More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3062 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3062  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 227 aa  447  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.793731  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2661  TrkA domain-containing protein  81.82 
 
 		 220 aa  353  1e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0638  TrkA-N  55.17 
 
 		 225 aa  222  3e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3071  TrkA domain-containing protein  43.32 
 
 		 220 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2407  TrkA domain-containing protein  42.86 
 
 		 220 aa  176  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5192  TrkA domain-containing protein  42.29 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0506525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  38.18 
 
 		 218 aa  158  8e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1322  TrkA-like  38.57 
 
 		 231 aa  148  6e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1561  TrkA-N domain protein  42.58 
 
 		 219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534326  normal  0.490374 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1633  TrkA-N domain protein  37.39 
 
 		 299 aa  145  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1640  TrkA domain-containing protein  38.63 
 
 		 253 aa  144  9e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0557692  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1924  TrkA-N domain protein  44.02 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2286  TrkA-N domain-containing protein  36.61 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.241613 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  38.76 
 
 		 217 aa  142  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1712  TrkA-N domain protein  37.5 
 
 		 219 aa  141  8e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.887824  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  35.16 
 
 		 221 aa  138  6e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2904  TrkA domain-containing protein  35.96 
 
 		 223 aa  138  7e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  35.16 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13080  K+ transport system, NAD-binding component  41.71 
 
 		 227 aa  137  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0024035  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1707  TrkA-N domain protein  37.16 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4528  TrkA-N domain-containing protein  34.51 
 
 		 222 aa  137  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2256  TrkA-N domain protein  35.98 
 
 		 218 aa  137  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13318  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16160  K+ transport system, NAD-binding component  35.71 
 
 		 249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.534565  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  37.73 
 
 		 220 aa  136  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1450  TrkA domain-containing protein  35.98 
 
 		 229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0807714  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1520  TrkA-N domain protein  37.79 
 
 		 218 aa  136  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6760  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  36.16 
 
 		 223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0522309 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  34.7 
 
 		 221 aa  135  4e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2196  TrkA-N  35.43 
 
 		 222 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2242  TrkA domain-containing protein  35.43 
 
 		 222 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.081798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2185  TrkA domain-containing protein  35.43 
 
 		 222 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314676  normal  0.0103731 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1406  TrkA-N domain protein  35.32 
 
 		 225 aa  135  5e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.699899  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1399  TrkA domain-containing protein  34.68 
 
 		 233 aa  135  5e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1485  TrkA domain-containing protein  35.51 
 
 		 229 aa  135  5e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0637531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1941  TrkA-N domain protein  37.14 
 
 		 241 aa  132  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0298197 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1918  TrkA-N domain protein  36.04 
 
 		 224 aa  132  5e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388192  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  34.11 
 
 		 218 aa  132  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1876  TrkA-N domain protein  34.7 
 
 		 220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.416785  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  34.13 
 
 		 221 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2472  TrkA domain-containing protein  34.08 
 
 		 221 aa  128  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3928  TrkA domain-containing protein  34.08 
 
 		 221 aa  128  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399436  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1641  TrkA-N domain protein  34.29 
 
 		 233 aa  128  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  0.0943946 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12707  trk system potassium uptake protein ceoC  35.12 
 
 		 220 aa  124  8.000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.44928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  36.23 
 
 		 223 aa  125  8.000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  31.39 
 
 		 221 aa  120  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  34.36 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  37.56 
 
 		 226 aa  119  3e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  32.59 
 
 		 222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11630  TrkA-C domain protein  34.59 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01280  K+ transport system, NAD-binding component  37.8 
 
 		 225 aa  108  8.000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1929  putative potassium uptake protein  37.23 
 
 		 229 aa  107  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.123463  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0542  TrkA-N domain protein  30.85 
 
 		 215 aa  102  4e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.840001  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2875  TrkA-N domain protein  36.12 
 
