More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2257 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2257  TrkA-N domain protein  100 
 
 		 220 aa  444  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222998  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2473  TrkA domain-containing protein  62.27 
 
 		 223 aa  280  8.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.214066  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2197  TrkA-N  62.33 
 
 		 217 aa  272  3e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2243  TrkA domain-containing protein  62.33 
 
 		 217 aa  272  3e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2186  TrkA domain-containing protein  62.33 
 
 		 217 aa  272  3e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0106506 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3927  TrkA domain-containing protein  63.86 
 
 		 234 aa  270  1e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0233751  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12706  trk system potassium uptake protein ceoB  65.35 
 
 		 227 aa  270  1e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1521  TrkA-N domain protein  60.37 
 
 		 220 aa  259  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.709024  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2285  TrkA-N domain-containing protein  54.09 
 
 		 221 aa  241  9e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.311674 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1451  TrkA domain-containing protein  55.09 
 
 		 221 aa  239  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0437642  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6759  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  53.92 
 
 		 221 aa  237  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0519804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1642  TrkA-N domain protein  58.38 
 
 		 219 aa  236  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.623208  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3756  TrkA-N domain protein  55.29 
 
 		 236 aa  236  3e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000258956  normal  0.472401 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1398  TrkA domain-containing protein  53.7 
 
 		 224 aa  234  9e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.870164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1323  TrkA-like  58 
 
 		 264 aa  233  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1486  TrkA domain-containing protein  52.78 
 
 		 221 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.370955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1713  TrkA-N domain protein  58.74 
 
 		 222 aa  231  5e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1877  TrkA-N domain protein  56.22 
 
 		 222 aa  231  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.608746  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4527  TrkA-N domain-containing protein  58.08 
 
 		 221 aa  230  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.621759 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2903  TrkA domain-containing protein  54.55 
 
 		 220 aa  229  3e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1917  TrkA-N domain protein  55.73 
 
 		 217 aa  225  5.0000000000000005e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.678679  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1405  TrkA-N domain protein  54.17 
 
 		 218 aa  223  2e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.364271  normal  0.729476 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1942  TrkA-N domain protein  51.89 
 
 		 216 aa  222  3e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0161521 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1562  TrkA-N domain protein  51.61 
 
 		 221 aa  218  6e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.308966  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16170  K+ transport system, NAD-binding component  50.76 
 
 		 221 aa  214  5.9999999999999996e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.11506 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1634  TrkA-N domain protein  51.39 
 
 		 224 aa  214  9e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000521907 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1708  TrkA-N domain protein  52.08 
 
 		 216 aa  214  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0311888  normal  0.0547174 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1641  TrkA domain-containing protein  51.98 
 
 		 223 aa  208  5e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0270311  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5191  TrkA domain-containing protein  55.5 
 
 		 243 aa  199  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0357985  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2874  TrkA-N domain protein  50.99 
 
 		 242 aa  195  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1928  putative potassium transporter  52.68 
 
 		 224 aa  189  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.292607  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13070  K+ transport system, NAD-binding component  49.75 
 
 		 233 aa  187  8e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00265603  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3063  TrkA domain-containing protein  40.78 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1923  TrkA-N domain protein  48.51 
 
 		 220 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3072  TrkA domain-containing protein  41.58 
 
 		 214 aa  155  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2660  TrkA domain-containing protein  41.75 
 
 		 214 aa  154  8e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0646767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  41.09 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2083  TrkA-N domain protein  35 
 
 		 210 aa  135  6.0000000000000005e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0807  TrkA-N domain protein  52.85 
 
 		 137 aa  134  8e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0243  TrkA-N domain protein  34.83 
 
 		 206 aa  134  9e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0027  potassium uptake protein, putative  48.72 
 
 		 134 aa  122  5e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.248151  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0026  TrkA domain-containing protein  47.86 
 
 		 134 aa  120  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_26  cation transport protein, Trk system  47.86 
 
 		 134 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0437885  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0637  TrkA-N  33.49 
 
 		 219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0432302 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00280  K+ transport system, NAD-binding component  35.64 
 
