More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12707 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12707  trk system potassium uptake protein ceoC  100 
 
 		 220 aa  433  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.44928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2472  TrkA domain-containing protein  82.95 
 
 		 221 aa  368  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2196  TrkA-N  81.57 
 
 		 222 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2242  TrkA domain-containing protein  81.57 
 
 		 222 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.081798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2185  TrkA domain-containing protein  81.57 
 
 		 222 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314676  normal  0.0103731 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3928  TrkA domain-containing protein  81.57 
 
 		 221 aa  362  3e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399436  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2256  TrkA-N domain protein  72.17 
 
 		 218 aa  309  2e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13318  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  67.59 
 
 		 217 aa  291  6e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1485  TrkA domain-containing protein  64.06 
 
 		 229 aa  283  1.0000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0637531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1450  TrkA domain-containing protein  63.59 
 
 		 229 aa  282  2.0000000000000002e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0807714  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2286  TrkA-N domain-containing protein  64.35 
 
 		 219 aa  280  9e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.241613 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1399  TrkA domain-containing protein  65.9 
 
 		 233 aa  280  1e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1520  TrkA-N domain protein  65.28 
 
 		 218 aa  280  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1876  TrkA-N domain protein  63.47 
 
 		 220 aa  279  2e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.416785  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2904  TrkA domain-containing protein  60.27 
 
 		 223 aa  275  3e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6760  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  62.5 
 
 		 223 aa  274  8e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0522309 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1712  TrkA-N domain protein  61.11 
 
 		 219 aa  271  6e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.887824  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4528  TrkA-N domain-containing protein  59.91 
 
 		 222 aa  263  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1322  TrkA-like  58.8 
 
 		 231 aa  252  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1641  TrkA-N domain protein  59.31 
 
 		 233 aa  251  7e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  0.0943946 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5192  TrkA domain-containing protein  59.72 
 
 		 259 aa  246  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0506525  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1707  TrkA-N domain protein  54.38 
 
 		 224 aa  242  3e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1941  TrkA-N domain protein  56.04 
 
 		 241 aa  241  6e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0298197 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16160  K+ transport system, NAD-binding component  53.02 
 
 		 249 aa  236  1e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.534565  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1633  TrkA-N domain protein  54.13 
 
 		 299 aa  237  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1561  TrkA-N domain protein  53.24 
 
 		 219 aa  235  5.0000000000000005e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534326  normal  0.490374 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1406  TrkA-N domain protein  54.19 
 
 		 225 aa  234  6e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.699899  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1918  TrkA-N domain protein  52.53 
 
 		 224 aa  233  2.0000000000000002e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388192  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1640  TrkA domain-containing protein  53.21 
 
 		 253 aa  231  5e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0557692  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0161  TrkA domain-containing protein  51.79 
 
 		 231 aa  223  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.825727 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0745  TrkA domain-containing protein  50.45 
 
 		 231 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1929  putative potassium uptake protein  48.4 
 
 		 229 aa  190  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.123463  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1924  TrkA-N domain protein  47.51 
 
 		 231 aa  190  1e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13080  K+ transport system, NAD-binding component  47.34 
 
 		 227 aa  182  5.0000000000000004e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0024035  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2875  TrkA-N domain protein  45.37 
 
 		 226 aa  176  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2661  TrkA domain-containing protein  36.53 
 
 		 220 aa  141  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3071  TrkA domain-containing protein  37.04 
 
 		 220 aa  140  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2407  TrkA domain-containing protein  36.57 
 
 		 220 aa  139  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0638  TrkA-N  34.4 
 
 		 225 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3062  TrkA domain-containing protein  34.98 
 
 		 227 aa  132  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.793731  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  33.49 
 
 		 218 aa  128  8.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  31.19 
 
 		 218 aa  119  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  35.78 
 
 		 223 aa  119  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  34.07 
 
 		 220 aa  115  6e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  31.19 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  28.64 
 
