More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0312 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1590  potassium transporter peripheral membrane component  69.27 
 
 
449 aa  662    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00906485  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0312  potassium transporter peripheral membrane component  100 
 
 
449 aa  914    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0720169  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1399  TrkA-N domain protein  35.07 
 
 
455 aa  280  3e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000200171  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  31.69 
 
 
449 aa  252  1e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1970  potassium transporter peripheral membrane component  31.22 
 
 
453 aa  231  1e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.616677  normal  0.0915611 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  29.68 
 
 
445 aa  230  5e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  32.82 
 
 
450 aa  229  8e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  28.77 
 
 
443 aa  224  3e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  29.12 
 
 
450 aa  224  3e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3183  potassium transporter peripheral membrane component  30.32 
 
 
465 aa  223  4e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00657284  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2455  potassium transporter peripheral membrane component  28.85 
 
 
452 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.341783  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1310  potassium transporter peripheral membrane component  29.05 
 
 
444 aa  212  7.999999999999999e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2030  potassium transporter peripheral membrane component  26.5 
 
 
465 aa  210  4e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0693486  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0201  potassium transporter peripheral membrane component  29.05 
 
 
457 aa  209  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0211158  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3430  potassium transporter peripheral membrane component  29.76 
 
 
448 aa  206  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0375932  normal  0.146617 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3218  potassium transporter peripheral membrane component  27.19 
 
 
454 aa  205  1e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.715113  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3424  potassium transporter peripheral membrane component  29.19 
 
 
448 aa  204  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3126  potassium transporter peripheral membrane component  28.31 
 
 
458 aa  201  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1209  potassium transporter peripheral membrane component  29.09 
 
 
448 aa  198  2.0000000000000003e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.356485  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2479  TrkA-N domain protein  28.93 
 
 
445 aa  198  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0030  potassium transporter peripheral membrane component  28.48 
 
 
454 aa  197  3e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0819  potassium transporter peripheral membrane component  28.95 
 
 
437 aa  196  6e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1877  potassium transporter peripheral membrane component  26.42 
 
 
445 aa  196  9e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.113601 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1681  potassium transporter peripheral membrane component  27.64 
 
 
458 aa  195  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_29  cation transport protein, Trk system  27.73 
 
 
454 aa  194  4e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5096  TrkA-N domain protein  28.19 
 
 
448 aa  192  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1186  potassium transporter peripheral membrane component  26.58 
 
 
445 aa  189  7e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.596494  decreased coverage  0.00000028569 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4126  potassium transporter peripheral membrane component  26.86 
 
 
458 aa  187  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.215607  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1491  potassium transporter peripheral membrane component  25.76 
 
 
458 aa  187  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1615  potassium transporter peripheral membrane component  27.61 
 
 
458 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00170  potassium transporter peripheral membrane component  26.65 
 
 
457 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0180  Trk system potassium uptake protein TrkA  27.11 
 
 
457 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2242  potassium transporter peripheral membrane component  27.51 
 
 
458 aa  185  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0521644  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0028  potassium transporter peripheral membrane component  28.6 
 
 
469 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0026  potassium transporter peripheral membrane component  28.6 
 
 
469 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.570638  hitchhiker  0.00237688 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0024  potassium transporter peripheral membrane component  28.6 
 
 
469 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.738729  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1569  potassium transporter peripheral membrane component  26.3 
 
 
458 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0202479  normal  0.0449671 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0032  potassium transporter peripheral membrane component  28.6 
 
 
469 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.21174  hitchhiker  0.00000689203 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0017  potassium transporter peripheral membrane component  26.42 
 
 
457 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1093  potassium transporter peripheral membrane component  25.32 
 
 
458 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0014  potassium transporter peripheral membrane component  27.21 
 
 
458 aa  184  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00830339  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0087  potassium transporter peripheral membrane component  29.63 
 
 
466 aa  184  4.0000000000000006e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0029  potassium transporter peripheral membrane component  28.6 
 
 
469 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3739  potassium transporter peripheral membrane component  28.6 
 
 
469 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764602 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0029  potassium transporter peripheral membrane component  28.04 
 
 
454 aa  182  8.000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0038  potassium transporter peripheral membrane component  28.51 
 
 
458 aa  181  2e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0081  potassium transporter peripheral membrane component  27.9 
 
 
458 aa  181  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0040  potassium transporter peripheral membrane component  27.84 
 
 
467 aa  181  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4514  potassium transporter peripheral membrane component  26.86 
 
 
458 aa  181  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00906883  hitchhiker  0.00000865676 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0040  potassium transporter peripheral membrane component  27.07 
 
 
469 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.165147 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2849  potassium transporter peripheral membrane component  26.01 
 
