More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3183 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_3183  potassium transporter peripheral membrane component  100 
 
 		 465 aa  942    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00657284  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0312  potassium transporter peripheral membrane component  30.32 
 
 		 449 aa  239  6.999999999999999e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0720169  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  31.4 
 
 		 449 aa  237  4e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1590  potassium transporter peripheral membrane component  30.39 
 
 		 449 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00906485  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  31.82 
 
 		 450 aa  227  3e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0734  TrkA-N domain protein  28.21 
 
 		 450 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2030  potassium transporter peripheral membrane component  29.21 
 
 		 465 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0693486  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1970  potassium transporter peripheral membrane component  32.33 
 
 		 453 aa  220  5e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.616677  normal  0.0915611 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  30.02 
 
 		 445 aa  219  7.999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1399  TrkA-N domain protein  28.51 
 
 		 455 aa  217  4e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000200171  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3218  potassium transporter peripheral membrane component  29.09 
 
 		 454 aa  212  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.715113  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3126  potassium transporter peripheral membrane component  28.78 
 
 		 458 aa  207  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  28.26 
 
 		 443 aa  207  3e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2455  potassium transporter peripheral membrane component  30.15 
 
 		 452 aa  207  4e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.341783  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1681  potassium transporter peripheral membrane component  28.39 
 
 		 458 aa  207  4e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  28.33 
 
 		 450 aa  206  1e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0201  potassium transporter peripheral membrane component  29.98 
 
 		 457 aa  203  5e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0211158  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3430  potassium transporter peripheral membrane component  30.92 
 
 		 448 aa  202  8e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0375932  normal  0.146617 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3424  potassium transporter peripheral membrane component  30.5 
 
 		 448 aa  195  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4514  potassium transporter peripheral membrane component  28.73 
 
 		 458 aa  195  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00906883  hitchhiker  0.00000865676 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0014  potassium transporter peripheral membrane component  28.51 
 
 		 458 aa  195  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00830339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1310  potassium transporter peripheral membrane component  29.74 
 
 		 444 aa  194  3e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002054  Trk system potassium uptake protein TrkA  28.76 
 
 		 458 aa  191  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00170  potassium transporter peripheral membrane component  28.36 
 
 		 457 aa  192  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0017  potassium transporter peripheral membrane component  28.36 
 
 		 457 aa  190  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4396  potassium transporter peripheral membrane component  26.79 
 
 		 458 aa  190  5e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0641614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0052  potassium transporter peripheral membrane component  29.14 
 
 		 457 aa  188  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1358  potassium transporter peripheral membrane component  28.69 
 
 		 458 aa  188  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1877  potassium transporter peripheral membrane component  26.52 
 
 		 445 aa  188  2e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.113601 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2242  potassium transporter peripheral membrane component  27.25 
 
 		 458 aa  187  3e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0521644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00394  potassium transporter peripheral membrane component  28.51 
 
 		 458 aa  187  4e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1569  potassium transporter peripheral membrane component  27.91 
 
 		 458 aa  187  5e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0202479  normal  0.0449671 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00140  potassium transporter peripheral membrane component  28.36 
 
 		 457 aa  186  9e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35944  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0016  potassium transporter peripheral membrane component  28.42 
 
 		 457 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3792  potassium transporter peripheral membrane component  28.29 
 
 		 458 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2872  potassium transporter peripheral membrane component  29.98 
 
 		 457 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0180  Trk system potassium uptake protein TrkA  28.39 
 
 		 457 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0038  potassium transporter peripheral membrane component  30.47 
 
 		 458 aa  185  2.0000000000000003e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0030  potassium transporter peripheral membrane component  27.14 
 
 		 454 aa  184  3e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0065  potassium transporter peripheral membrane component  28.15 
 
 		 457 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948816  unclonable  0.000000448887 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0081  potassium transporter peripheral membrane component  28.15 
 
 		 457 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685696  normal  0.107342 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1093  potassium transporter peripheral membrane component  25.11 
 
 		 458 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0081  potassium transporter peripheral membrane component  28.15 
 
 		 457 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  hitchhiker  0.0000000000177319 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1469  TrkA-N domain protein  29.5 
 
 		 454 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0436  potassium transporter peripheral membrane component  27.27 
 
 		 458 aa  182  8.000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0084  potassium transporter peripheral membrane component  28.15 
 
 		 457 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.409393  hitchhiker  0.00000000549949 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3713  potassium transporter peripheral membrane component  28.08 
 
 		 458 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.461523 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3776  potassium transporter peripheral membrane component  28.08 
 
 		 458 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0353  potassium transporter peripheral membrane component  27.21 
 
 		 458 aa  182  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3971  potassium transporter peripheral membrane component  28.08 
 
 		 458 aa  182  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0755481  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3606  potassium transporter peripheral membrane component  28.08 
 
 		 458 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3605  potassium transporter peripheral membrane component  28.08 
 
