More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1633 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1633  TrkA-N domain protein  100 
 
 
299 aa  589  1e-167  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1640  TrkA domain-containing protein  94.52 
 
 
253 aa  412  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0557692  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1941  TrkA-N domain protein  56.43 
 
 
241 aa  263  4e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0298197 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1707  TrkA-N domain protein  56.7 
 
 
224 aa  258  1e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1561  TrkA-N domain protein  58.33 
 
 
219 aa  257  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534326  normal  0.490374 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6760  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  57.6 
 
 
223 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0522309 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16160  K+ transport system, NAD-binding component  59.31 
 
 
249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.534565  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1712  TrkA-N domain protein  57.14 
 
 
219 aa  251  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.887824  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1918  TrkA-N domain protein  59.31 
 
 
224 aa  251  1e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388192  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1399  TrkA domain-containing protein  56.48 
 
 
233 aa  246  4e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2904  TrkA domain-containing protein  55.45 
 
 
223 aa  245  6.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1406  TrkA-N domain protein  57.35 
 
 
225 aa  244  1.9999999999999999e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.699899  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2286  TrkA-N domain-containing protein  56.22 
 
 
219 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.241613 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3928  TrkA domain-containing protein  56.48 
 
 
221 aa  241  9e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399436  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1641  TrkA-N domain protein  55.83 
 
 
233 aa  241  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  0.0943946 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2196  TrkA-N  55.71 
 
 
222 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4528  TrkA-N domain-containing protein  55.87 
 
 
222 aa  240  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2242  TrkA domain-containing protein  55.71 
 
 
222 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.081798  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2185  TrkA domain-containing protein  55.71 
 
 
222 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314676  normal  0.0103731 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2472  TrkA domain-containing protein  55.56 
 
 
221 aa  238  8e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5192  TrkA domain-containing protein  56.94 
 
 
259 aa  236  4e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0506525  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13080  K+ transport system, NAD-binding component  52.89 
 
 
227 aa  235  8e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0024035  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  52.78 
 
 
217 aa  233  3e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1450  TrkA domain-containing protein  51.57 
 
 
229 aa  231  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0807714  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2256  TrkA-N domain protein  54.93 
 
 
218 aa  230  2e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13318  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1485  TrkA domain-containing protein  51.57 
 
 
229 aa  229  3e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0637531  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1322  TrkA-like  56.48 
 
 
231 aa  229  5e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12707  trk system potassium uptake protein ceoC  54.13 
 
 
220 aa  221  8e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.44928  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1520  TrkA-N domain protein  51.85 
 
 
218 aa  221  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1876  TrkA-N domain protein  50 
 
 
220 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.416785  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0161  TrkA domain-containing protein  40.89 
 
 
231 aa  190  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.825727 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0745  TrkA domain-containing protein  40 
 
 
231 aa  189  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26958  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1929  putative potassium uptake protein  45.95 
 
 
229 aa  176  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.123463  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1924  TrkA-N domain protein  44.34 
 
 
231 aa  167  2e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2875  TrkA-N domain protein  58.59 
 
 
226 aa  157  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220378  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3062  TrkA domain-containing protein  37.39 
 
 
227 aa  145  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.793731  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2661  TrkA domain-containing protein  39.63 
 
 
220 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202256  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2407  TrkA domain-containing protein  39.73 
 
 
220 aa  143  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3071  TrkA domain-containing protein  40 
 
 
220 aa  142  8e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0638  TrkA-N  35.16 
 
 
225 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  34.86 
 
 
218 aa  133  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  33.33 
 
 
221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  33.33 
 
 
221 aa  125  8.000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  31.98 
 
 
221 aa  122  6e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  35.61 
 
 
223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  33.64 
 
 
221 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  36.61 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  32.24 
 
 
218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  30.32 
 
 
222 aa  109  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  29.76 
 
 
221 aa  102  9e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  28.96 
 
 
219 aa  99.4  6e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1728  TrkA domain-containing protein  30.81 
 
 
218 aa  97.8  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000194267  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1655  TrkA domain-containing protein  29.38 
 
 
218 aa  92.4  7e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000867889  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0312  potassium transporter peripheral membrane component  29.95 
 
