More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0242 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  100 
 
 
221 aa  444  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  48.37 
 
 
218 aa  202  4e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  43.41 
 
 
221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  39.73 
 
 
218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  38.43 
 
 
220 aa  160  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  37.1 
 
 
221 aa  159  3e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  36.2 
 
 
221 aa  157  1e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  35.75 
 
 
221 aa  156  3e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1728  TrkA domain-containing protein  38.21 
 
 
218 aa  144  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000194267  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0638  TrkA-N  34.25 
 
 
225 aa  143  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1655  TrkA domain-containing protein  37.74 
 
 
218 aa  142  3e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000867889  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  37.2 
 
 
223 aa  142  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2407  TrkA domain-containing protein  34.47 
 
 
220 aa  139  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  36.8 
 
 
226 aa  138  6e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  32.58 
 
 
222 aa  138  7e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1924  TrkA-N domain protein  36.57 
 
 
231 aa  135  4e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  34.08 
 
 
225 aa  134  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  31.67 
 
 
219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3071  TrkA domain-containing protein  33.98 
 
 
220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11630  TrkA-C domain protein  35.23 
 
 
207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0542  TrkA-N domain protein  35.12 
 
 
215 aa  132  5e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.840001  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3062  TrkA domain-containing protein  34.13 
 
 
227 aa  129  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.793731  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01280  K+ transport system, NAD-binding component  32.61 
 
 
225 aa  124  8.000000000000001e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  35.64 
 
 
445 aa  123  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16160  K+ transport system, NAD-binding component  32.43 
 
 
249 aa  121  6e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.534565  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1633  TrkA-N domain protein  33.64 
 
 
299 aa  121  8e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2661  TrkA domain-containing protein  32.57 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202256  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1640  TrkA domain-containing protein  32.43 
 
 
253 aa  118  9e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0557692  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1712  TrkA-N domain protein  27.48 
 
 
219 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.887824  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  29.72 
 
 
443 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2904  TrkA domain-containing protein  29.55 
 
 
223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1941  TrkA-N domain protein  29.67 
 
 
241 aa  111  7.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0298197 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2286  TrkA-N domain-containing protein  27.03 
 
 
219 aa  111  7.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.241613 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  34.39 
 
 
221 aa  111  7.000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6760  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  27.03 
 
 
223 aa  111  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0522309 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  33.94 
 
 
221 aa  111  9e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  33.94 
 
 
221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1310  potassium transporter peripheral membrane component  32.42 
 
 
444 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1707  TrkA-N domain protein  28.83 
 
 
224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1520  TrkA-N domain protein  29.63 
 
 
218 aa  109  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  31.36 
 
 
217 aa  108  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  33.48 
 
 
221 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  32.67 
 
 
449 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1485  TrkA domain-containing protein  30.29 
 
 
229 aa  108  9.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0637531  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5192  TrkA domain-containing protein  29.11 
 
 
259 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0506525  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1876  TrkA-N domain protein  25.91 
 
 
220 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.416785  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  29.06 
 
 
450 aa  105  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3424  potassium transporter peripheral membrane component  31.17 
 
 
448 aa  105  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1450  TrkA domain-containing protein  29.33 
 
 
229 aa  104  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0807714  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1561  TrkA-N domain protein  26.7 
 
 
219 aa  102  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534326  normal  0.490374 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  30.7 
 
 
450 aa  101  8e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1469  TrkA-N domain protein  28.85 
 
 
454 aa  101  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0734  TrkA-N domain protein  28.83 
 
 
450 aa  100  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0112  TrkA-N domain protein  33.03 
 
 
617 aa  100  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2256  TrkA-N domain protein  29.86 
 
 
218 aa  100  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13318  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3430  potassium transporter peripheral membrane component  26.85 
 
 
448 aa  99.8  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0375932  normal  0.146617 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1322  TrkA-like  28.17 
 
 
231 aa  99.8  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  33.63 
 
 
630 aa  99.8  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0014  potassium transporter peripheral membrane component  29.41 
 
