More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2907 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  100 
 
 
450 aa  897    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  43.15 
 
 
450 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  41.7 
 
 
445 aa  343  2.9999999999999997e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3218  potassium transporter peripheral membrane component  38.94 
 
 
454 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.715113  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  39.28 
 
 
443 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  38.75 
 
 
449 aa  324  2e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3424  potassium transporter peripheral membrane component  38.55 
 
 
448 aa  317  2e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1310  potassium transporter peripheral membrane component  38.75 
 
 
444 aa  302  8.000000000000001e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3430  potassium transporter peripheral membrane component  37.53 
 
 
448 aa  297  3e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0375932  normal  0.146617 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2030  potassium transporter peripheral membrane component  36.42 
 
 
465 aa  297  3e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0693486  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1970  potassium transporter peripheral membrane component  37.83 
 
 
453 aa  291  1e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.616677  normal  0.0915611 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1681  potassium transporter peripheral membrane component  38.16 
 
 
458 aa  288  1e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0734  TrkA-N domain protein  36.44 
 
 
450 aa  286  4e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2455  potassium transporter peripheral membrane component  36.78 
 
 
452 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.341783  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0052  potassium transporter peripheral membrane component  36.7 
 
 
457 aa  282  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0030  potassium transporter peripheral membrane component  36.04 
 
 
454 aa  280  3e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3885  potassium transporter peripheral membrane component  36.87 
 
 
458 aa  279  7e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0054195  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0313  potassium transporter peripheral membrane component  36.87 
 
 
458 aa  279  7e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.888467  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0612  potassium transporter peripheral membrane component  36.87 
 
 
458 aa  279  7e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0369792  normal  0.0559785 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3126  potassium transporter peripheral membrane component  35.53 
 
 
458 aa  278  2e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0014  potassium transporter peripheral membrane component  36.76 
 
 
458 aa  276  6e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00830339  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_29  cation transport protein, Trk system  35.6 
 
 
454 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0180  Trk system potassium uptake protein TrkA  36.06 
 
 
457 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00170  potassium transporter peripheral membrane component  35.38 
 
 
457 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0016  potassium transporter peripheral membrane component  36.06 
 
 
457 aa  274  3e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0201  potassium transporter peripheral membrane component  37.3 
 
 
457 aa  271  2e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0211158  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0017  potassium transporter peripheral membrane component  34.95 
 
 
457 aa  270  4e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00394  potassium transporter peripheral membrane component  34.44 
 
 
458 aa  269  8.999999999999999e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4514  potassium transporter peripheral membrane component  35.76 
 
 
458 aa  268  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00906883  hitchhiker  0.00000865676 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0084  potassium transporter peripheral membrane component  35.24 
 
 
457 aa  266  7e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.409393  hitchhiker  0.00000000549949 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002054  Trk system potassium uptake protein TrkA  34.25 
 
 
458 aa  266  8e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0065  potassium transporter peripheral membrane component  35.01 
 
 
457 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948816  unclonable  0.000000448887 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3971  potassium transporter peripheral membrane component  35.54 
 
 
458 aa  265  1e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0755481  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0081  potassium transporter peripheral membrane component  35.01 
 
 
457 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  hitchhiker  0.0000000000177319 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0081  potassium transporter peripheral membrane component  35.01 
 
 
457 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685696  normal  0.107342 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3792  potassium transporter peripheral membrane component  35.32 
 
 
458 aa  264  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0436  potassium transporter peripheral membrane component  34.58 
 
 
458 aa  263  4e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0029  potassium transporter peripheral membrane component  35.96 
 
 
454 aa  262  6.999999999999999e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3713  potassium transporter peripheral membrane component  34.87 
 
 
458 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.461523 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00140  potassium transporter peripheral membrane component  34.96 
 
 
457 aa  261  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35944  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3678  potassium transporter peripheral membrane component  34.87 
 
 
458 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0038  potassium transporter peripheral membrane component  36.56 
 
 
458 aa  261  2e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3776  potassium transporter peripheral membrane component  34.87 
 
