More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2911 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  100 
 
 		 449 aa  895    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  60.36 
 
 		 445 aa  538  9.999999999999999e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  38.75 
 
 		 450 aa  314  2.9999999999999996e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3424  potassium transporter peripheral membrane component  40.27 
 
 		 448 aa  309  8e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3430  potassium transporter peripheral membrane component  38.05 
 
 		 448 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0375932  normal  0.146617 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  36.4 
 
 		 443 aa  298  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  36.18 
 
 		 450 aa  292  1e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1310  potassium transporter peripheral membrane component  35.86 
 
 		 444 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3218  potassium transporter peripheral membrane component  34.36 
 
 		 454 aa  264  3e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.715113  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2030  potassium transporter peripheral membrane component  33.48 
 
 		 465 aa  263  6.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0693486  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0734  TrkA-N domain protein  36.3 
 
 		 450 aa  259  6e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0030  potassium transporter peripheral membrane component  31.8 
 
 		 454 aa  251  1e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0312  potassium transporter peripheral membrane component  31.69 
 
 		 449 aa  252  1e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0720169  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3126  potassium transporter peripheral membrane component  33.41 
 
 		 458 aa  251  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1469  TrkA-N domain protein  35.96 
 
 		 454 aa  249  7e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12243  putative potassium uptake protein  32.67 
 
 		 449 aa  248  1e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_29  cation transport protein, Trk system  31.8 
 
 		 454 aa  247  4e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1970  potassium transporter peripheral membrane component  34.66 
 
 		 453 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.616677  normal  0.0915611 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0819  potassium transporter peripheral membrane component  34.16 
 
 		 437 aa  243  3e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5096  TrkA-N domain protein  33.41 
 
 		 448 aa  242  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4396  potassium transporter peripheral membrane component  33.41 
 
 		 458 aa  239  5.999999999999999e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0641614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0020  potassium transporter peripheral membrane component  34.21 
 
 		 457 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1681  potassium transporter peripheral membrane component  33.77 
 
 		 458 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1877  potassium transporter peripheral membrane component  33.41 
 
 		 445 aa  232  9e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.113601 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1590  potassium transporter peripheral membrane component  29.48 
 
 		 449 aa  232  1e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00906485  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1399  TrkA-N domain protein  32.75 
 
 		 455 aa  231  2e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000200171  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2455  potassium transporter peripheral membrane component  33.77 
 
 		 452 aa  231  3e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.341783  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4082  potassium transporter peripheral membrane component  33.69 
 
 		 467 aa  230  5e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0029  potassium transporter peripheral membrane component  31.58 
 
 		 454 aa  229  8e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2479  TrkA-N domain protein  32.05 
 
 		 445 aa  229  1e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0699  TrkA-N domain protein  30.34 
 
 		 444 aa  224  3e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3183  potassium transporter peripheral membrane component  31.4 
 
 		 465 aa  223  6e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00657284  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1569  potassium transporter peripheral membrane component  31.94 
 
 		 458 aa  223  8e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0202479  normal  0.0449671 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0088  potassium transporter peripheral membrane component  31.24 
 
 		 462 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1186  potassium transporter peripheral membrane component  29.15 
 
 		 445 aa  219  6e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.596494  decreased coverage  0.00000028569 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4514  potassium transporter peripheral membrane component  31.83 
 
 		 458 aa  219  7e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00906883  hitchhiker  0.00000865676 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2085  TrkA-N domain protein  31.45 
 
 		 444 aa  218  1e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0017  potassium transporter peripheral membrane component  32.46 
 
 		 457 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0353  potassium transporter peripheral membrane component  32.38 
 
 		 458 aa  218  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0052  potassium transporter peripheral membrane component  32.89 
 
 		 457 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0014  potassium transporter peripheral membrane component  32.39 
 
 		 458 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00830339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0201  potassium transporter peripheral membrane component  32.89 
 
 		 457 aa  216  7e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0211158  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0108  potassium transporter peripheral membrane component  31.52 
 
 		 462 aa  215  9.999999999999999e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.386766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3721  potassium transporter peripheral membrane component  30.97 
 
 		 458 aa  215  9.999999999999999e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.455601  hitchhiker  0.00773793 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00170  potassium transporter peripheral membrane component  32.46 
 
 		 457 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0180  Trk system potassium uptake protein TrkA  32.02 
 
 		 457 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3678  potassium transporter peripheral membrane component  31.4 
 
 		 458 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3776  potassium transporter peripheral membrane component  31.4 
 
 		 458 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1615  potassium transporter peripheral membrane component  31.14 
 
 		 458 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3605  potassium transporter peripheral membrane component  31.4 
 
 		 458 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267887  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3606  potassium transporter peripheral membrane component  31.4 
 
 		 458 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3713  potassium transporter peripheral membrane component  31.4 
 
