More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2407 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2407  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 220 aa  441  1e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3071  TrkA domain-containing protein  94.55 
 
 		 220 aa  420  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2661  TrkA domain-containing protein  45.16 
 
 		 220 aa  182  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3062  TrkA domain-containing protein  42.86 
 
 		 227 aa  176  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.793731  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0638  TrkA-N  40 
 
 		 225 aa  170  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1924  TrkA-N domain protein  42.79 
 
 		 231 aa  167  8e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1520  TrkA-N domain protein  38.21 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1876  TrkA-N domain protein  36.41 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.416785  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  38.91 
 
 		 218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1633  TrkA-N domain protein  39.73 
 
 		 299 aa  143  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1561  TrkA-N domain protein  37.21 
 
 		 219 aa  142  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534326  normal  0.490374 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2256  TrkA-N domain protein  37.27 
 
 		 218 aa  142  5e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13318  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1640  TrkA domain-containing protein  39.51 
 
 		 253 aa  142  5e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0557692  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1485  TrkA domain-containing protein  37.33 
 
 		 229 aa  142  5e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0637531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  35 
 
 		 217 aa  141  9e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2196  TrkA-N  37.5 
 
 		 222 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2242  TrkA domain-containing protein  37.5 
 
 		 222 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.081798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2185  TrkA domain-containing protein  37.5 
 
 		 222 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314676  normal  0.0103731 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2286  TrkA-N domain-containing protein  36.11 
 
 		 219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.241613 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  34.47 
 
 		 221 aa  139  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1712  TrkA-N domain protein  35.94 
 
 		 219 aa  139  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.887824  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5192  TrkA domain-containing protein  35.61 
 
 		 259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0506525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1450  TrkA domain-containing protein  37.86 
 
 		 229 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0807714  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1322  TrkA-like  36.27 
 
 		 231 aa  137  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2472  TrkA domain-containing protein  36.41 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4528  TrkA-N domain-containing protein  35.59 
 
 		 222 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2904  TrkA domain-containing protein  35.81 
 
 		 223 aa  135  5e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3928  TrkA domain-containing protein  36.27 
 
 		 221 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399436  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  35.19 
 
 		 221 aa  134  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1399  TrkA domain-containing protein  34.42 
 
 		 233 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  35.19 
 
 		 221 aa  132  3e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1641  TrkA-N domain protein  34.12 
 
 		 233 aa  131  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  0.0943946 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  32.88 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6760  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  33.8 
 
 		 223 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0522309 
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  34.26 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1918  TrkA-N domain protein  31.67 
 
 		 224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388192  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16160  K+ transport system, NAD-binding component  33.33 
 
 		 249 aa  129  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.534565  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1941  TrkA-N domain protein  35.44 
 
 		 241 aa  129  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0298197 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12707  trk system potassium uptake protein ceoC  36.92 
 
 		 220 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.44928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  38.14 
 
 		 220 aa  128  7.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1406  TrkA-N domain protein  33.01 
 
 		 225 aa  128  8.000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.699899  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  31.63 
 
 		 221 aa  125  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  35.65 
 
 		 222 aa  123  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1707  TrkA-N domain protein  33.96 
 
 		 224 aa  123  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  34.36 
 
 		 223 aa  122  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0745  TrkA domain-containing protein  33.49 
 
 		 231 aa  121  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13080  K+ transport system, NAD-binding component  36.1 
 
 		 227 aa  116  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0024035  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0161  TrkA domain-containing protein  32.08 
 
 		 231 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.825727 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1929  putative potassium uptake protein  35.14 
 
 		 229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.123463  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11630  TrkA-C domain protein  32.43 
 
 		 207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  30.54 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3424  potassium transporter peripheral membrane component  28.63 
 
 		 448 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  35.21 
 
 		 225 aa  106  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0201  potassium transporter peripheral membrane component  34.09 
 
 		 457 aa  105  7e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0211158  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0542  TrkA-N domain protein  32.35 
 
 		 215 aa  104  9e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.840001  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  33.64 
 
 		 226 aa  101  7e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3063  TrkA domain-containing protein  35.07 
 
