More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0846 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  100 
 
 
221 aa  432  1e-120  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  97.74 
 
 
221 aa  425  1e-118  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  95.48 
 
 
221 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  88.69 
 
 
221 aa  384  1e-106  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  34.25 
 
 
450 aa  129  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  33.64 
 
 
449 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  34.72 
 
 
218 aa  123  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  35.65 
 
 
445 aa  121  6e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  31.51 
 
 
221 aa  120  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  34.8 
 
 
226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  31.96 
 
 
221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  31.51 
 
 
221 aa  117  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2079  TrkA-N domain protein  31.22 
 
 
225 aa  116  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  31.96 
 
 
443 aa  116  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2455  potassium transporter peripheral membrane component  30.45 
 
 
452 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.341783  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  29.55 
 
 
450 aa  115  7.999999999999999e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1590  potassium transporter peripheral membrane component  32.69 
 
 
449 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00906485  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  32.11 
 
 
218 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3424  potassium transporter peripheral membrane component  32.02 
 
 
448 aa  113  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  32.42 
 
 
219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0018  potassium transporter peripheral membrane component  33.78 
 
 
477 aa  112  6e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.265003  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0312  potassium transporter peripheral membrane component  27.67 
 
 
449 aa  111  9e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0720169  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3430  potassium transporter peripheral membrane component  32.27 
 
 
448 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0375932  normal  0.146617 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  33.94 
 
 
221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12243  putative potassium uptake protein  34.11 
 
 
449 aa  110  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0734  TrkA-N domain protein  33.18 
 
 
450 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  29.44 
 
 
220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1310  potassium transporter peripheral membrane component  30.26 
 
 
444 aa  109  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1924  TrkA-N domain protein  32.11 
 
 
231 aa  108  5e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1213  TrkA-N domain protein  28.05 
 
 
228 aa  108  6e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1489  hypothetical protein  29.95 
 
 
218 aa  108  6e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00984888  normal  0.0109156 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16160  K+ transport system, NAD-binding component  31.1 
 
 
249 aa  108  8.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.534565  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1216  TrkA-N domain protein  28.02 
 
 
229 aa  107  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  28.64 
 
 
222 aa  106  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2030  potassium transporter peripheral membrane component  32.41 
 
 
465 aa  106  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0693486  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1944  TrkA domain-containing protein  30.63 
 
 
222 aa  106  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.772638 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00170  potassium transporter peripheral membrane component  31.28 
 
 
457 aa  105  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  28.9 
 
 
217 aa  105  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1970  potassium transporter peripheral membrane component  33.78 
 
 
453 aa  104  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.616677  normal  0.0915611 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0017  potassium transporter peripheral membrane component  30.81 
 
 
457 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1877  potassium transporter peripheral membrane component  31.13 
 
 
445 aa  101  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.113601 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1712  TrkA-N domain protein  28.05 
 
 
219 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.887824  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1400  TrkA-N domain-containing protein  29.03 
 
 
227 aa  100  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0180  Trk system potassium uptake protein TrkA  29.86 
 
 
457 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3062  TrkA domain-containing protein  28.9 
 
 
227 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.793731  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1681  potassium transporter peripheral membrane component  27.07 
 
 
458 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  31.84 
 
 
225 aa  100  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1918  TrkA-N domain protein  30.88 
 
 
224 aa  100  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388192  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1520  TrkA-N domain protein  28.11 
 
 
218 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_29  cation transport protein, Trk system  26.17 
 
 
454 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0201  potassium transporter peripheral membrane component  31.96 
 
 
457 aa  99.8  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0211158  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0052  potassium transporter peripheral membrane component  29.86 
 
 
457 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1399  TrkA domain-containing protein  28.38 
 
 
233 aa  99.8  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2904  TrkA domain-containing protein  27.73 
 
 
223 aa  99.4  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0016  potassium transporter peripheral membrane component  29.86 
 
 
457 aa  99  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4514  potassium transporter peripheral membrane component  31.42 
 
 
458 aa  99  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00906883  hitchhiker  0.00000865676 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002054  Trk system potassium uptake protein TrkA  30.04 
 
