More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2904 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2904  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 223 aa  449  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2286  TrkA-N domain-containing protein  71.89 
 
 		 219 aa  320  9.999999999999999e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.241613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6760  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  70.59 
 
 		 223 aa  316  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0522309 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1712  TrkA-N domain protein  67.74 
 
 		 219 aa  301  4.0000000000000003e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.887824  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1450  TrkA domain-containing protein  69.38 
 
 		 229 aa  300  2e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0807714  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1485  TrkA domain-containing protein  68.9 
 
 		 229 aa  296  2e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0637531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1399  TrkA domain-containing protein  66.67 
 
 		 233 aa  290  9e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1641  TrkA-N domain protein  66.37 
 
 		 233 aa  287  8e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  0.0943946 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  65.28 
 
 		 217 aa  285  5.999999999999999e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1876  TrkA-N domain protein  62.84 
 
 		 220 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.416785  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4528  TrkA-N domain-containing protein  64.81 
 
 		 222 aa  280  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1520  TrkA-N domain protein  63.89 
 
 		 218 aa  278  7e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2256  TrkA-N domain protein  63.68 
 
 		 218 aa  274  8e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13318  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2196  TrkA-N  62.04 
 
 		 222 aa  270  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1707  TrkA-N domain protein  60.83 
 
 		 224 aa  270  1e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2242  TrkA domain-containing protein  62.04 
 
 		 222 aa  270  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.081798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5192  TrkA domain-containing protein  63.43 
 
 		 259 aa  270  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0506525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16160  K+ transport system, NAD-binding component  60.55 
 
 		 249 aa  270  1e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.534565  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2185  TrkA domain-containing protein  62.04 
 
 		 222 aa  270  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314676  normal  0.0103731 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1561  TrkA-N domain protein  62.5 
 
 		 219 aa  267  8.999999999999999e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534326  normal  0.490374 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2472  TrkA domain-containing protein  60.63 
 
 		 221 aa  267  1e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3928  TrkA domain-containing protein  60.65 
 
 		 221 aa  263  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399436  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1322  TrkA-like  59.56 
 
 		 231 aa  260  1e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1941  TrkA-N domain protein  60.49 
 
 		 241 aa  257  1e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0298197 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12707  trk system potassium uptake protein ceoC  58.94 
 
 		 220 aa  255  4e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.44928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1918  TrkA-N domain protein  58.53 
 
 		 224 aa  254  9e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388192  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1406  TrkA-N domain protein  54.59 
 
 		 225 aa  249  3e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.699899  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1633  TrkA-N domain protein  55.45 
 
 		 299 aa  245  3e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1640  TrkA domain-containing protein  56.42 
 
 		 253 aa  244  9e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0557692  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0745  TrkA domain-containing protein  50.66 
 
 		 231 aa  232  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0161  TrkA domain-containing protein  51.1 
 
 		 231 aa  227  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.825727 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1929  putative potassium uptake protein  54.93 
 
 		 229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.123463  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2875  TrkA-N domain protein  48.86 
 
 		 226 aa  195  6e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13080  K+ transport system, NAD-binding component  48.06 
 
 		 227 aa  193  2e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0024035  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1924  TrkA-N domain protein  45.16 
 
 		 231 aa  181  5.0000000000000004e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3062  TrkA domain-containing protein  35.96 
 
 		 227 aa  138  7e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.793731  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2661  TrkA domain-containing protein  36.24 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2407  TrkA domain-containing protein  35.81 
 
 		 220 aa  135  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3071  TrkA domain-containing protein  35.81 
 
 		 220 aa  135  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0638  TrkA-N  33.03 
 
 		 225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  31.51 
 
 		 218 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  33.48 
 
 		 221 aa  121  8e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  33.48 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  32.59 
 
 		 221 aa  118  7.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 		 223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  32.58 
 
 		 220 aa  112  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  29.55 
 
 		 221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  29.55 
 
 		 222 aa  108  9.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  28.92 
 
 		 221 aa  106  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  30.56 
 
 		 218 aa  105  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  27.73 
 
 		 221 aa  99.4  4e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  29.05 
 
 		 221 aa  98.6  6e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2479  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 		 445 aa  96.7  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0542  TrkA-N domain protein  30.65 
 