 
457 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.336578  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0032  potassium transporter peripheral membrane component  27.95 
 
 
469 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0670474 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0016  potassium transporter peripheral membrane component  26.42 
 
 
457 aa  179  7e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2841  potassium transporter peripheral membrane component  25.33 
 
 
458 aa  179  7e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340173  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1453  potassium transporter peripheral membrane component  25.33 
 
 
458 aa  179  7e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.687964  normal  0.06884 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0028  potassium transporter peripheral membrane component  28.17 
 
 
469 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000283519 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0084  potassium transporter peripheral membrane component  26.65 
 
 
457 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.409393  hitchhiker  0.00000000549949 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0024  potassium transporter peripheral membrane component  28.17 
 
 
469 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0028  potassium transporter peripheral membrane component  28.17 
 
 
469 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.736909  normal  0.0141363 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0021  potassium transporter peripheral membrane component  27.95 
 
 
469 aa  179  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881079  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2622  potassium transporter peripheral membrane component  28.77 
 
 
458 aa  179  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.637696 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1445  potassium transporter peripheral membrane component  27.19 
 
 
457 aa  179  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000607771 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0029  potassium transporter peripheral membrane component  28.17 
 
 
469 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.313972  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0052  potassium transporter peripheral membrane component  26.47 
 
 
457 aa  179  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0734  TrkA-N domain protein  27.5 
 
 
450 aa  178  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0021  potassium transporter peripheral membrane component  27.17 
 
 
469 aa  178  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0065  potassium transporter peripheral membrane component  26.42 
 
 
457 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948816  unclonable  0.000000448887 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3885  potassium transporter peripheral membrane component  26.58 
 
 
458 aa  177  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0054195  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3261  potassium transporter peripheral membrane component  27.59 
 
 
484 aa  177  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.386779  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0313  potassium transporter peripheral membrane component  26.58 
 
 
458 aa  177  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.888467  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0021  potassium transporter peripheral membrane component  27.61 
 
 
469 aa  177  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0612  potassium transporter peripheral membrane component  26.58 
 
 
458 aa  177  3e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0369792  normal  0.0559785 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3912  potassium transporter peripheral membrane component  27.59 
 
 
484 aa  177  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0081  potassium transporter peripheral membrane component  26.21 
 
 
457 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  hitchhiker  0.0000000000177319 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0081  potassium transporter peripheral membrane component  26.42 
 
 
457 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685696  normal  0.107342 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4082  potassium transporter peripheral membrane component  26.76 
 
 
467 aa  176  6e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0035  potassium transporter peripheral membrane component  27.95 
 
 
469 aa  176  7e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.154438 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4544  potassium transporter peripheral membrane component  25.79 
 
 
492 aa  176  9e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0014  TrkA domain-containing protein  27.19 
 
 
457 aa  175  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0240987 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2085  TrkA-N domain protein  26.26 
 
 
444 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0187  potassium transporter peripheral membrane component  26.91 
 
 
465 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0699  TrkA-N domain protein  25.4 
 
 
444 aa  174  3.9999999999999995e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3473  TrkA-N domain protein  26.98 
 
 
442 aa  174  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.249749  normal  0.0183508 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002054  Trk system potassium uptake protein TrkA  26.54 
 
 
458 aa  171  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0072  potassium transporter peripheral membrane component  28.38 
 
 
458 aa  171  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00140  potassium transporter peripheral membrane component  25.71 
 
 
457 aa  171  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35944  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1469  TrkA-N domain protein  26.22 
 
 
454 aa  170  4e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12243  putative potassium uptake protein  27.84 
 
 
449 aa  170  4e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4396  potassium transporter peripheral membrane component  23.91 
 
 
458 aa  170  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0641614  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2267  TrkA-N domain protein  25.8 
 
 
459 aa  169  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.634076  hitchhiker  0.00765776 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00394  potassium transporter peripheral membrane component  26.64 
 
 
458 aa  168  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3606  potassium transporter peripheral membrane component  25.68 
 
 
458 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3776  potassium transporter peripheral membrane component  25.68 
 
 
458 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3713  potassium transporter peripheral membrane component  25.68 
 
 
458 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.461523 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3678  potassium transporter peripheral membrane component  25.68 
 
 
458 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3605  potassium transporter peripheral membrane component  25.68 
 
 
458 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267887  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0424  TrkA-N domain protein  25.68 
 
 
458 aa  167  4e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3483  potassium transporter peripheral membrane component  25.68 
 
 
458 aa  167  4e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0624843  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03091  hypothetical protein  25.68 
 
 
458 aa  167  4e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3772  potassium transporter peripheral membrane component  25.68 
 
 
458 aa  167  4e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.241443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>