More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0297 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0827  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  47.85 
 
 
771 aa  720    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.13916  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2872  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  47.13 
 
 
804 aa  655    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.347054  normal  0.96919 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4472  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  51.6 
 
 
782 aa  724    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155704  normal  0.267141 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4888  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.01 
 
 
776 aa  681    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.601528 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1826  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  49.36 
 
 
772 aa  697    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.913059  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02007  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  50.91 
 
 
785 aa  706    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1202  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.87 
 
 
780 aa  692    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3831  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  50.13 
 
 
792 aa  699    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.436537  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4014  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  47.53 
 
 
774 aa  695    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2184  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  52.8 
 
 
789 aa  748    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.19674  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3180  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  49.35 
 
 
778 aa  680    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.344257  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0307  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  57.96 
 
 
790 aa  828    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2683  NADPH dehydrogenase  50 
 
 
782 aa  717    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.292135 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1323  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  46.47 
 
 
764 aa  674    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.659121  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0593  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  47.12 
 
 
777 aa  681    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2161  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  55.05 
 
 
784 aa  798    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172901  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0297  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  100 
 
 
752 aa  1540    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0437387  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0282  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  50.39 
 
 
790 aa  700    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5038  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  49.41 
 
 
782 aa  703    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7168  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  49.61 
 
 
790 aa  699    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.901999  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0656  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  46.7 
 
 
777 aa  652    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.844921  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2202  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  52.92 
 
 
791 aa  764    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24917  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2243  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  48.16 
 
 
764 aa  702    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0946349  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3617  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  45.34 
 
 
822 aa  662    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.278037 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3944  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  50.13 
 
 
792 aa  699    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.134026 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2274  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  49.35 
 
 
771 aa  728    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2111  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.96 
 
 
775 aa  706    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.452402 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2695  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  49.34 
 
 
761 aa  716    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0527527  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5522  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  61.37 
 
 
791 aa  910    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.291941 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4068  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  51.03 
 
 
790 aa  709    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5087  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  45.8 
 
 
761 aa  664    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.608301  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0652  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.88 
 
 
370 aa  295  1e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0749879 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1299  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.28 
 
 
368 aa  295  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2577  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.73 
 
 
355 aa  293  6e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00218003  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0611  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.88 
 
 
370 aa  293  7e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.316093 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0991  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.05 
 
 
387 aa  293  8e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0239278  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1489  xenobiotic reductase, putative  44.9 
 
 
368 aa  288  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1173  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.34 
 
 
370 aa  288  2.9999999999999996e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0702  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase protein  44.89 
 
 
370 aa  286  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00458318  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0881  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.43 
 
 
387 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427162  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1919  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.45 
 
 
356 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.957099 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1573  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.45 
 
 
365 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0966  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.2 
 
 
369 aa  284  5.000000000000001e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104436  normal  0.525672 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1456  FMN oxidoreductase  47.16 
 
 
354 aa  282  2e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0196412  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0720  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.87 
 
 
367 aa  282  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2134  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.89 
 
 
353 aa  281  3e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000241293  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3318  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.06 
 
 
356 aa  281  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470723  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3946  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.82 
 
 
361 aa  280  7e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.181914  normal  0.508638 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1371  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  45.03 
 
 
365 aa  279  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4139  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.8 
 
 
368 aa  279  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2083  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.89 
 
 
353 aa  277  4e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0655  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.98 
 
 
367 aa  277  6e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.208433  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1086  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.35 
 
 
368 aa  277  6e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.607736 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4243  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.08 
 
 
368 aa  276  7e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7562  NADPH dehydrogenase  43.18 
 
 
370 aa  276  8e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5174  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.69 
 
 
387 aa  276  9e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2687  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.94 
 
 
373 aa  276  9e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.340404 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1577  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase  44.38 
 
 
370 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0241871  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2608  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.48 
 
 
371 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.103879 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1478  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.8 
 
 
368 aa  273  6e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.139205 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5482  monooxygenase, FAD-binding  39.58 
 
 
377 aa  274  6e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.942938  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2205  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.06 
 
 
372 aa  273  8.000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.517852 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1036  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.08 
 
 
368 aa  273  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1866  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.29 
 
 
358 aa  272  2e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2248  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.34 
 
 
372 aa  272  2e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.674578 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2523  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.34 
 
 
372 aa  272  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0620053  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2211  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  44.29 
 
 
358 aa  272  2e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3775  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.36 
 
 
379 aa  271  2e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.797165  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2817  monooxygenase FAD-binding protein  41.06 
 
 
712 aa  271  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.606317  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1165  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.81 
 
 
356 aa  271  2.9999999999999997e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4317  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.93 
 
 
371 aa  270  5.9999999999999995e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.529311  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1398  putative FMN oxidoreductase  43.29 
 
 
368 aa  270  7e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4902  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.37 
 
 
358 aa  270  8e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33410  NADH:flavin oxidoreductase  44.75 
 
 
359 aa  270  8e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.374092  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2082  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.82 
 
 
373 aa  270  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4859  putative NADH-depentdent flavin oxidoreductase  40.56 
 
 
371 aa  269  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.563143  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5918  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.61 
 
 
352 aa  269  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00164429 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0148  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.62 
 
 
357 aa  269  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39430  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.01 
 
 
368 aa  268  2.9999999999999995e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2113  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.68 
 
 
370 aa  266  7e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3342  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  42.05 
 
 
370 aa  266  8e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1715  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.01 
 
 
359 aa  266  8.999999999999999e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.148075  normal  0.0532635 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1514  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.24 
 
 
371 aa  266  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0319  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.57 
 
 
351 aa  266  1e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.254324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16260  putative FMN oxidoreductase  42.47 
 
 
368 aa  265  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2178  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.51 
 
 
354 aa  265  3e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2825  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.34 
 
 
364 aa  263  8.999999999999999e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1649  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.35 
 
 
365 aa  263  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1442  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  39.11 
 
 
357 aa  262  2e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00181939  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4903  monooxygenase, FAD-binding  39.58 
 
 
379 aa  261  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1034  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.11 
 
 
373 aa  260  5.0000000000000005e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2520  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.19 
 
 
364 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984471  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1495  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.77 
 
 
364 aa  260  7e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.611411  normal  0.671157 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1069  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.49 
 
 
372 aa  260  8e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2881  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.5 
 
 
364 aa  259  9e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.438588  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0144  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.41 
 
 
367 aa  259  9e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2396  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.51 
 
 
368 aa  259  1e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3810  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.7 
 
 
356 aa  259  1e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2864  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.5 
 
 
364 aa  259  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.597938  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1059  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.68 
 
 
386 aa  257  6e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0160422  normal  0.54744 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>