 		 458 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.461523 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1093  potassium transporter peripheral membrane component  31.07 
 
 		 458 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0436  potassium transporter peripheral membrane component  31.18 
 
 		 458 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03140  potassium transporter peripheral membrane component  30.97 
 
 		 458 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.946548  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0424  TrkA-N domain protein  30.97 
 
 		 458 aa  211  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4612  potassium transporter peripheral membrane component  30.97 
 
 		 458 aa  211  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00524775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3585  potassium transporter peripheral membrane component  30.97 
 
 		 458 aa  211  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.931761  normal  0.13042 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3483  potassium transporter peripheral membrane component  30.97 
 
 		 458 aa  211  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0624843  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03091  hypothetical protein  30.97 
 
 		 458 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0424  potassium transporter peripheral membrane component  30.97 
 
 		 458 aa  211  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000421391 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3772  potassium transporter peripheral membrane component  30.97 
 
 		 458 aa  211  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.241443  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3674  potassium transporter peripheral membrane component  30.97 
 
 		 458 aa  211  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0187  potassium transporter peripheral membrane component  29.73 
 
 		 465 aa  211  3e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1491  potassium transporter peripheral membrane component  29.82 
 
 		 458 aa  211  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1041  TrkA domain-containing protein  30.62 
 
 		 452 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0040  potassium transporter peripheral membrane component  32.19 
 
 		 467 aa  211  3e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2841  potassium transporter peripheral membrane component  29.82 
 
 		 458 aa  210  4e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340173  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1453  potassium transporter peripheral membrane component  29.82 
 
 		 458 aa  210  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.687964  normal  0.06884 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3971  potassium transporter peripheral membrane component  31.51 
 
 		 458 aa  209  7e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0755481  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3792  potassium transporter peripheral membrane component  31.51 
 
 		 458 aa  209  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2242  potassium transporter peripheral membrane component  30.33 
 
 		 458 aa  207  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0521644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0084  potassium transporter peripheral membrane component  31.58 
 
 		 457 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.409393  hitchhiker  0.00000000549949 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0313  potassium transporter peripheral membrane component  31.94 
 
 		 458 aa  206  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.888467  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0016  potassium transporter peripheral membrane component  31.36 
 
 		 457 aa  206  5e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0612  potassium transporter peripheral membrane component  31.94 
 
 		 458 aa  206  5e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0369792  normal  0.0559785 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3885  potassium transporter peripheral membrane component  31.94 
 
 		 458 aa  206  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0054195  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0081  potassium transporter peripheral membrane component  31.14 
 
 		 457 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  hitchhiker  0.0000000000177319 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0038  potassium transporter peripheral membrane component  32.11 
 
 		 458 aa  206  7e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0081  potassium transporter peripheral membrane component  31.14 
 
 		 457 aa  206  8e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685696  normal  0.107342 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0065  potassium transporter peripheral membrane component  31.14 
 
 		 457 aa  206  9e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948816  unclonable  0.000000448887 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00140  potassium transporter peripheral membrane component  31.58 
 
 		 457 aa  205  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35944  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3437  potassium transporter peripheral membrane component  30.21 
 
 		 452 aa  204  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0014  TrkA domain-containing protein  31.81 
 
 		 457 aa  204  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0240987 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0081  potassium transporter peripheral membrane component  31.07 
 
 		 458 aa  205  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2622  potassium transporter peripheral membrane component  33.04 
 
 		 458 aa  204  4e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637696 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3261  potassium transporter peripheral membrane component  31.54 
 
 		 484 aa  203  5e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.386779  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3912  potassium transporter peripheral membrane component  31.54 
 
 		 484 aa  203  5e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2209  potassium transporter peripheral membrane component  28.88 
 
 		 458 aa  202  8e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002054  Trk system potassium uptake protein TrkA  29.03 
 
 		 458 aa  201  3e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5999  potassium transporter peripheral membrane component  31.26 
 
 		 485 aa  201  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0135992 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0769  TrkA-N domain protein  32.27 
 
 		 445 aa  200  3.9999999999999996e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.601936 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00394  potassium transporter peripheral membrane component  29.71 
 
 		 458 aa  199  6e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0040  potassium transporter peripheral membrane component  31.83 
 
 		 469 aa  199  7e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.165147 
 
 
-
 
NC_004310  BR1114  potassium transporter peripheral membrane component  28.23 
 
 		 458 aa  199  1.0000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1072  potassium transporter peripheral membrane component  28.23 
 
 		 458 aa  198  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0072  potassium transporter peripheral membrane component  30.84 
 
 		 458 aa  197  3e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2849  potassium transporter peripheral membrane component  31.87 
 
 		 457 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.336578  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0029  potassium transporter peripheral membrane component  31.61 
 
 		 469 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0021  potassium transporter peripheral membrane component  31.83 
 
 		 469 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>