More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3071 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3071  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 220 aa  438  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2407  TrkA domain-containing protein  94.55 
 
 		 220 aa  420  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2661  TrkA domain-containing protein  43.78 
 
 		 220 aa  178  4.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3062  TrkA domain-containing protein  43.32 
 
 		 227 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.793731  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0638  TrkA-N  40 
 
 		 225 aa  165  5e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1924  TrkA-N domain protein  41.4 
 
 		 231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1876  TrkA-N domain protein  36.41 
 
 		 220 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.416785  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1520  TrkA-N domain protein  37.26 
 
 		 218 aa  145  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  38.6 
 
 		 218 aa  144  9e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  37.27 
 
 		 217 aa  144  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1485  TrkA domain-containing protein  39.32 
 
 		 229 aa  142  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0637531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2196  TrkA-N  37.5 
 
 		 222 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2242  TrkA domain-containing protein  37.5 
 
 		 222 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.081798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2185  TrkA domain-containing protein  37.5 
 
 		 222 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314676  normal  0.0103731 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2256  TrkA-N domain protein  37.27 
 
 		 218 aa  142  5e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13318  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1633  TrkA-N domain protein  40 
 
 		 299 aa  142  5e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1561  TrkA-N domain protein  38.25 
 
 		 219 aa  141  6e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534326  normal  0.490374 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2286  TrkA-N domain-containing protein  36.11 
 
 		 219 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.241613 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1640  TrkA domain-containing protein  39.02 
 
 		 253 aa  139  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0557692  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4528  TrkA-N domain-containing protein  36.87 
 
 		 222 aa  139  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1450  TrkA domain-containing protein  37.33 
 
 		 229 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0807714  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2472  TrkA domain-containing protein  37.33 
 
 		 221 aa  137  8.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1399  TrkA domain-containing protein  35.35 
 
 		 233 aa  137  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2904  TrkA domain-containing protein  35.81 
 
 		 223 aa  135  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1322  TrkA-like  36.27 
 
 		 231 aa  134  7.000000000000001e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1406  TrkA-N domain protein  33.98 
 
 		 225 aa  134  8e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.699899  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1641  TrkA-N domain protein  35.07 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  0.0943946 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  33.98 
 
 		 221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3928  TrkA domain-containing protein  35.81 
 
 		 221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399436  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16160  K+ transport system, NAD-binding component  34.25 
 
 		 249 aa  132  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.534565  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5192  TrkA domain-containing protein  35.92 
 
 		 259 aa  133  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0506525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  35.65 
 
 		 221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1712  TrkA-N domain protein  34.56 
 
 		 219 aa  132  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.887824  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12707  trk system potassium uptake protein ceoC  37.24 
 
 		 220 aa  131  6.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.44928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  35.65 
 
 		 221 aa  131  7.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  38.6 
 
 		 220 aa  131  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6760  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  33.8 
 
 		 223 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0522309 
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  34.72 
 
 		 221 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 		 218 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1918  TrkA-N domain protein  32.58 
 
 		 224 aa  129  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388192  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1941  TrkA-N domain protein  35.44 
 
 		 241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0298197 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  35.19 
 
 		 222 aa  122  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1707  TrkA-N domain protein  32.58 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0745  TrkA domain-containing protein  32.89 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  30.7 
 
 		 221 aa  117  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  32.6 
 
 		 223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13080  K+ transport system, NAD-binding component  34.63 
 
 		 227 aa  113  3e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0024035  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0161  TrkA domain-containing protein  32.55 
 
 		 231 aa  112  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.825727 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11630  TrkA-C domain protein  32.43 
 
 		 207 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1929  putative potassium uptake protein  36.11 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.123463  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3424  potassium transporter peripheral membrane component  29.07 
 
 		 448 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  30.54 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0201  potassium transporter peripheral membrane component  34.09 
 
 		 457 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0211158  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  35.02 
 
 		 226 aa  102  4e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  34.27 
 
 		 225 aa  102  6e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0313  potassium transporter peripheral membrane component  32.74 
 
 		 458 aa  99  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.888467  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0612  potassium transporter peripheral membrane component  32.74 
 
