202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3779 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3779  putative monooxygenase, FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  100 
 
 		 386 aa  793    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3101  monooxygenase, FAD-binding  56.99 
 
 		 384 aa  425  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7497  putative aromatic-ring hydroxylase  43.2 
 
 		 379 aa  299  5e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0171  monooxygenase, FAD-binding  41.98 
 
 		 381 aa  295  6e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5482  monooxygenase, FAD-binding  42.11 
 
 		 377 aa  289  7e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.942938  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4903  monooxygenase, FAD-binding  39.73 
 
 		 379 aa  287  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5101  monooxygenase, FAD-binding  41.78 
 
 		 381 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.889142  normal  0.467913 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1202  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  39.79 
 
 		 780 aa  258  9e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4068  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  36.95 
 
 		 790 aa  247  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2683  NADPH dehydrogenase  38.86 
 
 		 782 aa  245  9e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.292135 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2274  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  37.87 
 
 		 771 aa  245  9.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3831  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  37.28 
 
 		 792 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.436537  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3944  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  37.28 
 
 		 792 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.134026 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2695  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  37.67 
 
 		 761 aa  243  3e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0527527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4123  monooxygenase, FAD-binding  36.44 
 
 		 374 aa  243  6e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.058408  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02007  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  37.8 
 
 		 785 aa  238  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7168  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  36.07 
 
 		 790 aa  238  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.901999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4472  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  37.24 
 
 		 782 aa  236  5.0000000000000005e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155704  normal  0.267141 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0282  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  35.54 
 
 		 790 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1826  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  36.67 
 
 		 772 aa  233  3e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.913059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2202  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  36.95 
 
 		 791 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24917  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2111  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.15 
 
 		 775 aa  233  6e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.452402 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0827  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  36.18 
 
 		 771 aa  229  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.13916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2184  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  36.43 
 
 		 789 aa  227  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.19674  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2817  monooxygenase FAD-binding protein  36.64 
 
 		 712 aa  226  5.0000000000000005e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.606317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0307  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  37.8 
 
 		 790 aa  226  6e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0297  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.99 
 
 		 752 aa  224  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0437387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5087  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  34.91 
 
 		 761 aa  223  3e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.608301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4888  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.41 
 
 		 776 aa  223  4e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.601528 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1323  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  35.41 
 
 		 764 aa  223  6e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.659121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2243  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  35.41 
 
 		 764 aa  222  9e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0946349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0656  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  34.1 
 
 		 777 aa  220  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.844921  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3617  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  35.14 
 
 		 822 aa  216  5e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.278037 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2161  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  38.93 
 
 		 784 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5522  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  36.81 
 
 		 791 aa  213  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.291941 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3180  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  33.95 
 
 		 778 aa  210  3e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.344257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0593  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  33.68 
 
 		 777 aa  207  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2872  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  32.47 
 
 		 804 aa  207  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.347054  normal  0.96919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4320  monooxygenase FAD-binding protein  36.16 
 
 		 400 aa  206  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4014  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  32.72 
 
 		 774 aa  204  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5038  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  33.6 
 
 		 782 aa  202  8e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2592  monooxygenase, FAD-binding  34.34 
 
 		 404 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1385  monooxygenase FAD-binding  34.84 
 
 		 413 aa  196  6e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1224  monooxygenase FAD-binding  34.28 
 
 		 413 aa  195  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0821266  normal  0.977549 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1109  monooxygenase FAD-binding  35.13 
 
 		 413 aa  192  9e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.529688 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4331  monooxygenase FAD-binding  31.85 
 
 		 451 aa  184  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  27.35 
 
 		 373 aa  81.3  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2043  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase and related FAD-dependent oxidoreductases-like  28.83 
 
 		 479 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  30.03 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  26.81 
 
 		 377 aa  70.1  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  24.65 
 
 		 390 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  25.75 
 
 		 397 aa  67.8  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  25.07 
 
 		 391 aa  67  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  25.07 
 
 		 391 aa  67  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2599  Kynurenine 3-monooxygenase  26.21 
 
 		 455 aa  65.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0833412  normal  0.344661 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  26.99 
 
 		 408 aa  65.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  26.26 
 
 		 392 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3517  monooxygenase, FAD-binding  28.06 
 
 		 385 aa  64.3  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.623295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  23.08 
 
 		 395 aa  64.3  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  28.21 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4138  monooxygenase, FAD-binding protein  26.7 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145497  normal  0.0296411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5812  monooxygenase, FAD-binding protein  26.88 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  24.86 
 
 		 374 aa  63.2  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3438  monooxygenase, FAD-binding  25.34 
 
 		 399 aa  63.2  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3140  hypothetical protein  23.89 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21010  putative FAD-dependent monooxygenase  26.25 
 
 		 388 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.12929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0399  FAD dependent oxidoreductase  30.72 
 
 		 357 aa  59.3  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0918847  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1110  monooxygenase FAD-binding  26.59 
 
 		 389 aa  59.3  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4013  monooxygenase FAD-binding  23.01 
 
 		 362 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0834664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1528  monooxygenase FAD-binding  23.5 
 
 		 362 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.392805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4393  monooxygenase FAD-binding  24.7 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2786  monooxygenase FAD-binding protein  24.71 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00390244  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4828  hypothetical protein  26.59 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.454319 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3968  monooxygenase FAD-binding  22.44 
 
 		 362 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3224  monooxygenase FAD-binding  24.83 
 
 		 399 aa  57  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  24.22 
 
 		 389 aa  57  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  23.36 
 
 		 395 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2705  monooxygenase, FAD-binding protein  27.65 
 
 		 423 aa  55.8  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2189  Kynurenine 3-monooxygenase  22.85 
 
 		 440 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  27.32 
 
 		 403 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  24.59 
 
 		 399 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  25.22 
 
 		 376 aa  55.1  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2680  monooxygenase, FAD-binding  24.64 
 
 		 384 aa  53.9  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.156834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0896  monooxygenase, FAD-binding  24.32 
 
 		 389 aa  53.9  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05260  conserved hypothetical protein  24 
 
 		 446 aa  53.5  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2552  monooxygenase FAD-binding protein  23.1 
 
 		 376 aa  53.5  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  25.43 
 
 		 371 aa  53.5  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  23.11 
 
 		 396 aa  53.5  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2343  monooxygenase FAD-binding protein  24.62 
 
 		 392 aa  53.1  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  25.37 
 
 		 386 aa  53.1  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3547  hypothetical protein  22.77 
 
 		 374 aa  53.1  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0125  monooxygenase FAD-binding  24.7 
 
 		 374 aa  53.1  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1565  monooxygenase FAD-binding  26.82 
 
 		 384 aa  53.1  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156985 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0514  hypothetical protein  25.26 
 
 		 421 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.472933  normal  0.467939 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2964  monooxygenase FAD-binding  25.13 
 
 		 422 aa  52.8  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000808449 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2779  monooxygenase FAD-binding  28 
 
 		 411 aa  51.6  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0421282 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  26.01 
 
 		 382 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  25 
 
 		 376 aa  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5767  putative oxidoreductase transmembrane protein  26 
 
 		 405 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117987  normal  0.249872 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  22.95 
 
 		 393 aa  51.6  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289154 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>