More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1929 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1929  putative potassium uptake protein  100 
 
 		 229 aa  431  1e-120  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.123463  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2875  TrkA-N domain protein  60.44 
 
 		 226 aa  249  3e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220378  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2286  TrkA-N domain-containing protein  55.11 
 
 		 219 aa  217  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.241613 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1520  TrkA-N domain protein  55.19 
 
 		 218 aa  214  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1712  TrkA-N domain protein  54.02 
 
 		 219 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.887824  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2904  TrkA domain-containing protein  54.93 
 
 		 223 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1876  TrkA-N domain protein  54.91 
 
 		 220 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.416785  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1399  TrkA domain-containing protein  53.45 
 
 		 233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6760  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  54.02 
 
 		 223 aa  207  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0522309 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1322  TrkA-like  53.33 
 
 		 231 aa  203  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1561  TrkA-N domain protein  53.81 
 
 		 219 aa  202  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534326  normal  0.490374 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4528  TrkA-N domain-containing protein  50.88 
 
 		 222 aa  201  8e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  53.77 
 
 		 217 aa  201  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1641  TrkA-N domain protein  54.98 
 
 		 233 aa  199  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  0.0943946 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2196  TrkA-N  52.05 
 
 		 222 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2242  TrkA domain-containing protein  52.05 
 
 		 222 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.081798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2185  TrkA domain-containing protein  52.05 
 
 		 222 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314676  normal  0.0103731 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2256  TrkA-N domain protein  52.97 
 
 		 218 aa  198  7e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13318  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1941  TrkA-N domain protein  52.36 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0298197 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5192  TrkA domain-containing protein  53.33 
 
 		 259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0506525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16160  K+ transport system, NAD-binding component  48.84 
 
 		 249 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.534565  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1485  TrkA domain-containing protein  49.78 
 
 		 229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0637531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1450  TrkA domain-containing protein  49.34 
 
 		 229 aa  196  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0807714  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3928  TrkA domain-containing protein  48.88 
 
 		 221 aa  191  9e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399436  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2472  TrkA domain-containing protein  50.68 
 
 		 221 aa  189  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1918  TrkA-N domain protein  47.53 
 
 		 224 aa  187  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388192  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1406  TrkA-N domain protein  45.89 
 
 		 225 aa  185  6e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.699899  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1707  TrkA-N domain protein  47.53 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1640  TrkA domain-containing protein  45.69 
 
 		 253 aa  179  4.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0557692  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1633  TrkA-N domain protein  45.95 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0745  TrkA domain-containing protein  42.06 
 
 		 231 aa  172  5e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0161  TrkA domain-containing protein  42.49 
 
 		 231 aa  171  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.825727 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12707  trk system potassium uptake protein ceoC  48.4 
 
 		 220 aa  171  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.44928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1924  TrkA-N domain protein  42.98 
 
 		 231 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13080  K+ transport system, NAD-binding component  42.2 
 
 		 227 aa  136  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0024035  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2661  TrkA domain-containing protein  38.77 
 
 		 220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  33.77 
 
 		 218 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2407  TrkA domain-containing protein  35.14 
 
 		 220 aa  113  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3071  TrkA domain-containing protein  36.11 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3062  TrkA domain-containing protein  37.23 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.793731  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  36.79 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  33.78 
 
 		 220 aa  101  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  30.84 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0638  TrkA-N  33.96 
 
 		 225 aa  99.8  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  31.58 
 
 		 221 aa  99  5e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  35.5 
 
 		 226 aa  99  6e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  31.14 
 
 		 221 aa  97.1  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  30.53 
 
 		 221 aa  95.1  7e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  29.96 
 
 		 630 aa  95.1  8e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  30.57 
 
 		 221 aa  94.7  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  30.57 
 
 		 221 aa  93.2  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  30.45 
 
 		 218 aa  90.9  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  29.69 
 
 		 221 aa  89.7  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  29.2 
 
 		 221 aa  88.2  9e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  30.91 
 
 		 626 aa  87.8  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2085  TrkA-N domain protein  35.87 
 
 		 444 aa  84.7  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  28.25 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1728  TrkA domain-containing protein  28.44 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000194267  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3063  TrkA domain-containing protein  34.32 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2660  TrkA domain-containing protein  35.47 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0646767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12706  trk system potassium uptake protein ceoB  34.12 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1944  TrkA domain-containing protein  31.67 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.772638 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1262  TrkA domain-containing protein  34.38 
 
 		 141 aa  80.9  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  34.29 
 
 		 443 aa  80.9  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2267  TrkA-N domain protein  33.49 
 
 		 459 aa  80.5  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.634076  hitchhiker  0.00765776 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1489  hypothetical protein  28.24 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00984888  normal  0.0109156 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0542  TrkA-N domain protein  30.65 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.840001  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  25.22 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2030  potassium transporter peripheral membrane component  31.46 
 
 		 465 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0693486  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0201  potassium transporter peripheral membrane component  33.64 
 
 		 457 aa  77.8  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0211158  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01280  K+ transport system, NAD-binding component  32.75 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1655  TrkA domain-containing protein  27.56 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000867889  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0112  TrkA-N domain protein  29.19 
 
 		 617 aa  77.8  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  30.04 
 
 		 617 aa  78.2  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0699  TrkA-N domain protein  34.47 
 
 		 444 aa  77.4  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1686  TrkA domain-containing protein  25.88 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0415019  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3126  potassium transporter peripheral membrane component  31.98 
 
 		 458 aa  77.4  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2479  TrkA-N domain protein  35.68 
 
 		 445 aa  77.4  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4396  potassium transporter peripheral membrane component  30.73 
 
 		 458 aa  76.6  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0641614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1209  potassium transporter peripheral membrane component  32.88 
 
 		 448 aa  76.3  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.356485  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  27.03 
 
 		 450 aa  75.5  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  30.57 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  31.1 
 
 		 628 aa  75.1  0.0000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  30.62 
 
 		 445 aa  73.6  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1445  potassium transporter peripheral membrane component  31.8 
 
 		 457 aa  73.9  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000607771 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1213  TrkA-N domain protein  31.14 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  32.08 
 
 		 450 aa  73.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2473  TrkA domain-containing protein  33.33 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.214066  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1877  potassium transporter peripheral membrane component  33.49 
 
 		 445 aa  72.8  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.113601 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3424  potassium transporter peripheral membrane component  29.82 
 
 		 448 aa  72.4  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0637  TrkA-N  26.34 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0432302 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11630  TrkA-C domain protein  27.23 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  23.61 
 
 		 221 aa  71.6  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0030  potassium transporter peripheral membrane component  26.21 
 
 		 454 aa  70.1  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  27.44 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  33.33 
 
 		 449 aa  70.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1093  potassium transporter peripheral membrane component  30.91 
 
 		 458 aa  69.7  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1216  TrkA-N domain protein  29.11 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2079  TrkA-N domain protein  31.34 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1469  TrkA-N domain protein  31.53 
 
 		 454 aa  68.9  0.00000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>