More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1202 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_2683  NADPH dehydrogenase  71.59 
 
 
782 aa  1188    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.292135 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0656  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  49.61 
 
 
777 aa  724    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.844921  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3180  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  48.06 
 
 
778 aa  676    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.344257  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4888  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.52 
 
 
776 aa  782    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.601528 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1826  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  49.48 
 
 
772 aa  733    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.913059  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02007  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  51.17 
 
 
785 aa  753    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4014  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  48.83 
 
 
774 aa  729    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0827  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  50.52 
 
 
771 aa  781    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.13916  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3831  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  49.81 
 
 
792 aa  737    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.436537  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2872  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  47.07 
 
 
804 aa  679    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.347054  normal  0.96919 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4068  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  51.29 
 
 
790 aa  764    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2184  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  51.23 
 
 
789 aa  755    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.19674  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3617  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  48.33 
 
 
822 aa  714    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.278037 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1323  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  52.04 
 
 
764 aa  781    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.659121  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4472  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  52.58 
 
 
782 aa  755    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155704  normal  0.267141 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0593  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  47.63 
 
 
777 aa  717    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0307  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.12 
 
 
790 aa  694    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0282  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  50.26 
 
 
790 aa  749    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3944  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  49.81 
 
 
792 aa  737    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.134026 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2202  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  51.48 
 
 
791 aa  765    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24917  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0297  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.87 
 
 
752 aa  692    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0437387  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2243  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  50.98 
 
 
764 aa  764    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0946349  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5087  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  50.98 
 
 
761 aa  753    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.608301  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5522  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  51.49 
 
 
791 aa  720    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.291941 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2274  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  53.52 
 
 
771 aa  804    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2695  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  52.11 
 
 
761 aa  776    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0527527  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2161  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.05 
 
 
784 aa  751    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172901  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2111  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.72 
 
 
775 aa  759    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.452402 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1202  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  100 
 
 
780 aa  1589    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7168  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  50.26 
 
 
790 aa  753    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.901999  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5038  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  49.15 
 
 
782 aa  724    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5918  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.57 
 
 
352 aa  318  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00164429 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0652  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.28 
 
 
370 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0749879 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0611  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.56 
 
 
370 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.316093 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3946  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.32 
 
 
361 aa  313  1e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.181914  normal  0.508638 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2577  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.14 
 
 
355 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00218003  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1165  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.83 
 
 
356 aa  311  4e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4243  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.7 
 
 
368 aa  310  9e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5482  monooxygenase, FAD-binding  43.01 
 
 
377 aa  308  4.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.942938  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4139  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.56 
 
 
368 aa  306  8.000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2083  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.09 
 
 
353 aa  306  1.0000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16260  putative FMN oxidoreductase  45.85 
 
 
368 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3318  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.41 
 
 
356 aa  304  4.0000000000000003e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470723  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2134  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.76 
 
 
353 aa  304  4.0000000000000003e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000241293  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1036  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.71 
 
 
368 aa  304  5.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1086  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.13 
 
 
368 aa  303  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.607736 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0148  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.15 
 
 
357 aa  302  1e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1398  putative FMN oxidoreductase  45.56 
 
 
368 aa  302  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2687  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.75 
 
 
373 aa  302  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.340404 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1456  FMN oxidoreductase  49.7 
 
 
354 aa  301  3e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0196412  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1371  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  46.13 
 
 
365 aa  301  4e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39430  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.73 
 
 
368 aa  301  4e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1478  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.99 
 
 
368 aa  300  7e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.139205 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1577  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase  47.85 
 
 
370 aa  299  1e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0241871  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1299  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.26 
 
 
368 aa  299  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1919  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.92 
 
 
356 aa  299  2e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.957099 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0702  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase protein  47.41 
 
 
370 aa  298  3e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00458318  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7562  NADPH dehydrogenase  44.54 
 
 
370 aa  297  4e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0966  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.98 
 
 
369 aa  297  7e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104436  normal  0.525672 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2178  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.41 
 
 
354 aa  296  8e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1489  xenobiotic reductase, putative  43.44 
 
 
368 aa  295  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2817  monooxygenase FAD-binding protein  44.47 
 
 
712 aa  295  2e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.606317  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4902  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.86 
 
 
358 aa  293  9e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3342  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  43.39 
 
 
370 aa  291  3e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2608  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.13 
 
 
371 aa  290  6e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.103879 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0293  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.27 
 
 
354 aa  290  9e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.818781  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2211  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  46.7 
 
 
358 aa  289  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1866  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.7 
 
 
358 aa  289  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2082  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.08 
 
 
373 aa  290  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4859  putative NADH-depentdent flavin oxidoreductase  41.6 
 
 
371 aa  289  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.563143  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1715  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.48 
 
 
359 aa  288  2e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.148075  normal  0.0532635 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4903  monooxygenase, FAD-binding  41.4 
 
 
379 aa  287  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2825  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.69 
 
 
364 aa  287  5.999999999999999e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33410  NADH:flavin oxidoreductase  45.28 
 
 
359 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.374092  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1718  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.51 
 
 
355 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.404463  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3810  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.58 
 
 
356 aa  284  5.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4317  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.41 
 
 
371 aa  283  9e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.529311  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0361  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.42 
 
 
355 aa  283  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000624901 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0144  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.26 
 
 
367 aa  282  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3719  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.42 
 
 
354 aa  282  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.717818  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3839  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.85 
 
 
352 aa  282  2e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.431413 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2205  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.32 
 
 
372 aa  281  4e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.517852 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4435  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.16 
 
 
355 aa  281  4e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5101  monooxygenase, FAD-binding  40.66 
 
 
381 aa  280  7e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.889142  normal  0.467913 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0319  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.92 
 
 
351 aa  280  7e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.254324  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2520  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.69 
 
 
364 aa  280  8e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984471  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0881  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.32 
 
 
387 aa  279  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427162  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1173  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.01 
 
 
370 aa  279  1e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1442  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.6 
 
 
357 aa  279  1e-73  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00181939  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2248  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.66 
 
 
372 aa  279  1e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.674578 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2523  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.66 
 
 
372 aa  279  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0620053  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3524  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.69 
 
 
366 aa  279  2e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.110487  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4973  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.54 
 
 
365 aa  278  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.348713  normal  0.0595836 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0211  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  41.95 
 
 
370 aa  278  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4082  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  41.95 
 
 
370 aa  277  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4010  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  41.67 
 
 
370 aa  277  6e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1649  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.23 
 
 
365 aa  276  8e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3859  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.85 
 
 
352 aa  276  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1495  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.83 
 
 
364 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.611411  normal  0.671157 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3927  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.68 
 
 
370 aa  275  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0013465  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>