More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1520 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1520  TrkA-N domain protein  100 
 
 		 218 aa  429  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  76.39 
 
 		 217 aa  319  1.9999999999999998e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1876  TrkA-N domain protein  68.66 
 
 		 220 aa  295  5e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.416785  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1712  TrkA-N domain protein  69.34 
 
 		 219 aa  294  7e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.887824  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1450  TrkA domain-containing protein  70.09 
 
 		 229 aa  293  1e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0807714  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2256  TrkA-N domain protein  69.44 
 
 		 218 aa  293  1e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13318  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1485  TrkA domain-containing protein  69.63 
 
 		 229 aa  291  5e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0637531  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2286  TrkA-N domain-containing protein  68.4 
 
 		 219 aa  288  3e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.241613 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1399  TrkA domain-containing protein  66.67 
 
 		 233 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6760  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  66.98 
 
 		 223 aa  280  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0522309 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4528  TrkA-N domain-containing protein  66.2 
 
 		 222 aa  279  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3928  TrkA domain-containing protein  67.13 
 
 		 221 aa  279  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399436  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2904  TrkA domain-containing protein  63.89 
 
 		 223 aa  278  7e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2472  TrkA domain-containing protein  67.14 
 
 		 221 aa  272  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2196  TrkA-N  64.81 
 
 		 222 aa  270  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2242  TrkA domain-containing protein  64.81 
 
 		 222 aa  270  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.081798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2185  TrkA domain-containing protein  64.81 
 
 		 222 aa  270  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314676  normal  0.0103731 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1641  TrkA-N domain protein  65.22 
 
 		 233 aa  267  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  0.0943946 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0745  TrkA domain-containing protein  59.55 
 
 		 231 aa  260  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12707  trk system potassium uptake protein ceoC  64.71 
 
 		 220 aa  260  1e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.44928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5192  TrkA domain-containing protein  61.4 
 
 		 259 aa  255  4e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0506525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0161  TrkA domain-containing protein  59.73 
 
 		 231 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.825727 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1561  TrkA-N domain protein  58.06 
 
 		 219 aa  250  1e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534326  normal  0.490374 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1707  TrkA-N domain protein  57.82 
 
 		 224 aa  244  8e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1941  TrkA-N domain protein  56.02 
 
 		 241 aa  244  8e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0298197 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1322  TrkA-like  57.6 
 
 		 231 aa  243  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16160  K+ transport system, NAD-binding component  55.56 
 
 		 249 aa  240  1e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.534565  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1918  TrkA-N domain protein  55.66 
 
 		 224 aa  234  7e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388192  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1406  TrkA-N domain protein  53.85 
 
 		 225 aa  226  3e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.699899  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1633  TrkA-N domain protein  51.85 
 
 		 299 aa  221  7e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1640  TrkA domain-containing protein  52.31 
 
 		 253 aa  220  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0557692  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1929  putative potassium uptake protein  55.19 
 
 		 229 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.123463  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1924  TrkA-N domain protein  50.92 
 
 		 231 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2875  TrkA-N domain protein  51.58 
 
 		 226 aa  188  5.999999999999999e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13080  K+ transport system, NAD-binding component  47.57 
 
 		 227 aa  173  9.999999999999999e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0024035  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2407  TrkA domain-containing protein  38.21 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0638  TrkA-N  34.86 
 
 		 225 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3071  TrkA domain-containing protein  37.26 
 
 		 220 aa  145  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  35.48 
 
 		 218 aa  145  6e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2661  TrkA domain-containing protein  40.19 
 
 		 220 aa  142  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3062  TrkA domain-containing protein  37.79 
 
 		 227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.793731  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  39.22 
 
 		 223 aa  132  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  35.29 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  32.11 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  32.57 
 
 		 221 aa  119  3e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  32.11 
 
 		 221 aa  118  6e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  29.58 
 
 		 221 aa  118  6e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  31.31 
 
 		 218 aa  115  6e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0542  TrkA-N domain protein  34.17 
 