 		 221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  32.39 
 
 		 221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  30.73 
 
 		 221 aa  108  5e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  29.03 
 
 		 219 aa  106  3e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  30.14 
 
 		 221 aa  105  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  28.11 
 
 		 221 aa  101  8e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0542  TrkA-N domain protein  33.17 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.840001  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  29.03 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  27.65 
 
 		 221 aa  99.4  4e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  27.19 
 
 		 221 aa  97.1  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  30 
 
 		 222 aa  94.7  9e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11630  TrkA-C domain protein  29.47 
 
 		 207 aa  94.7  9e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  29.78 
 
 		 226 aa  94.4  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  31.94 
 
 		 445 aa  91.3  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2849  potassium transporter peripheral membrane component  27.73 
 
 		 457 aa  90.5  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.336578  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0017  potassium transporter peripheral membrane component  30.19 
 
 		 457 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00170  potassium transporter peripheral membrane component  29.72 
 
 		 457 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  29.65 
 
 		 225 aa  86.7  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  31.02 
 
 		 449 aa  86.7  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0014  potassium transporter peripheral membrane component  30.05 
 
 		 458 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00830339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  28.38 
 
 		 450 aa  86.7  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1728  TrkA domain-containing protein  25.69 
 
 		 218 aa  86.7  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000194267  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0052  potassium transporter peripheral membrane component  29.25 
 
 		 457 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  29.44 
 
 		 443 aa  85.1  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2267  TrkA-N domain protein  28.44 
 
 		 459 aa  84.7  9e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.634076  hitchhiker  0.00765776 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1062  TrkA-N domain-containing protein  37.37 
 
 		 445 aa  84.7  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.121384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1681  potassium transporter peripheral membrane component  30.09 
 
 		 458 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01280  K+ transport system, NAD-binding component  29.79 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2258  TrkA-N domain protein  30.14 
 
 		 236 aa  84  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1655  TrkA domain-containing protein  26.15 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000867889  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  28.44 
 
 		 630 aa  82.8  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00140  potassium transporter peripheral membrane component  27.83 
 
 		 457 aa  81.3  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35944  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0065  potassium transporter peripheral membrane component  27.44 
 
 		 457 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948816  unclonable  0.000000448887 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0081  potassium transporter peripheral membrane component  27.44 
 
 		 457 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685696  normal  0.107342 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0084  potassium transporter peripheral membrane component  27.44 
 
 		 457 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.409393  hitchhiker  0.00000000549949 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2479  TrkA-N domain protein  28.83 
 
 		 445 aa  80.9  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0081  potassium transporter peripheral membrane component  27.44 
 
 		 457 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  hitchhiker  0.0000000000177319 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4082  potassium transporter peripheral membrane component  27.31 
 
 		 467 aa  80.1  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0018  potassium transporter peripheral membrane component  27.97 
 
 		 477 aa  79.3  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.265003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3424  potassium transporter peripheral membrane component  28.38 
 
 		 448 aa  79  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1944  TrkA domain-containing protein  31.13 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.772638 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0016  potassium transporter peripheral membrane component  26.42 
 
 		 457 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0633  TrkA-N domain protein  27.52 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3792  potassium transporter peripheral membrane component  29.52 
 
 		 458 aa  77.4  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0081  potassium transporter peripheral membrane component  25.79 
 
 		 458 aa  77.4  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0180  Trk system potassium uptake protein TrkA  26.42 
 
 		 457 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0020  potassium transporter peripheral membrane component  29.11 
 
 		 457 aa  77  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1877  potassium transporter peripheral membrane component  28.97 
 
 		 445 aa  77  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.113601 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  27.98 
 
 		 450 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3126  potassium transporter peripheral membrane component  28.18 
 
 		 458 aa  76.6  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  29.46 
 
 		 626 aa  76.6  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0088  potassium transporter peripheral membrane component  25.88 
 
 		 462 aa  76.3  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3971  potassium transporter peripheral membrane component  28.44 
 
 		 458 aa  75.5  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0755481  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0040  potassium transporter peripheral membrane component  25.65 
 
 		 467 aa  75.5  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4126  potassium transporter peripheral membrane component  26.27 
 
 		 458 aa  74.7  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.215607  normal  0.664042 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>