 
449 aa  92.4  8e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0720169  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  30.97 
 
 
226 aa  92  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0542  TrkA-N domain protein  34.52 
 
 
215 aa  89.4  6e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.840001  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11630  TrkA-C domain protein  29.65 
 
 
207 aa  89.4  8e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01280  K+ transport system, NAD-binding component  34.22 
 
 
225 aa  88.2  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  31.11 
 
 
225 aa  87.4  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  29.67 
 
 
450 aa  87.4  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0017  potassium transporter peripheral membrane component  29.02 
 
 
457 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  27.23 
 
 
221 aa  87.8  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  27.23 
 
 
221 aa  87  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0187  potassium transporter peripheral membrane component  28.07 
 
 
465 aa  87  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00170  potassium transporter peripheral membrane component  28.57 
 
 
457 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  26.79 
 
 
221 aa  86.3  5e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0052  potassium transporter peripheral membrane component  28.63 
 
 
457 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  27.73 
 
 
443 aa  86.3  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2622  potassium transporter peripheral membrane component  28.9 
 
 
458 aa  85.9  8e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.637696 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0065  potassium transporter peripheral membrane component  28.76 
 
 
457 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948816  unclonable  0.000000448887 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0081  potassium transporter peripheral membrane component  28.76 
 
 
457 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  hitchhiker  0.0000000000177319 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0084  potassium transporter peripheral membrane component  28.76 
 
 
457 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.409393  hitchhiker  0.00000000549949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0081  potassium transporter peripheral membrane component  28.76 
 
 
457 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685696  normal  0.107342 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0201  potassium transporter peripheral membrane component  29.39 
 
 
457 aa  85.1  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0211158  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0020  potassium transporter peripheral membrane component  31.02 
 
 
457 aa  84.3  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  25.89 
 
 
221 aa  83.2  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3424  potassium transporter peripheral membrane component  28.25 
 
 
448 aa  83.2  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2872  potassium transporter peripheral membrane component  28.95 
 
 
457 aa  83.2  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2479  TrkA-N domain protein  29.73 
 
 
445 aa  82.8  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4082  potassium transporter peripheral membrane component  26.84 
 
 
467 aa  82.4  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1590  potassium transporter peripheral membrane component  28.02 
 
 
449 aa  82.4  0.000000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00906485  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0014  potassium transporter peripheral membrane component  28.94 
 
 
458 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00830339  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0769  TrkA-N domain protein  30.74 
 
 
445 aa  81.6  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.601936 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2267  TrkA-N domain protein  27.88 
 
 
459 aa  82  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.634076  hitchhiker  0.00765776 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00140  potassium transporter peripheral membrane component  28.44 
 
 
457 aa  80.9  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35944  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0028  potassium transporter peripheral membrane component  26.86 
 
 
469 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000283519 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0072  potassium transporter peripheral membrane component  27.07 
 
 
458 aa  80.5  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  27.8 
 
 
450 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0021  potassium transporter peripheral membrane component  26.86 
 
 
469 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0024  potassium transporter peripheral membrane component  26.86 
 
 
469 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0028  potassium transporter peripheral membrane component  26.86 
 
 
469 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.736909  normal  0.0141363 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0029  potassium transporter peripheral membrane component  26.86 
 
 
469 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.313972  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0029  potassium transporter peripheral membrane component  26.45 
 
 
469 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3721  potassium transporter peripheral membrane component  26.64 
 
 
458 aa  79.3  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.455601  hitchhiker  0.00773793 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0026  potassium transporter peripheral membrane component  26.45 
 
 
469 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.570638  hitchhiker  0.00237688 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0024  potassium transporter peripheral membrane component  26.45 
 
 
469 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.738729  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0032  potassium transporter peripheral membrane component  26.45 
 
 
469 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.21174  hitchhiker  0.00000689203 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0021  potassium transporter peripheral membrane component  26.45 
 
 
469 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881079  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2258  TrkA-N domain protein  27.73 
 
 
236 aa  79.3  0.00000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0040  potassium transporter peripheral membrane component  28.45 
 
 
467 aa  78.6  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>