More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3757 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  100 
 
 		 217 aa  422  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1520  TrkA-N domain protein  76.39 
 
 		 218 aa  319  1.9999999999999998e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1450  TrkA domain-containing protein  69.48 
 
 		 229 aa  297  7e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0807714  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2256  TrkA-N domain protein  69.12 
 
 		 218 aa  294  7e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13318  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1399  TrkA domain-containing protein  69.91 
 
 		 233 aa  291  4e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1712  TrkA-N domain protein  67.59 
 
 		 219 aa  291  5e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.887824  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2286  TrkA-N domain-containing protein  68.9 
 
 		 219 aa  291  5e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.241613 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1485  TrkA domain-containing protein  68.54 
 
 		 229 aa  291  5e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0637531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1876  TrkA-N domain protein  66.67 
 
 		 220 aa  289  2e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.416785  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2904  TrkA domain-containing protein  65.28 
 
 		 223 aa  285  5e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2196  TrkA-N  67.13 
 
 		 222 aa  282  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2242  TrkA domain-containing protein  67.13 
 
 		 222 aa  282  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.081798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2185  TrkA domain-containing protein  67.13 
 
 		 222 aa  282  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314676  normal  0.0103731 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6760  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  66.04 
 
 		 223 aa  282  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0522309 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2472  TrkA domain-containing protein  68.69 
 
 		 221 aa  281  6.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3928  TrkA domain-containing protein  67.59 
 
 		 221 aa  279  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399436  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4528  TrkA-N domain-containing protein  65.42 
 
 		 222 aa  278  4e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12707  trk system potassium uptake protein ceoC  67.65 
 
 		 220 aa  273  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.44928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1641  TrkA-N domain protein  64.73 
 
 		 233 aa  270  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  0.0943946 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5192  TrkA domain-containing protein  64.39 
 
 		 259 aa  261  4.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0506525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1561  TrkA-N domain protein  59.26 
 
 		 219 aa  252  3e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534326  normal  0.490374 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16160  K+ transport system, NAD-binding component  56.04 
 
 		 249 aa  249  3e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.534565  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1406  TrkA-N domain protein  56.73 
 
 		 225 aa  249  3e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.699899  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1322  TrkA-like  60 
 
 		 231 aa  245  4e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0161  TrkA domain-containing protein  56.56 
 
 		 231 aa  244  9e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.825727 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1941  TrkA-N domain protein  56.94 
 
 		 241 aa  243  1.9999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0298197 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1707  TrkA-N domain protein  55.56 
 
 		 224 aa  241  5e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0745  TrkA domain-containing protein  53.18 
 
 		 231 aa  239  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1640  TrkA domain-containing protein  54.17 
 
 		 253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0557692  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1633  TrkA-N domain protein  52.78 
 
 		 299 aa  233  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1918  TrkA-N domain protein  53.7 
 
 		 224 aa  231  5e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388192  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1924  TrkA-N domain protein  52.07 
 
 		 231 aa  204  8e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1929  putative potassium uptake protein  53.77 
 
 		 229 aa  201  9e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.123463  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2875  TrkA-N domain protein  52.27 
 
 		 226 aa  186  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13080  K+ transport system, NAD-binding component  47.09 
 
 		 227 aa  182  4.0000000000000006e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0024035  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0638  TrkA-N  36.53 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2661  TrkA domain-containing protein  39.72 
 
 		 220 aa  148  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3071  TrkA domain-containing protein  37.27 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  34.56 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3062  TrkA domain-containing protein  38.76 
 
 		 227 aa  142  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.793731  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2407  TrkA domain-containing protein  35 
 
 		 220 aa  141  8e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0542  TrkA-N domain protein  37.5 
 
 		 215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.840001  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  37.16 
 
 		 220 aa  126  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  32.11 
 
 		 221 aa  126  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  37.75 
 
 		 223 aa  124  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  31.19 
 
 		 221 aa  121  8e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  31.19 
 
 		 221 aa  121  8e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  30.28 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  30.23 
 
