More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3701 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3244  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  95.12 
 
 
369 aa  718    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.324542  normal  0.664985 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1736  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  96.48 
 
 
369 aa  728    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414914  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4093  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  95.12 
 
 
369 aa  719    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4179  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  100 
 
 
369 aa  748    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.888395 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4322  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  94.31 
 
 
369 aa  715    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.700048  normal  0.249801 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3701  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  100 
 
 
369 aa  748    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4273  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  95.12 
 
 
369 aa  719    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4395  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  82.19 
 
 
365 aa  632  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1699  xenobiotic reductase A  84.38 
 
 
365 aa  631  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265579  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0715  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase family protein  82.19 
 
 
365 aa  632  1e-180  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.489419 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2296  NADH:flavin oxidoreductase  84.11 
 
 
365 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.879086  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0978  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  84.11 
 
 
365 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1063  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  84.11 
 
 
365 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1489  xenobiotic reductase A  83.84 
 
 
365 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.812731  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0523  xenobiotic reductase A  83.84 
 
 
365 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.483716  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1405  xenobiotic reductase A  83.84 
 
 
365 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0125  xenobiotic reductase A  83.84 
 
 
365 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1254  xenobiotic reductase A  77.13 
 
 
363 aa  597  1e-170  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3235  normal  0.321595 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1281  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  77.41 
 
 
363 aa  598  1e-170  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2190  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  77.69 
 
 
363 aa  600  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0272574  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2405  xenobiotic reductase A  77.41 
 
 
363 aa  597  1e-169  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4137  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  76.86 
 
 
363 aa  595  1e-169  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3913  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  76.31 
 
 
363 aa  590  1e-167  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2716  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  74.03 
 
 
362 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1551  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  73.48 
 
 
362 aa  569  1e-161  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0547796  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2486  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  77.35 
 
 
365 aa  567  1e-160  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2489  xenobiotic reductase, putative  71.82 
 
 
366 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2429  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  70.44 
 
 
370 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786429  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0888  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  70.14 
 
 
365 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2220  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  70.72 
 
 
370 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.708176  normal  0.437411 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2296  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  70.72 
 
 
370 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.559957  normal  0.67017 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2652  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  69.89 
 
 
368 aa  532  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.357683  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1814  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  69.89 
 
 
368 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.284682  normal  0.0316292 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2530  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  69.61 
 
 
368 aa  531  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.805138  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2537  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  69.61 
 
 
368 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.693892  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7390  xenobiotic reductase A  67.12 
 
 
363 aa  523  1e-147  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0369  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  70.44 
 
 
368 aa  519  1e-146  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.014148  normal  0.044055 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2291  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  66.57 
 
 
368 aa  520  1e-146  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000084765  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5152  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  63.66 
 
 
402 aa  489  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.506214  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0567  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  58.4 
 
 
360 aa  406  1.0000000000000001e-112  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4220  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.28 
 
 
364 aa  389  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0984  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.08 
 
 
387 aa  348  9e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3810  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.74 
 
 
356 aa  346  4e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2577  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.42 
 
 
355 aa  317  2e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00218003  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2083  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.14 
 
 
353 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1866  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50 
 
 
358 aa  309  5e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2211  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  50 
 
 
358 aa  309  5e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3890  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.4 
 
 
397 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.833244  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2134  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.72 
 
 
353 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000241293  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1456  FMN oxidoreductase  46.7 
 
 
354 aa  301  1e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0196412  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2428  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.54 
 
 
396 aa  300  3e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1919  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.5 
 
 
356 aa  296  3e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.957099 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4243  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.97 
 
 
368 aa  295  6e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4139  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.82 
 
 
368 aa  296  6e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4435  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.09 
 
 
355 aa  294  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3318  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.07 
 
 
356 aa  294  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470723  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1371  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  45.94 
 
 
365 aa  293  4e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2113  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.23 
 
 
370 aa  293  4e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0148  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.09 
 
 
357 aa  293  5e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1036  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.1 
 
 
368 aa  292  7e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1478  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.97 
 
 
368 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.139205 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1398  putative FMN oxidoreductase  46.05 
 
 
368 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1299  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.82 
 
 
368 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1086  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.54 
 
 
368 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.607736 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3946  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.73 
 
 
361 aa  290  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.181914  normal  0.508638 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0611  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.24 
 
 
370 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.316093 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1489  xenobiotic reductase, putative  44.54 
 
 
368 aa  290  3e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0293  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.89 
 
 
354 aa  289  4e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.818781  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16260  putative FMN oxidoreductase  45.01 
 
 
368 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1165  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.64 
 
 
356 aa  288  1e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0652  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.98 
 
 
370 aa  287  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0749879 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0702  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase protein  45.68 
 
 
370 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00458318  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39430  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.38 
 
 
368 aa  286  4e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0361  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.66 
 
 
355 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000624901 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4859  putative NADH-depentdent flavin oxidoreductase  42.74 
 
 
371 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.563143  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0966  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.35 
 
 
369 aa  283  4.0000000000000003e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104436  normal  0.525672 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0381  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.66 
 
 
362 aa  281  1e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2111  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.95 
 
 
775 aa  280  3e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.452402 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2779  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.29 
 
 
354 aa  279  5e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.487113  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2178  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.9 
 
 
354 aa  279  5e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4973  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.1 
 
 
365 aa  279  7e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.348713  normal  0.0595836 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3342  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  43.96 
 
 
370 aa  278  9e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0431  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.04 
 
 
365 aa  278  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0132994  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1527  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.93 
 
 
368 aa  277  2e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2520  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.97 
 
 
364 aa  276  5e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984471  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2248  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.88 
 
 
372 aa  275  6e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.674578 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2523  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.88 
 
 
372 aa  275  6e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0620053  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0211  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  43.96 
 
 
370 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4317  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.9 
 
 
371 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.529311  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4082  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  43.68 
 
 
370 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4010  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  43.96 
 
 
370 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2205  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.65 
 
 
372 aa  273  3e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.517852 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2202  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  42.24 
 
 
791 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24917  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2825  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.62 
 
 
364 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1059  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.82 
 
 
386 aa  273  5.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0160422  normal  0.54744 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5918  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.77 
 
 
352 aa  272  6e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00164429 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4014  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  41.55 
 
 
774 aa  271  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3524  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.61 
 
 
366 aa  271  2e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.110487  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33410  NADH:flavin oxidoreductase  44.04 
 
 
359 aa  271  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.374092  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0991  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.78 
 
 
387 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0239278  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>