 		 458 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267887  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1491  potassium transporter peripheral membrane component  26.74 
 
 		 458 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3678  potassium transporter peripheral membrane component  28.08 
 
 		 458 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2841  potassium transporter peripheral membrane component  26.53 
 
 		 458 aa  182  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340173  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1453  potassium transporter peripheral membrane component  26.53 
 
 		 458 aa  182  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.687964  normal  0.06884 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3721  potassium transporter peripheral membrane component  28.08 
 
 		 458 aa  181  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.455601  hitchhiker  0.00773793 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1615  potassium transporter peripheral membrane component  26.33 
 
 		 458 aa  181  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2476  potassium transporter peripheral membrane component  28.51 
 
 		 458 aa  180  4.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03140  potassium transporter peripheral membrane component  27.86 
 
 		 458 aa  180  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.946548  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0424  TrkA-N domain protein  27.86 
 
 		 458 aa  180  5.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03091  hypothetical protein  27.86 
 
 		 458 aa  180  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3585  potassium transporter peripheral membrane component  27.86 
 
 		 458 aa  180  5.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.931761  normal  0.13042 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4612  potassium transporter peripheral membrane component  27.86 
 
 		 458 aa  180  5.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00524775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3483  potassium transporter peripheral membrane component  27.86 
 
 		 458 aa  180  5.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0624843  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3772  potassium transporter peripheral membrane component  27.86 
 
 		 458 aa  180  5.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.241443  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0424  potassium transporter peripheral membrane component  27.86 
 
 		 458 aa  180  5.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000421391 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3674  potassium transporter peripheral membrane component  27.86 
 
 		 458 aa  180  5.999999999999999e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0028  potassium transporter peripheral membrane component  28.99 
 
 		 469 aa  179  7e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0612  potassium transporter peripheral membrane component  27.39 
 
 		 458 aa  179  9e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0369792  normal  0.0559785 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0313  potassium transporter peripheral membrane component  27.39 
 
 		 458 aa  179  9e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.888467  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3885  potassium transporter peripheral membrane component  27.39 
 
 		 458 aa  179  9e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0054195  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0032  potassium transporter peripheral membrane component  28.99 
 
 		 469 aa  179  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0670474 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0072  potassium transporter peripheral membrane component  28.08 
 
 		 458 aa  178  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12243  putative potassium uptake protein  29.17 
 
 		 449 aa  178  2e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0029  potassium transporter peripheral membrane component  26.72 
 
 		 454 aa  177  3e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4126  potassium transporter peripheral membrane component  27.18 
 
 		 458 aa  177  4e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.215607  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2267  TrkA-N domain protein  27.21 
 
 		 459 aa  176  8e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.634076  hitchhiker  0.00765776 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_29  cation transport protein, Trk system  26.3 
 
 		 454 aa  176  9e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2085  TrkA-N domain protein  27.25 
 
 		 444 aa  175  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4082  potassium transporter peripheral membrane component  26.79 
 
 		 467 aa  175  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0026  potassium transporter peripheral membrane component  28.78 
 
 		 469 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.570638  hitchhiker  0.00237688 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0024  potassium transporter peripheral membrane component  28.78 
 
 		 469 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.738729  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0032  potassium transporter peripheral membrane component  28.78 
 
 		 469 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.21174  hitchhiker  0.00000689203 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0081  potassium transporter peripheral membrane component  27.86 
 
 		 458 aa  174  2.9999999999999996e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0035  potassium transporter peripheral membrane component  28.78 
 
 		 469 aa  173  5e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.154438 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0029  potassium transporter peripheral membrane component  28.36 
 
 		 469 aa  172  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3739  potassium transporter peripheral membrane component  28.57 
 
 		 469 aa  172  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00764602 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5999  potassium transporter peripheral membrane component  26.17 
 
 		 485 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0135992 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0014  TrkA domain-containing protein  27.98 
 
 		 457 aa  171  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0240987 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0699  TrkA-N domain protein  27.75 
 
 		 444 aa  171  3e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0040  potassium transporter peripheral membrane component  25.93 
 
 		 467 aa  170  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0021  potassium transporter peripheral membrane component  28.57 
 
 		 469 aa  170  4e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881079  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2209  potassium transporter peripheral membrane component  25.11 
 
 		 458 aa  170  6e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0028  potassium transporter peripheral membrane component  28.36 
 
 		 469 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000283519 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2479  TrkA-N domain protein  25.22 
 
 		 445 aa  169  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0040  potassium transporter peripheral membrane component  27.73 
 
 		 469 aa  169  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.165147 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0024  potassium transporter peripheral membrane component  28.36 
 
 		 469 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0029  potassium transporter peripheral membrane component  28.36 
 
 		 469 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.313972  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0028  potassium transporter peripheral membrane component  28.36 
 
 		 469 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.736909  normal  0.0141363 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>