 		 214 aa  99.8  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1655  TrkA domain-containing protein  31.96 
 
 		 218 aa  99.4  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000867889  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1728  TrkA domain-containing protein  29.95 
 
 		 218 aa  99.4  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000194267  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2267  TrkA-N domain protein  33.18 
 
 		 459 aa  99  5e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.634076  hitchhiker  0.00765776 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  32.04 
 
 		 445 aa  98.2  9e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2030  potassium transporter peripheral membrane component  31.53 
 
 		 465 aa  97.8  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0693486  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01280  K+ transport system, NAD-binding component  33.19 
 
 		 225 aa  96.7  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0612  potassium transporter peripheral membrane component  32.29 
 
 		 458 aa  97.1  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0369792  normal  0.0559785 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0313  potassium transporter peripheral membrane component  32.29 
 
 		 458 aa  97.1  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.888467  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3885  potassium transporter peripheral membrane component  32.29 
 
 		 458 aa  97.1  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0054195  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0030  potassium transporter peripheral membrane component  30.34 
 
 		 454 aa  95.9  4e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  33.33 
 
 		 449 aa  95.9  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  35.98 
 
 		 630 aa  95.5  6e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0020  potassium transporter peripheral membrane component  32.86 
 
 		 457 aa  95.5  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  34.7 
 
 		 628 aa  94.4  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4514  potassium transporter peripheral membrane component  33.02 
 
 		 458 aa  94.7  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00906883  hitchhiker  0.00000865676 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_29  cation transport protein, Trk system  30.34 
 
 		 454 aa  94  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2660  TrkA domain-containing protein  35.41 
 
 		 214 aa  93.2  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0646767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3126  potassium transporter peripheral membrane component  32.44 
 
 		 458 aa  93.2  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0180  Trk system potassium uptake protein TrkA  33.8 
 
 		 457 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2479  TrkA-N domain protein  31.82 
 
 		 445 aa  90.9  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0021  potassium transporter peripheral membrane component  32.85 
 
 		 469 aa  90.9  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881079  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0038  potassium transporter peripheral membrane component  32.86 
 
 		 458 aa  90.9  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3605  potassium transporter peripheral membrane component  31.16 
 
 		 458 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267887  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3713  potassium transporter peripheral membrane component  31.16 
 
 		 458 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.461523 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3606  potassium transporter peripheral membrane component  31.16 
 
 		 458 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3678  potassium transporter peripheral membrane component  31.16 
 
 		 458 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0040  potassium transporter peripheral membrane component  32.37 
 
 		 469 aa  90.9  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.165147 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3776  potassium transporter peripheral membrane component  31.16 
 
 		 458 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3430  potassium transporter peripheral membrane component  26.87 
 
 		 448 aa  90.1  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0375932  normal  0.146617 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0024  potassium transporter peripheral membrane component  32.37 
 
 		 469 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0187  potassium transporter peripheral membrane component  31.08 
 
 		 465 aa  90.1  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0028  potassium transporter peripheral membrane component  32.37 
 
 		 469 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.736909  normal  0.0141363 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0436  potassium transporter peripheral membrane component  31.39 
 
 		 458 aa  90.1  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0021  potassium transporter peripheral membrane component  32.37 
 
 		 469 aa  90.1  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0028  potassium transporter peripheral membrane component  31.4 
 
 		 469 aa  90.1  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0028  potassium transporter peripheral membrane component  32.37 
 
 		 469 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000283519 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0029  potassium transporter peripheral membrane component  32.37 
 
 		 469 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.313972  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0035  potassium transporter peripheral membrane component  31.4 
 
 		 469 aa  89.7  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.154438 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0424  potassium transporter peripheral membrane component  30.7 
 
 		 458 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000421391 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3585  potassium transporter peripheral membrane component  30.7 
 
 		 458 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.931761  normal  0.13042 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03091  hypothetical protein  30.7 
 
 		 458 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3483  potassium transporter peripheral membrane component  30.7 
 
 		 458 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0624843  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  27.7 
 
 		 443 aa  89.7  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>