 		 219 aa  118  4.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0250  TrkA-N domain protein  39.84 
 
 		 219 aa  108  5e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01270  K+ transport system, NAD-binding component  41.46 
 
 		 219 aa  108  7.000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1347  TrkA-N  38.93 
 
 		 134 aa  107  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0274494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0253  TrkA-N domain protein  35.48 
 
 		 138 aa  95.9  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1262  TrkA domain-containing protein  32.48 
 
 		 141 aa  92.8  3e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2911  TrkA-N domain protein  37.9 
 
 		 142 aa  91.3  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0359474  normal  0.209528 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1656  TrkA domain-containing protein  36.59 
 
 		 143 aa  86.7  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153236  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  32.16 
 
 		 630 aa  85.9  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1729  TrkA domain-containing protein  35.77 
 
 		 143 aa  85.9  5e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000411585  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  32.85 
 
 		 628 aa  85.5  6e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00019  potassium transporter peripheral membrane component  26.82 
 
 		 459 aa  83.2  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3071  TrkA domain-containing protein  32.08 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  32.02 
 
 		 626 aa  82.8  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  28.36 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  27.03 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2407  TrkA domain-containing protein  31.13 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  31.82 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  26.7 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  25.96 
 
 		 221 aa  78.6  0.00000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0020  potassium transporter peripheral membrane component  26.82 
 
 		 459 aa  79  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.688304  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  31.09 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  27.36 
 
 		 221 aa  78.2  0.00000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  26.58 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  34.75 
 
 		 221 aa  78.2  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  35 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  35.83 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00394  potassium transporter peripheral membrane component  25.79 
 
 		 458 aa  75.1  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0201  potassium transporter peripheral membrane component  26.36 
 
 		 457 aa  74.7  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0211158  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002054  Trk system potassium uptake protein TrkA  25.79 
 
 		 458 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  29.83 
 
 		 617 aa  74.7  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0026  potassium transporter peripheral membrane component  26.46 
 
 		 469 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.570638  hitchhiker  0.00237688 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0024  potassium transporter peripheral membrane component  26.46 
 
 		 469 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.738729  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0032  potassium transporter peripheral membrane component  26.46 
 
 		 469 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.21174  hitchhiker  0.00000689203 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0040  potassium transporter peripheral membrane component  25.68 
 
 		 469 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.165147 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0029  potassium transporter peripheral membrane component  26.46 
 
 		 469 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0021  potassium transporter peripheral membrane component  26.46 
 
 		 469 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881079  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2079  TrkA-N domain protein  27.23 
 
 		 458 aa  73.6  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01280  K+ transport system, NAD-binding component  35 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0312  potassium transporter peripheral membrane component  25.24 
 
 		 449 aa  73.9  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0720169  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0072  potassium transporter peripheral membrane component  23.98 
 
 		 458 aa  73.6  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1685  TrkA domain-containing protein  28.46 
 
 		 153 aa  73.9  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.124287  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0180  Trk system potassium uptake protein TrkA  30.09 
 
 		 457 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0016  potassium transporter peripheral membrane component  30.09 
 
 		 457 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04100  K+ transport system, NAD-binding component  36.21 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.453544  normal  0.632996 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3062  TrkA domain-containing protein  28.92 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.793731  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0014  potassium transporter peripheral membrane component  27.88 
 
 		 458 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00830339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  26.87 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00140  potassium transporter peripheral membrane component  27.14 
 
 		 457 aa  72.4  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35944  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0081  potassium transporter peripheral membrane component  26.11 
 
 		 458 aa  72  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2849  potassium transporter peripheral membrane component  25.35 
 
 		 457 aa  72  0.000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.336578  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  23.19 
 
 		 219 aa  72  0.000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1041  TrkA domain-containing protein  33.55 
 
 		 452 aa  72  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0065  potassium transporter peripheral membrane component  27.95 
 
 		 457 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948816  unclonable  0.000000448887 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2476  potassium transporter peripheral membrane component  23.98 
 
 		 458 aa  71.6  0.000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0081  potassium transporter peripheral membrane component  27.95 
 
 		 457 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685696  normal  0.107342 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>