 
458 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00830339  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2196  TrkA-N  27.85 
 
 
222 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2242  TrkA domain-containing protein  27.85 
 
 
222 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.081798  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2185  TrkA domain-containing protein  27.85 
 
 
222 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314676  normal  0.0103731 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2030  potassium transporter peripheral membrane component  27.54 
 
 
465 aa  99  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0693486  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0065  potassium transporter peripheral membrane component  28.96 
 
 
457 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948816  unclonable  0.000000448887 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2841  potassium transporter peripheral membrane component  28.44 
 
 
458 aa  97.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340173  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1970  potassium transporter peripheral membrane component  31.02 
 
 
453 aa  97.8  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.616677  normal  0.0915611 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0081  potassium transporter peripheral membrane component  28.96 
 
 
457 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  hitchhiker  0.0000000000177319 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1453  potassium transporter peripheral membrane component  28.44 
 
 
458 aa  97.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.687964  normal  0.06884 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0201  potassium transporter peripheral membrane component  27.48 
 
 
457 aa  96.7  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0211158  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0052  potassium transporter peripheral membrane component  26.79 
 
 
457 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1686  TrkA domain-containing protein  28.57 
 
 
219 aa  96.3  3e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0415019  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12243  putative potassium uptake protein  28.71 
 
 
449 aa  96.3  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2472  TrkA domain-containing protein  26.94 
 
 
221 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0081  potassium transporter peripheral membrane component  28.51 
 
 
457 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685696  normal  0.107342 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1491  potassium transporter peripheral membrane component  27.98 
 
 
458 aa  95.5  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3218  potassium transporter peripheral membrane component  27.15 
 
 
454 aa  95.5  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.715113  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4528  TrkA-N domain-containing protein  25.56 
 
 
222 aa  95.5  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1399  TrkA-N domain protein  29.95 
 
 
455 aa  95.5  6e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000200171  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1406  TrkA-N domain protein  30.43 
 
 
225 aa  94.7  9e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.699899  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3928  TrkA domain-containing protein  26.94 
 
 
221 aa  94.7  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399436  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_002936  DET0030  potassium transporter peripheral membrane component  28.37 
 
 
454 aa  94.7  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  31.05 
 
 
628 aa  94.4  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00170  potassium transporter peripheral membrane component  27.68 
 
 
457 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0016  potassium transporter peripheral membrane component  27.6 
 
 
457 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3261  potassium transporter peripheral membrane component  30.65 
 
 
484 aa  93.6  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.386779  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_29  cation transport protein, Trk system  28.37 
 
 
454 aa  94  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1918  TrkA-N domain protein  27.18 
 
 
224 aa  94  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388192  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3912  potassium transporter peripheral membrane component  30.65 
 
 
484 aa  93.6  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2455  potassium transporter peripheral membrane component  27.06 
 
 
452 aa  92.8  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.341783  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00140  potassium transporter peripheral membrane component  27.6 
 
 
457 aa  92.8  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35944  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0819  potassium transporter peripheral membrane component  29.82 
 
 
437 aa  93.2  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  32.59 
 
 
626 aa  92.8  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12707  trk system potassium uptake protein ceoC  29.27 
 
 
220 aa  92.4  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.44928  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2660  TrkA domain-containing protein  28.44 
 
 
214 aa  92.4  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0646767  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0029  potassium transporter peripheral membrane component  30.39 
 
 
454 aa  92.4  4e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0084  potassium transporter peripheral membrane component  27.6 
 
 
457 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.409393  hitchhiker  0.00000000549949 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2267  TrkA-N domain protein  27.15 
 
 
459 aa  92  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.634076  hitchhiker  0.00765776 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1489  hypothetical protein  27.98 
 
 
218 aa  92  6e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00984888  normal  0.0109156 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0769  TrkA-N domain protein  30.7 
 
 
445 aa  91.7  7e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.601936 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1399  TrkA domain-containing protein  24.2 
 
 
233 aa  92  7e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>