e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2405  xenobiotic reductase A  45.63 
 
 
363 aa  315  7e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2190  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.63 
 
 
363 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0272574  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7390  xenobiotic reductase A  46.3 
 
 
363 aa  313  3.9999999999999997e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1551  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.84 
 
 
362 aa  311  1e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0547796  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4220  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.74 
 
 
364 aa  311  1e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4395  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.36 
 
 
365 aa  310  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4322  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.54 
 
 
369 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.700048  normal  0.249801 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0715  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase family protein  45.48 
 
 
365 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.489419 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3701  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.54 
 
 
369 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4179  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.54 
 
 
369 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.888395 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2220  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.41 
 
 
370 aa  308  9e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.708176  normal  0.437411 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2296  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.41 
 
 
370 aa  308  9e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.559957  normal  0.67017 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3244  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.81 
 
 
369 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.324542  normal  0.664985 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2530  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.21 
 
 
368 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.805138  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1736  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.54 
 
 
369 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414914  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2652  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.21 
 
 
368 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.357683  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2537  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.21 
 
 
368 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.693892  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1814  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.93 
 
 
368 aa  307  3e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.284682  normal  0.0316292 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1281  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.08 
 
 
363 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1254  xenobiotic reductase A  44.81 
 
 
363 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3235  normal  0.321595 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4093  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.99 
 
 
369 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4273  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.99 
 
 
369 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2429  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.29 
 
 
370 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786429  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3913  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.54 
 
 
363 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1699  xenobiotic reductase A  44.96 
 
 
365 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265579  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0888  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.08 
 
 
365 aa  301  9e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4137  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.26 
 
 
363 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2291  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.01 
 
 
368 aa  301  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000084765  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2489  xenobiotic reductase, putative  43.29 
 
 
366 aa  298  9e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1063  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  45.23 
 
 
365 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1405  xenobiotic reductase A  45.23 
 
 
365 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2296  NADH:flavin oxidoreductase  45.23 
 
 
365 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.879086  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1489  xenobiotic reductase A  45.23 
 
 
365 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.812731  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0125  xenobiotic reductase A  45.23 
 
 
365 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0978  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  45.23 
 
 
365 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0523  xenobiotic reductase A  45.23 
 
 
365 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.483716  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0369  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.66 
 
 
368 aa  291  1e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.014148  normal  0.044055 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5152  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.26 
 
 
402 aa  289  6e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.506214  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3810  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.69 
 
 
356 aa  288  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2486  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.6 
 
 
365 aa  283  5.000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2779  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.02 
 
 
354 aa  281  2e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.487113  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3318  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.69 
 
 
356 aa  280  4e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470723  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2577  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.71 
 
 
355 aa  278  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00218003  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1489  xenobiotic reductase, putative  43.19 
 
 
368 aa  272  7e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1371  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  44.03 
 
 
365 aa  272  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1299  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.61 
 
 
368 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4435  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.19 
 
 
355 aa  271  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33410  NADH:flavin oxidoreductase  43.15 
 
 
359 aa  266  5.999999999999999e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.374092  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2178  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.35 
 
 
354 aa  266  7e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1398  putative FMN oxidoreductase  43.1 
 
 
368 aa  263  4e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3946  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.65 
 
 
361 aa  263  4.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.181914  normal  0.508638 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16260  putative FMN oxidoreductase  42.53 
 
 
368 aa  260  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2394  NADH--flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.2 
 
 
354 aa  259  5.0000000000000005e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1165  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.35 
 
 
356 aa  257  2e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39430  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.32 
 
 
368 aa  257  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2970  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.53 
 
 
404 aa  256  5e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.790644 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0381  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.94 
 
 
362 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5918  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.6 
 
 
352 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00164429 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0966  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.44 
 
 
369 aa  252  9.000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104436  normal  0.525672 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1919  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.49 
 
 
356 aa  251  2e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.957099 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4243  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  39.71 
 
 
368 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4139  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.4 
 
 
368 aa  250  4e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1866  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.44 
 
 
358 aa  249  5e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2211  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  42.44 
 
 
358 aa  249  5e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1891  NADPH dehydrogenase NamA  41.62 
 
 
345 aa  249  6e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2038  NADPH dehydrogenase NamA  41.62 
 
 
345 aa  249  6e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1853  NADPH dehydrogenase NamA  41.64 
 
 
345 aa  248  9e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1843  NADPH dehydrogenase NamA  41.91 
 
 
345 aa  248  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0148  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.06 
 
 
357 aa  247  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1036  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.4 
 
 
368 aa  247  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2111  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  39.6 
 
 
775 aa  248  2e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.452402 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2113  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  39.44 
 
 
370 aa  247  2e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1478  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  39.13 
 
 
368 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.139205 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2106  NADPH dehydrogenase NamA  41.36 
 
 
345 aa  246  4e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114267  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1888  NADPH dehydrogenase NamA  41.64 
 
 
345 aa  246  4e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0520303  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0361  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.61 
 
 
355 aa  246  6e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000624901 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1086  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  38.97 
 
 
368 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.607736 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2631  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  38.24 
 
 
418 aa  245  8e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2070  NADPH dehydrogenase NamA  41.08 
 
 
345 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1456  FMN oxidoreductase  41.28 
 
 
354 aa  243  5e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0196412  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2139  NADPH dehydrogenase NamA  40.79 
 
 
345 aa  243  6e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3839  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.66 
 
 
352 aa  243  6e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.431413 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2028  NADPH dehydrogenase NamA  40 
 
 
345 aa  242  7e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1529  NADPH dehydrogenase NamA  41.04 
 
 
346 aa  241  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3281  NADPH dehydrogenase NamA  40.23 
 
 
345 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0293  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  39.83 
 
 
354 aa  239  6.999999999999999e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.818781  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4014  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  38.11 
 
 
774 aa  238  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2134  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.41 
 
 
353 aa  237  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000241293  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4902  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.62 
 
 
358 aa  237  3e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2083  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  39.6 
 
 
353 aa  236  4e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2882  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  38.81 
 
 
360 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.458184  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1718  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.47 
 
 
355 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.404463  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3775  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.34 
 
 
379 aa  235  8e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.797165  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1715  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.5 
 
 
359 aa  236  8e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.148075  normal  0.0532635 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0827  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  39.17 
 
 
771 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.13916  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>