 		 226 aa  101  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  28.77 
 
 		 219 aa  101  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  35.32 
 
 		 630 aa  100  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  28.9 
 
 		 221 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  28.9 
 
 		 221 aa  99.8  3e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  28.9 
 
 		 221 aa  99.4  5e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3063  TrkA domain-containing protein  33.91 
 
 		 214 aa  97.8  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2267  TrkA-N domain protein  32.73 
 
 		 459 aa  97.8  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.634076  hitchhiker  0.00765776 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1681  potassium transporter peripheral membrane component  32.43 
 
 		 458 aa  97.1  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0081  potassium transporter peripheral membrane component  30.32 
 
 		 458 aa  97.1  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2622  potassium transporter peripheral membrane component  31.82 
 
 		 458 aa  95.5  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637696 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2660  TrkA domain-containing protein  34.25 
 
 		 214 aa  95.1  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0646767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0020  potassium transporter peripheral membrane component  31.65 
 
 		 457 aa  95.1  8e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1728  TrkA domain-containing protein  29.09 
 
 		 218 aa  94.7  9e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000194267  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  29.82 
 
 		 443 aa  94.4  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  33 
 
 		 445 aa  94.7  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4082  potassium transporter peripheral membrane component  31.44 
 
 		 467 aa  94.4  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0161  TrkA domain-containing protein  30.81 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.825727 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0187  potassium transporter peripheral membrane component  29.87 
 
 		 465 aa  94  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0745  TrkA domain-containing protein  31.02 
 
 		 231 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  30.88 
 
 		 450 aa  91.3  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  30.69 
 
 		 214 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0072  potassium transporter peripheral membrane component  31.28 
 
 		 458 aa  90.9  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4514  potassium transporter peripheral membrane component  28.64 
 
 		 458 aa  90.5  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00906883  hitchhiker  0.00000865676 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  27.8 
 
 		 450 aa  89.7  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  27.27 
 
 		 221 aa  89.7  3e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3126  potassium transporter peripheral membrane component  25.69 
 
 		 458 aa  89.7  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  36.36 
 
 		 626 aa  89.7  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2476  potassium transporter peripheral membrane component  31.28 
 
 		 458 aa  89.4  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3424  potassium transporter peripheral membrane component  26.83 
 
 		 448 aa  88.6  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0612  potassium transporter peripheral membrane component  27.73 
 
 		 458 aa  88.6  7e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0369792  normal  0.0559785 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0313  potassium transporter peripheral membrane component  27.73 
 
 		 458 aa  88.6  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.888467  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3885  potassium transporter peripheral membrane component  27.73 
 
 		 458 aa  88.6  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0054195  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1655  TrkA domain-containing protein  28.64 
 
 		 218 aa  88.6  7e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000867889  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0084  potassium transporter peripheral membrane component  31.58 
 
 		 457 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.409393  hitchhiker  0.00000000549949 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3072  TrkA domain-containing protein  30.2 
 
 		 214 aa  88.6  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002054  Trk system potassium uptake protein TrkA  30.33 
 
 		 458 aa  87.8  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1970  potassium transporter peripheral membrane component  28.94 
 
 		 453 aa  87.8  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.616677  normal  0.0915611 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0052  potassium transporter peripheral membrane component  30.45 
 
 		 457 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00394  potassium transporter peripheral membrane component  29.86 
 
 		 458 aa  87.4  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  29.95 
 
 		 449 aa  88.2  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00140  potassium transporter peripheral membrane component  30.45 
 
 		 457 aa  87  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35944  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1590  potassium transporter peripheral membrane component  27.4 
 
 		 449 aa  87  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00906485  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0029  potassium transporter peripheral membrane component  29.73 
 
 		 469 aa  87  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0026  potassium transporter peripheral membrane component  29.73 
 
 		 469 aa  86.7  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.570638  hitchhiker  0.00237688 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0024  potassium transporter peripheral membrane component  29.73 
 
 		 469 aa  86.7  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.738729  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0021  potassium transporter peripheral membrane component  29.28 
 
 		 469 aa  87  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00170  potassium transporter peripheral membrane component  31.75 
 
 		 457 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>