 		 458 aa  99  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0369792  normal  0.0559785 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3885  potassium transporter peripheral membrane component  32.74 
 
 		 458 aa  99  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0054195  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0542  TrkA-N domain protein  31.31 
 
 		 215 aa  98.6  6e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.840001  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2030  potassium transporter peripheral membrane component  32.06 
 
 		 465 aa  98.2  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0693486  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4514  potassium transporter peripheral membrane component  33.95 
 
 		 458 aa  97.8  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00906883  hitchhiker  0.00000865676 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0020  potassium transporter peripheral membrane component  33.33 
 
 		 457 aa  97.4  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2267  TrkA-N domain protein  33.18 
 
 		 459 aa  97.4  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.634076  hitchhiker  0.00765776 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  32.04 
 
 		 445 aa  97.1  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0040  potassium transporter peripheral membrane component  34.3 
 
 		 469 aa  96.3  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.165147 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  35.35 
 
 		 628 aa  94.4  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0028  potassium transporter peripheral membrane component  33.82 
 
 		 469 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.736909  normal  0.0141363 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1655  TrkA domain-containing protein  32.06 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000867889  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0028  potassium transporter peripheral membrane component  33.82 
 
 		 469 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000283519 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3063  TrkA domain-containing protein  33.65 
 
 		 214 aa  94.7  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0024  potassium transporter peripheral membrane component  33.82 
 
 		 469 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0029  potassium transporter peripheral membrane component  33.82 
 
 		 469 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.313972  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0030  potassium transporter peripheral membrane component  31.36 
 
 		 454 aa  93.6  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0436  potassium transporter peripheral membrane component  33.48 
 
 		 458 aa  93.6  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2479  TrkA-N domain protein  30.95 
 
 		 445 aa  94  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0028  potassium transporter peripheral membrane component  32.85 
 
 		 469 aa  93.2  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1728  TrkA domain-containing protein  29.03 
 
 		 218 aa  93.6  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000194267  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  31.08 
 
 		 450 aa  93.6  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0021  potassium transporter peripheral membrane component  33.82 
 
 		 469 aa  93.2  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881079  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0021  potassium transporter peripheral membrane component  32.14 
 
 		 469 aa  92.8  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  35.05 
 
 		 630 aa  92.8  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3126  potassium transporter peripheral membrane component  32.43 
 
 		 458 aa  92.8  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0029  potassium transporter peripheral membrane component  33.33 
 
 		 469 aa  92.8  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3430  potassium transporter peripheral membrane component  27.31 
 
 		 448 aa  92.8  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0375932  normal  0.146617 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0021  potassium transporter peripheral membrane component  33.33 
 
 		 469 aa  92.8  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0035  potassium transporter peripheral membrane component  32.37 
 
 		 469 aa  92.4  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.154438 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0032  potassium transporter peripheral membrane component  32.85 
 
 		 469 aa  92  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0670474 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1310  potassium transporter peripheral membrane component  29.68 
 
 		 444 aa  92  6e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0353  potassium transporter peripheral membrane component  32.29 
 
 		 458 aa  92  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3792  potassium transporter peripheral membrane component  33.33 
 
 		 458 aa  92  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0026  potassium transporter peripheral membrane component  33.33 
 
 		 469 aa  91.7  8e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.570638  hitchhiker  0.00237688 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0024  potassium transporter peripheral membrane component  33.33 
 
 		 469 aa  91.7  8e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.738729  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0032  potassium transporter peripheral membrane component  33.33 
 
 		 469 aa  91.7  8e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.21174  hitchhiker  0.00000689203 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  32.86 
 
 		 449 aa  91.7  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_29  cation transport protein, Trk system  30.77 
 
 		 454 aa  91.3  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01280  K+ transport system, NAD-binding component  31.86 
 
 		 225 aa  90.9  1e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3739  potassium transporter peripheral membrane component  32.85 
 
 		 469 aa  90.9  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00764602 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2660  TrkA domain-containing protein  33.97 
 
 		 214 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0646767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1681  potassium transporter peripheral membrane component  34.47 
 
 		 458 aa  90.1  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  28.64 
 
 		 443 aa  90.5  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>