 		 218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11630  TrkA-C domain protein  31.41 
 
 		 207 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  29.82 
 
 		 221 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  31.36 
 
 		 221 aa  108  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  29.49 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  29.36 
 
 		 221 aa  105  4e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  28.9 
 
 		 221 aa  105  6e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  28.17 
 
 		 219 aa  102  4e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  31 
 
 		 226 aa  100  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  29.36 
 
 		 222 aa  100  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1728  TrkA domain-containing protein  28.57 
 
 		 218 aa  99.4  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000194267  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1655  TrkA domain-containing protein  29.03 
 
 		 218 aa  95.9  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000867889  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1489  hypothetical protein  31.96 
 
 		 218 aa  94.7  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00984888  normal  0.0109156 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2660  TrkA domain-containing protein  33.18 
 
 		 214 aa  93.2  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0646767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01280  K+ transport system, NAD-binding component  30.67 
 
 		 225 aa  93.2  3e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3063  TrkA domain-containing protein  30.53 
 
 		 214 aa  92.8  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  31.9 
 
 		 450 aa  92  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  32.31 
 
 		 225 aa  92  6e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  30.45 
 
 		 443 aa  91.7  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  31.22 
 
 		 626 aa  91.3  9e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2479  TrkA-N domain protein  32.55 
 
 		 445 aa  90.9  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  32.21 
 
 		 214 aa  90.1  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2258  TrkA-N domain protein  32.13 
 
 		 236 aa  90.1  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  29.44 
 
 		 630 aa  89.7  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  28.26 
 
 		 628 aa  89  5e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2030  potassium transporter peripheral membrane component  27.91 
 
 		 465 aa  88.2  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0693486  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2849  potassium transporter peripheral membrane component  27.88 
 
 		 457 aa  87.8  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.336578  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0637  TrkA-N  28.64 
 
 		 219 aa  86.7  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0432302 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0201  potassium transporter peripheral membrane component  30.43 
 
 		 457 aa  87.4  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0211158  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3072  TrkA domain-containing protein  31.25 
 
 		 214 aa  85.9  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  33.8 
 
 		 617 aa  85.1  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0112  TrkA-N domain protein  31.44 
 
 		 617 aa  85.1  8e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  29.9 
 
 		 445 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  27.06 
 
 		 450 aa  84  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1276  TrkA-N domain protein  31.02 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.283168  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0633  TrkA-N domain protein  28.57 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0020  potassium transporter peripheral membrane component  28.23 
 
 		 457 aa  82  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0187  potassium transporter peripheral membrane component  28.44 
 
 		 465 aa  81.6  0.000000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4126  potassium transporter peripheral membrane component  28.77 
 
 		 458 aa  81.6  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.215607  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3126  potassium transporter peripheral membrane component  26.36 
 
 		 458 aa  81.6  0.000000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1062  TrkA-N domain-containing protein  35.29 
 
 		 445 aa  80.9  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.121384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  30.73 
 
 		 449 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2267  TrkA-N domain protein  28.77 
 
 		 459 aa  80.5  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.634076  hitchhiker  0.00765776 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1681  potassium transporter peripheral membrane component  29.55 
 
 		 458 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2622  potassium transporter peripheral membrane component  27.18 
 
 		 458 aa  79.7  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637696 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10580  TrkA-N domain protein  27.52 
 
 		 447 aa  80.1  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3424  potassium transporter peripheral membrane component  31.05 
 
 		 448 aa  79  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4396  potassium transporter peripheral membrane component  28.64 
 
 		 458 aa  78.6  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0641614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0699  TrkA-N domain protein  31.31 
 
 		 444 aa  79  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2872  potassium transporter peripheral membrane component  28.85 
 
 		 457 aa  79  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3020  potassium transporter peripheral membrane component  28.1 
 
 		 457 aa  78.6  0.00000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0180  Trk system potassium uptake protein TrkA  27.67 
 
 		 457 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>