More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2291 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2652  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  87.98 
 
 
368 aa  664    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.357683  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2530  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  87.47 
 
 
368 aa  662    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.805138  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2537  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  87.98 
 
 
368 aa  664    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.693892  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2291  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  100 
 
 
368 aa  761    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000084765  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2220  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  83.65 
 
 
370 aa  652    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.708176  normal  0.437411 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2296  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  83.65 
 
 
370 aa  652    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.559957  normal  0.67017 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1814  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  88.25 
 
 
368 aa  665    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.284682  normal  0.0316292 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2429  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  83.61 
 
 
370 aa  650    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786429  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0715  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase family protein  69.23 
 
 
365 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.489419 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2716  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  69.89 
 
 
362 aa  538  9.999999999999999e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1551  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  69.34 
 
 
362 aa  537  1e-151  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0547796  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4395  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  67.68 
 
 
365 aa  533  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1736  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  67.03 
 
 
369 aa  525  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414914  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1699  xenobiotic reductase A  67.4 
 
 
365 aa  527  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265579  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4322  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  65.57 
 
 
369 aa  521  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.700048  normal  0.249801 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4093  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  66.57 
 
 
369 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4273  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  66.57 
 
 
369 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4179  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  66.57 
 
 
369 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.888395 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3701  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  66.57 
 
 
369 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3244  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  66.02 
 
 
369 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.324542  normal  0.664985 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2296  NADH:flavin oxidoreductase  67.4 
 
 
365 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.879086  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0978  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  67.4 
 
 
365 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1063  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  67.4 
 
 
365 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0523  xenobiotic reductase A  67.13 
 
 
365 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.483716  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0125  xenobiotic reductase A  67.13 
 
 
365 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1405  xenobiotic reductase A  67.13 
 
 
365 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0369  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  68.78 
 
 
368 aa  513  1e-144  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.014148  normal  0.044055 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1489  xenobiotic reductase A  67.13 
 
 
365 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.812731  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2486  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  67.49 
 
 
365 aa  508  1e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2190  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  63.54 
 
 
363 aa  501  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0272574  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7390  xenobiotic reductase A  64.01 
 
 
363 aa  504  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3913  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  62.98 
 
 
363 aa  498  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2489  xenobiotic reductase, putative  61.75 
 
 
366 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2405  xenobiotic reductase A  62.43 
 
 
363 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0888  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  64.09 
 
 
365 aa  497  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1254  xenobiotic reductase A  61.33 
 
 
363 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3235  normal  0.321595 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1281  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  61.33 
 
 
363 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4137  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  61.33 
 
 
363 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5152  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  55.22 
 
 
402 aa  429  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.506214  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4220  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.55 
 
 
364 aa  424  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0567  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.21 
 
 
360 aa  388  1e-107  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0984  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.57 
 
 
387 aa  341  1e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3810  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.54 
 
 
356 aa  338  9.999999999999999e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2577  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.8 
 
 
355 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00218003  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1866  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.08 
 
 
358 aa  295  1e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2211  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  47.08 
 
 
358 aa  295  1e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2134  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.94 
 
 
353 aa  294  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000241293  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2083  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.38 
 
 
353 aa  293  3e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0148  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.81 
 
 
357 aa  292  6e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0361  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.77 
 
 
355 aa  291  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000624901 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1371  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  41.79 
 
 
365 aa  289  4e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2428  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.01 
 
 
396 aa  289  7e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3318  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.07 
 
 
356 aa  288  1e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470723  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3890  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.99 
 
 
397 aa  288  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.833244  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1036  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.11 
 
 
368 aa  286  4e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4139  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.1 
 
 
368 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1299  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.69 
 
 
368 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1456  FMN oxidoreductase  43.15 
 
 
354 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0196412  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0966  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.63 
 
 
369 aa  282  7.000000000000001e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104436  normal  0.525672 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39430  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.82 
 
 
368 aa  282  8.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3946  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.57 
 
 
361 aa  281  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.181914  normal  0.508638 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0293  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.46 
 
 
354 aa  281  1e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.818781  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1398  putative FMN oxidoreductase  43.58 
 
 
368 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1489  xenobiotic reductase, putative  41.13 
 
 
368 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1527  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.5 
 
 
368 aa  280  3e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4435  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.69 
 
 
355 aa  278  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16260  putative FMN oxidoreductase  42.54 
 
 
368 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4243  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40 
 
 
368 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1086  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40 
 
 
368 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.607736 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1478  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  39.45 
 
 
368 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.139205 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2178  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.5 
 
 
354 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3524  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.35 
 
 
366 aa  272  5.000000000000001e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.110487  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2779  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.11 
 
 
354 aa  271  1e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.487113  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2113  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  39.94 
 
 
370 aa  268  1e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0381  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.15 
 
 
362 aa  267  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5918  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.76 
 
 
352 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00164429 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1577  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase  41.34 
 
 
370 aa  264  1e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0241871  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4973  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.79 
 
 
365 aa  264  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.348713  normal  0.0595836 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1919  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.03 
 
 
356 aa  261  1e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.957099 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0761  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.57 
 
 
348 aa  259  4e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.867134  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3775  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.17 
 
 
379 aa  259  5.0000000000000005e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.797165  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0431  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  39.73 
 
 
365 aa  258  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0132994  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2111  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  38.42 
 
 
775 aa  258  2e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.452402 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1165  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.12 
 
 
356 aa  255  9e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0652  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.02 
 
 
370 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0749879 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1059  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  38.87 
 
 
386 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0160422  normal  0.54744 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2520  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  39.77 
 
 
364 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984471  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2202  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  38.14 
 
 
791 aa  253  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24917  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33410  NADH:flavin oxidoreductase  39.55 
 
 
359 aa  253  3e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.374092  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0611  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.32 
 
 
370 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.316093 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0702  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase protein  41.4 
 
 
370 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00458318  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3342  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  40.23 
 
 
370 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2825  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  39.42 
 
 
364 aa  252  7e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4859  putative NADH-depentdent flavin oxidoreductase  40.23 
 
 
371 aa  252  7e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.563143  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1718  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  39.77 
 
 
355 aa  251  1e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.404463  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2394  NADH--flavin oxidoreductase/NADH oxidase  39.77 
 
 
354 aa  250  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1442  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.17 
 
 
357 aa  250  3e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00181939  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3776  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.7 
 
 
352 aa  249  4e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.21839  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4472  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  39.77 
 
 
782 aa  249  5e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155704  normal  0.267141 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3016  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  38.59 
 
 
365 aa  249  7e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.824426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>