 
458 aa  99  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0187  potassium transporter peripheral membrane component  28.9 
 
 
465 aa  99  6e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00394  potassium transporter peripheral membrane component  30.04 
 
 
458 aa  99  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0072  potassium transporter peripheral membrane component  29.86 
 
 
458 aa  98.6  6e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0014  potassium transporter peripheral membrane component  28.51 
 
 
458 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00830339  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0081  potassium transporter peripheral membrane component  30.43 
 
 
458 aa  98.2  9e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0030  potassium transporter peripheral membrane component  25.7 
 
 
454 aa  97.4  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0542  TrkA-N domain protein  31.03 
 
 
215 aa  97.8  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.840001  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2849  potassium transporter peripheral membrane component  30 
 
 
457 aa  97.8  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.336578  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1641  TrkA-N domain protein  30.14 
 
 
233 aa  97.8  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  0.0943946 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0699  TrkA-N domain protein  29.25 
 
 
444 aa  97.4  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2286  TrkA-N domain-containing protein  29.22 
 
 
219 aa  97.8  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.241613 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00140  potassium transporter peripheral membrane component  29.55 
 
 
457 aa  97.1  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35944  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0436  potassium transporter peripheral membrane component  30.43 
 
 
458 aa  96.7  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3126  potassium transporter peripheral membrane component  27.31 
 
 
458 aa  97.1  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1941  TrkA-N domain protein  27.67 
 
 
241 aa  97.1  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0298197 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2267  TrkA-N domain protein  28.18 
 
 
459 aa  96.7  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.634076  hitchhiker  0.00765776 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0243  TrkA-N domain protein  38.93 
 
 
206 aa  96.7  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3020  potassium transporter peripheral membrane component  29.55 
 
 
457 aa  96.3  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2476  potassium transporter peripheral membrane component  29.15 
 
 
458 aa  96.3  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6760  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  28.19 
 
 
223 aa  95.5  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0522309 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1186  potassium transporter peripheral membrane component  28.17 
 
 
445 aa  95.5  5e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.596494  decreased coverage  0.00000028569 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5096  TrkA-N domain protein  28.11 
 
 
448 aa  95.5  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3721  potassium transporter peripheral membrane component  29.82 
 
 
458 aa  95.5  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.455601  hitchhiker  0.00773793 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0544  potassium transporter peripheral membrane component  29.49 
 
 
458 aa  95.1  7e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.027133  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0353  potassium transporter peripheral membrane component  30 
 
 
458 aa  94.7  9e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  30.52 
 
 
221 aa  94.4  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  31.37 
 
 
223 aa  94  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1485  TrkA domain-containing protein  27.31 
 
 
229 aa  94  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0637531  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1450  TrkA domain-containing protein  27.31 
 
 
229 aa  94  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0807714  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1041  TrkA domain-containing protein  27.73 
 
 
452 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0065  potassium transporter peripheral membrane component  27.96 
 
 
457 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948816  unclonable  0.000000448887 
 
 
-
 
NC_002950  PG2218  potassium transporter peripheral membrane component  30.09 
 
 
446 aa  93.6  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000230921 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1728  TrkA domain-containing protein  28.24 
 
 
218 aa  94  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000194267  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0612  potassium transporter peripheral membrane component  30.97 
 
 
458 aa  93.6  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0369792  normal  0.0559785 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3606  potassium transporter peripheral membrane component  29.39 
 
 
458 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3713  potassium transporter peripheral membrane component  29.39 
 
 
458 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.461523 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3605  potassium transporter peripheral membrane component  29.39 
 
 
458 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267887  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3776  potassium transporter peripheral membrane component  29.39 
 
 
458 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2085  TrkA-N domain protein  29.25 
 
 
444 aa  93.6  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0029  potassium transporter peripheral membrane component  25.93 
 
 
454 aa  94  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2472  TrkA domain-containing protein  28.18 
 
 
221 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0088  potassium transporter peripheral membrane component  26.22 
 
 
462 aa  93.6  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3678  potassium transporter peripheral membrane component  29.39 
 
 
458 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>