134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4123 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4123  monooxygenase, FAD-binding  100 
 
 		 374 aa  778    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.058408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5482  monooxygenase, FAD-binding  64.61 
 
 		 377 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.942938  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4903  monooxygenase, FAD-binding  59.52 
 
 		 379 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5101  monooxygenase, FAD-binding  43.32 
 
 		 381 aa  325  9e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.889142  normal  0.467913 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0171  monooxygenase, FAD-binding  41.67 
 
 		 381 aa  308  6.999999999999999e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7497  putative aromatic-ring hydroxylase  44.5 
 
 		 379 aa  306  3e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0307  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  39.36 
 
 		 790 aa  287  2e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7168  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  39.02 
 
 		 790 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.901999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0282  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  39.02 
 
 		 790 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02007  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  39.53 
 
 		 785 aa  281  1e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3831  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  39.02 
 
 		 792 aa  279  7e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.436537  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3944  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  39.02 
 
 		 792 aa  279  7e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.134026 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4068  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  38.5 
 
 		 790 aa  278  9e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2683  NADPH dehydrogenase  41.73 
 
 		 782 aa  277  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.292135 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5522  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  39.79 
 
 		 791 aa  274  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.291941 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1826  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  39.43 
 
 		 772 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.913059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1202  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.87 
 
 		 780 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3101  monooxygenase, FAD-binding  39.04 
 
 		 384 aa  271  9e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2202  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  38.42 
 
 		 791 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24917  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0827  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  38.6 
 
 		 771 aa  271  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.13916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2695  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  38.26 
 
 		 761 aa  269  5.9999999999999995e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0527527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2111  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.69 
 
 		 775 aa  266  5e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.452402 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0656  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  38.11 
 
 		 777 aa  266  5.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.844921  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2274  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  38.08 
 
 		 771 aa  261  1e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5087  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  36.41 
 
 		 761 aa  261  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.608301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4472  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  37.5 
 
 		 782 aa  261  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155704  normal  0.267141 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0297  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  37.99 
 
 		 752 aa  261  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0437387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2184  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  37.91 
 
 		 789 aa  258  9e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.19674  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3617  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  38.14 
 
 		 822 aa  256  4e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.278037 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5038  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  37.98 
 
 		 782 aa  254  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2161  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  37.7 
 
 		 784 aa  253  3e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2243  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  36.51 
 
 		 764 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0946349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4888  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  38.73 
 
 		 776 aa  253  4.0000000000000004e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.601528 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0593  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  36.43 
 
 		 777 aa  250  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3779  putative monooxygenase, FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  36.56 
 
 		 386 aa  249  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3180  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  35.66 
 
 		 778 aa  248  8e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.344257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1323  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  36.51 
 
 		 764 aa  248  1e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.659121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2872  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  33.85 
 
 		 804 aa  243  5e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.347054  normal  0.96919 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4014  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  34.72 
 
 		 774 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2817  monooxygenase FAD-binding protein  38.15 
 
 		 712 aa  230  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.606317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1385  monooxygenase FAD-binding  36.68 
 
 		 413 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1224  monooxygenase FAD-binding  36.68 
 
 		 413 aa  212  7e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0821266  normal  0.977549 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4331  monooxygenase FAD-binding  35.09 
 
 		 451 aa  210  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4320  monooxygenase FAD-binding protein  38.29 
 
 		 400 aa  210  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2592  monooxygenase, FAD-binding  34.64 
 
 		 404 aa  206  5e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1109  monooxygenase FAD-binding  37.71 
 
 		 413 aa  201  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.529688 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  23.22 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2043  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase and related FAD-dependent oxidoreductases-like  26.51 
 
 		 479 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2786  monooxygenase FAD-binding protein  28.03 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00390244  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  26.21 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2680  monooxygenase, FAD-binding  27.3 
 
 		 384 aa  60.5  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.156834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2964  monooxygenase FAD-binding  24.45 
 
 		 422 aa  60.1  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000808449 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3698  hypothetical protein  27.35 
 
 		 417 aa  58.2  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0252348  normal  0.169871 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  23.85 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4393  monooxygenase FAD-binding  24.79 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  23.71 
 
 		 373 aa  56.6  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  28.52 
 
 		 408 aa  56.2  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4263  monooxygenase FAD-binding  27.08 
 
 		 398 aa  54.3  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00000952252  normal  0.156031 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  23.39 
 
 		 404 aa  53.5  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5106  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  27.46 
 
 		 399 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2957  monooxygenase FAD-binding  38.67 
 
 		 372 aa  52.8  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.00000079656 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2343  monooxygenase FAD-binding protein  23.81 
 
 		 392 aa  52.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  23.39 
 
 		 404 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2189  Kynurenine 3-monooxygenase  20.91 
 
 		 440 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  23.66 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  23.66 
 
 		 422 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2253  monooxygenase FAD-binding protein  34.62 
 
 		 401 aa  50.8  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5199  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  26.94 
 
 		 399 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.539289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  27.08 
 
 		 391 aa  50.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2552  monooxygenase FAD-binding protein  24.69 
 
 		 376 aa  50.4  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  22.66 
 
 		 383 aa  50.1  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5237  putative salicylate 1-monooxygenase  30.58 
 
 		 399 aa  50.1  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192496 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5024  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  28.34 
 
 		 399 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0338  monooxygenase FAD-binding  26.79 
 
 		 372 aa  49.7  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5259  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  26.42 
 
 		 399 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  25.96 
 
 		 373 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3909  hypothetical protein  29.15 
 
 		 414 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0793599 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3466  monooxygenase, FAD-binding  25.65 
 
 		 392 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  24.45 
 
 		 377 aa  48.9  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4900  monooxygenase, FAD-binding  25.65 
 
 		 392 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.99121 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  22.59 
 
 		 382 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  25.56 
 
 		 376 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4971  monooxygenase FAD-binding  24.71 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415719  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  26.39 
 
 		 376 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  25.75 
 
 		 400 aa  47.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3669  salicylate hydroxylase  21.88 
 
 		 400 aa  48.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  24.06 
 
 		 421 aa  47.4  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00851  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  29.14 
 
 		 390 aa  47.4  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.251973  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3524  monooxygenase FAD-binding protein  26.92 
 
 		 401 aa  47  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894226  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08716  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01050)  24.59 
 
 		 415 aa  47  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  23.87 
 
 		 396 aa  46.6  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3267  salicylate hydroxylase  33.78 
 
 		 397 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.128222 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  34.72 
 
 		 395 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.630865 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08521  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06050)  21.25 
 
 		 469 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.883838  normal  0.0891916 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2705  monooxygenase, FAD-binding protein  26.22 
 
 		 423 aa  45.8  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3144  salicylate hydroxylase  24.37 
 
 		 400 aa  46.2  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  23.33 
 
 		 382 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5386  monooxygenase FAD-binding  24.13 
 
 		 392 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.336288 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2837  monooxygenase FAD-binding  24.93 
 
 		 378 aa  45.8  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3547  hypothetical protein  23.94 
 
 		 374 aa  45.8  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>