 		 215 aa  96.7  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.840001  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  29.05 
 
 		 221 aa  97.4  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01280  K+ transport system, NAD-binding component  29.95 
 
 		 225 aa  96.3  3e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  28.16 
 
 		 219 aa  95.9  4e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  31.6 
 
 		 630 aa  94  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  29.96 
 
 		 443 aa  92.8  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  29.63 
 
 		 226 aa  92.8  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11630  TrkA-C domain protein  29.78 
 
 		 207 aa  92.4  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  28.16 
 
 		 221 aa  91.7  8e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  29.03 
 
 		 449 aa  90.9  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  27.8 
 
 		 628 aa  85.9  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  29.02 
 
 		 225 aa  85.1  7e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  29.35 
 
 		 445 aa  84.3  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  32 
 
 		 450 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1728  TrkA domain-containing protein  25.81 
 
 		 218 aa  84  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000194267  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3126  potassium transporter peripheral membrane component  27.27 
 
 		 458 aa  84  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3739  potassium transporter peripheral membrane component  28.12 
 
 		 469 aa  84  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00764602 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0201  potassium transporter peripheral membrane component  28.38 
 
 		 457 aa  83.2  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0211158  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2267  TrkA-N domain protein  28.76 
 
 		 459 aa  82.8  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.634076  hitchhiker  0.00765776 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0035  potassium transporter peripheral membrane component  27.68 
 
 		 469 aa  82  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.154438 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0187  potassium transporter peripheral membrane component  26.79 
 
 		 465 aa  81.6  0.000000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1655  TrkA domain-containing protein  25.35 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000867889  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0032  potassium transporter peripheral membrane component  27.68 
 
 		 469 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0670474 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  28.38 
 
 		 626 aa  80.1  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1681  potassium transporter peripheral membrane component  29.44 
 
 		 458 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1276  TrkA-N domain protein  30.28 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.283168  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  25.89 
 
 		 450 aa  80.5  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0040  potassium transporter peripheral membrane component  27.68 
 
 		 469 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.165147 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0028  potassium transporter peripheral membrane component  27.23 
 
 		 469 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1310  potassium transporter peripheral membrane component  29.09 
 
 		 444 aa  79.3  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1062  TrkA-N domain-containing protein  33.5 
 
 		 445 aa  79.3  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.121384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0021  potassium transporter peripheral membrane component  26.79 
 
 		 469 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2849  potassium transporter peripheral membrane component  25.75 
 
 		 457 aa  77.8  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.336578  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1877  potassium transporter peripheral membrane component  31.48 
 
 		 445 aa  78.2  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.113601 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  30.94 
 
 		 617 aa  76.6  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0180  Trk system potassium uptake protein TrkA  28.96 
 
 		 457 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0769  TrkA-N domain protein  29.3 
 
 		 445 aa  77.4  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.601936 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0312  potassium transporter peripheral membrane component  26.54 
 
 		 449 aa  77  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0720169  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1186  potassium transporter peripheral membrane component  30.62 
 
 		 445 aa  76.6  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.596494  decreased coverage  0.00000028569 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0021  potassium transporter peripheral membrane component  27.23 
 
 		 469 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0028  potassium transporter peripheral membrane component  26.79 
 
 		 469 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.736909  normal  0.0141363 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4396  potassium transporter peripheral membrane component  26.94 
 
 		 458 aa  75.1  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0641614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0024  potassium transporter peripheral membrane component  26.79 
 
 		 469 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0028  potassium transporter peripheral membrane component  26.79 
 
 		 469 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000283519 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0029  potassium transporter peripheral membrane component  26.79 
 
 		 469 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.313972  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0026  potassium transporter peripheral membrane component  26.79 
 
 		 469 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.570638  hitchhiker  0.00237688 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0024  potassium transporter peripheral membrane component  26.79 
 
 		 469 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.738729  normal  0.0894147 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>