88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5101 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009508  Swit_5101  monooxygenase, FAD-binding  100 
 
 		 381 aa  794    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.889142  normal  0.467913 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7497  putative aromatic-ring hydroxylase  51.62 
 
 		 379 aa  379  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0171  monooxygenase, FAD-binding  48.24 
 
 		 381 aa  363  3e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5482  monooxygenase, FAD-binding  44.54 
 
 		 377 aa  324  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.942938  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4123  monooxygenase, FAD-binding  43.32 
 
 		 374 aa  317  3e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.058408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4903  monooxygenase, FAD-binding  43.24 
 
 		 379 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2274  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  42.71 
 
 		 771 aa  301  2e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7168  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  39.74 
 
 		 790 aa  292  5e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.901999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0282  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  40.83 
 
 		 790 aa  291  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2695  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  40.53 
 
 		 761 aa  286  5e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0527527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4068  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  39.74 
 
 		 790 aa  286  5e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0827  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  38.46 
 
 		 771 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.13916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3779  putative monooxygenase, FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  41.78 
 
 		 386 aa  282  6.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02007  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  39.68 
 
 		 785 aa  282  8.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1202  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.66 
 
 		 780 aa  280  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1826  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  41.1 
 
 		 772 aa  279  5e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.913059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2683  NADPH dehydrogenase  41.03 
 
 		 782 aa  279  5e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.292135 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0307  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  39.26 
 
 		 790 aa  279  5e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5087  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  39.68 
 
 		 761 aa  275  1.0000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.608301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3101  monooxygenase, FAD-binding  41.02 
 
 		 384 aa  273  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3944  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  39.05 
 
 		 792 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.134026 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3831  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  39.05 
 
 		 792 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.436537  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4472  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  39.19 
 
 		 782 aa  270  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155704  normal  0.267141 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4888  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  39.13 
 
 		 776 aa  268  1e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.601528 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3180  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  38.62 
 
 		 778 aa  265  8.999999999999999e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.344257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0656  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  38.9 
 
 		 777 aa  265  8.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.844921  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2243  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  37.1 
 
 		 764 aa  262  6e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0946349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4014  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  37.24 
 
 		 774 aa  260  3e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2202  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  37.47 
 
 		 791 aa  260  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24917  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5522  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  36.87 
 
 		 791 aa  260  4e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.291941 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3617  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  37.63 
 
 		 822 aa  255  7e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.278037 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1323  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  36.56 
 
 		 764 aa  255  1.0000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.659121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2111  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.01 
 
 		 775 aa  254  2.0000000000000002e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.452402 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2161  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  38.24 
 
 		 784 aa  253  5.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172901  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5038  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  36.79 
 
 		 782 aa  250  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2184  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  36.88 
 
 		 789 aa  249  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.19674  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0593  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  35.62 
 
 		 777 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2872  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  34.81 
 
 		 804 aa  248  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.347054  normal  0.96919 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0297  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  37.87 
 
 		 752 aa  243  3.9999999999999997e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0437387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1224  monooxygenase FAD-binding  38.22 
 
 		 413 aa  242  9e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0821266  normal  0.977549 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1385  monooxygenase FAD-binding  38.22 
 
 		 413 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4320  monooxygenase FAD-binding protein  36.68 
 
 		 400 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2592  monooxygenase, FAD-binding  36.13 
 
 		 404 aa  233  3e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2817  monooxygenase FAD-binding protein  35.1 
 
 		 712 aa  233  4.0000000000000004e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.606317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1109  monooxygenase FAD-binding  38.22 
 
 		 413 aa  232  6e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.529688 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4331  monooxygenase FAD-binding  31.3 
 
 		 451 aa  186  8e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2043  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase and related FAD-dependent oxidoreductases-like  25 
 
 		 479 aa  76.3  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2189  Kynurenine 3-monooxygenase  23.01 
 
 		 440 aa  57  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4393  monooxygenase FAD-binding  23.1 
 
 		 377 aa  51.2  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5861  salicylate hydroxylase  27.21 
 
 		 404 aa  51.2  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163921  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  24.5 
 
 		 373 aa  50.4  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2552  monooxygenase FAD-binding protein  22.95 
 
 		 376 aa  50.4  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  21.72 
 
 		 371 aa  49.7  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5805  salicylate hydroxylase  27.27 
 
 		 403 aa  47.4  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0896  monooxygenase, FAD-binding  22.27 
 
 		 389 aa  46.2  0.0009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4138  monooxygenase, FAD-binding protein  28.7 
 
 		 408 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145497  normal  0.0296411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  22.54 
 
 		 377 aa  45.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2343  monooxygenase FAD-binding protein  36.76 
 
 		 392 aa  46.2  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1002  hypothetical protein  22.13 
 
 		 369 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.132346  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0399  FAD dependent oxidoreductase  30.95 
 
 		 357 aa  46.2  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0918847  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0733  hypothetical protein  21.97 
 
 		 369 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5812  monooxygenase, FAD-binding protein  28.7 
 
 		 408 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  23.39 
 
 		 389 aa  45.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28690  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  23.68 
 
 		 387 aa  45.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2786  monooxygenase FAD-binding protein  38.6 
 
 		 408 aa  44.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00390244  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  22.93 
 
 		 390 aa  44.3  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0696  putative monooxygenase  23.14 
 
 		 388 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0540721  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05260  conserved hypothetical protein  30.77 
 
 		 446 aa  43.9  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2421  putative monooxygenase  23.14 
 
 		 388 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  22.6 
 
 		 396 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0770  putative monooxygenase  23.14 
 
 		 388 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.522816  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1219  putative monooxygenase  23.14 
 
 		 388 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00380078  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1144  putative monooxygenase  23.14 
 
 		 388 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.670847  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1734  putative monooxygenase  23.14 
 
 		 388 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7773  monooxygenase FAD-binding  24.63 
 
 		 374 aa  44.3  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  32.94 
 
 		 395 aa  43.5  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00851  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  22.94 
 
 		 390 aa  43.9  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.251973  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  24.12 
 
 		 397 aa  43.5  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1576  putative monooxygenase  23.5 
 
 		 388 aa  43.5  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.472277  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19150  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  23.91 
 
 		 351 aa  43.1  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0319604  normal  0.370849 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2365  salicylate hydroxylase  28.16 
 
 		 397 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.602992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2410  salicylate hydroxylase  28.16 
 
 		 397 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2522  salicylate hydroxylase  28.16 
 
 		 397 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2321  salicylate hydroxylase  28.16 
 
 		 397 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2414  salicylate hydroxylase  28.16 
 
 		 397 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.285012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0355  salicylate hydroxylase  28.18 
 
 		 427 aa  43.1  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5237  putative salicylate 1-monooxygenase  26.11 
 
 		 399 aa  42.7  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192496 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1196  monooxygenase, FAD-binding  33.33 
 
 		 508 aa  42.7  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>