 		 215 aa  111  7.000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.840001  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  29.63 
 
 		 221 aa  109  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11630  TrkA-C domain protein  34.66 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  31.19 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1728  TrkA domain-containing protein  27.65 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000194267  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  29.03 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1655  TrkA domain-containing protein  28.85 
 
 		 218 aa  102  5e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000867889  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  29.03 
 
 		 221 aa  101  8e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  28.57 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  28.11 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  34.22 
 
 		 626 aa  99.4  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  26.27 
 
 		 219 aa  99.4  4e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  31.96 
 
 		 443 aa  97.4  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01280  K+ transport system, NAD-binding component  32.98 
 
 		 225 aa  95.9  4e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2258  TrkA-N domain protein  32.57 
 
 		 236 aa  93.2  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  32.13 
 
 		 225 aa  92.4  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  28.51 
 
 		 450 aa  91.7  9e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  29.63 
 
 		 226 aa  91.3  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4396  potassium transporter peripheral membrane component  30.67 
 
 		 458 aa  91.3  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0641614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0633  TrkA-N domain protein  31.34 
 
 		 248 aa  90.1  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  30.43 
 
 		 630 aa  88.6  7e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2849  potassium transporter peripheral membrane component  28.89 
 
 		 457 aa  87.8  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.336578  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1877  potassium transporter peripheral membrane component  32.08 
 
 		 445 aa  87  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.113601 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1681  potassium transporter peripheral membrane component  30.62 
 
 		 458 aa  85.9  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3126  potassium transporter peripheral membrane component  28.76 
 
 		 458 aa  85.5  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  31.5 
 
 		 214 aa  85.1  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2479  TrkA-N domain protein  29.17 
 
 		 445 aa  84.7  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  28.97 
 
 		 445 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4126  potassium transporter peripheral membrane component  28.7 
 
 		 458 aa  82  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.215607  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  30.22 
 
 		 628 aa  81.6  0.000000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3424  potassium transporter peripheral membrane component  28.71 
 
 		 448 aa  82  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3072  TrkA domain-containing protein  30.5 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  29.36 
 
 		 449 aa  81.6  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2267  TrkA-N domain protein  31.25 
 
 		 459 aa  80.1  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.634076  hitchhiker  0.00765776 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0201  potassium transporter peripheral membrane component  29.95 
 
 		 457 aa  80.1  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0211158  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1363  sodium/hydrogen exchanger  26.82 
 
 		 610 aa  80.1  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00040523  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0072  potassium transporter peripheral membrane component  27.11 
 
 		 458 aa  80.1  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  29.67 
 
 		 450 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  34.06 
 
 		 617 aa  79.7  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1062  TrkA-N domain-containing protein  35 
 
 		 445 aa  79.3  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.121384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00170  potassium transporter peripheral membrane component  28 
 
 		 457 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1489  hypothetical protein  27.49 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00984888  normal  0.0109156 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1491  potassium transporter peripheral membrane component  28.57 
 
 		 458 aa  78.6  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2030  potassium transporter peripheral membrane component  27.31 
 
 		 465 aa  78.6  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0693486  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0112  TrkA-N domain protein  29.63 
 
 		 617 aa  78.2  0.00000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0081  potassium transporter peripheral membrane component  26.09 
 
 		 458 aa  78.2  0.00000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0017  potassium transporter peripheral membrane component  28 
 
 		 457 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12243  putative potassium uptake protein  24.26 
 
 		 449 aa  77.8  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0088  potassium transporter peripheral membrane component  24.65 
 
 		 462 aa  77.8  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0040  potassium transporter peripheral membrane component  26.92 
 
 		 467 aa  77.4  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3430  potassium transporter peripheral membrane component  28.11 
 
 		 448 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0375932  normal  0.146617 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2841  potassium transporter peripheral membrane component  29.02 
 
 		 458 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>