 
458 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3605  potassium transporter peripheral membrane component  34.87 
 
 
458 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267887  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3606  potassium transporter peripheral membrane component  34.87 
 
 
458 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0353  potassium transporter peripheral membrane component  35.24 
 
 
458 aa  260  4e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2476  potassium transporter peripheral membrane component  34.66 
 
 
458 aa  259  8e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03140  potassium transporter peripheral membrane component  34.43 
 
 
458 aa  259  9e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.946548  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0424  TrkA-N domain protein  34.43 
 
 
458 aa  259  9e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3772  potassium transporter peripheral membrane component  34.43 
 
 
458 aa  259  9e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.241443  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3483  potassium transporter peripheral membrane component  34.43 
 
 
458 aa  259  9e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0624843  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03091  hypothetical protein  34.43 
 
 
458 aa  259  9e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3585  potassium transporter peripheral membrane component  34.43 
 
 
458 aa  259  9e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.931761  normal  0.13042 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3674  potassium transporter peripheral membrane component  34.43 
 
 
458 aa  259  9e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4612  potassium transporter peripheral membrane component  34.43 
 
 
458 aa  259  9e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00524775  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0424  potassium transporter peripheral membrane component  34.43 
 
 
458 aa  259  9e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000421391 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0081  potassium transporter peripheral membrane component  34.32 
 
 
458 aa  258  1e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0072  potassium transporter peripheral membrane component  34.66 
 
 
458 aa  258  2e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4082  potassium transporter peripheral membrane component  34.85 
 
 
467 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1093  potassium transporter peripheral membrane component  33.92 
 
 
458 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2242  potassium transporter peripheral membrane component  34.14 
 
 
458 aa  255  1.0000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0521644  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3721  potassium transporter peripheral membrane component  34.21 
 
 
458 aa  254  2.0000000000000002e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.455601  hitchhiker  0.00773793 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0029  potassium transporter peripheral membrane component  33.41 
 
 
469 aa  252  7e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1072  potassium transporter peripheral membrane component  36.11 
 
 
458 aa  252  8.000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0032  potassium transporter peripheral membrane component  33.41 
 
 
469 aa  251  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0670474 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1569  potassium transporter peripheral membrane component  34.58 
 
 
458 aa  252  1e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0202479  normal  0.0449671 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0026  potassium transporter peripheral membrane component  33.19 
 
 
469 aa  251  2e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.570638  hitchhiker  0.00237688 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0024  potassium transporter peripheral membrane component  33.19 
 
 
469 aa  251  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.738729  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0032  potassium transporter peripheral membrane component  33.19 
 
 
469 aa  251  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.21174  hitchhiker  0.00000689203 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0035  potassium transporter peripheral membrane component  32.76 
 
 
469 aa  250  3e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.154438 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2872  potassium transporter peripheral membrane component  35.84 
 
 
457 aa  250  5e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1491  potassium transporter peripheral membrane component  33.48 
 
 
458 aa  249  5e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1615  potassium transporter peripheral membrane component  34.64 
 
 
458 aa  249  7e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2267  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 
459 aa  248  2e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.634076  hitchhiker  0.00765776 
 
 
-
 
NC_004310  BR1114  potassium transporter peripheral membrane component  35.89 
 
 
458 aa  248  2e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2841  potassium transporter peripheral membrane component  33.26 
 
 
458 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340173  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1453  potassium transporter peripheral membrane component  33.26 
 
 
458 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.687964  normal  0.06884 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0028  potassium transporter peripheral membrane component  32.74 
 
 
469 aa  247  3e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4396  potassium transporter peripheral membrane component  34.99 
 
 
458 aa  247  3e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0641614  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0312  potassium transporter peripheral membrane component  32.82 
 
 
449 aa  247  4e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0720169  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5096  TrkA-N domain protein  33.56 
 
 
448 aa  246  4e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3739  potassium transporter peripheral membrane component  32.96 
 
 
469 aa  246  4e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764602 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2209  potassium transporter peripheral membrane component  35.23 
 
 
458 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0020  potassium transporter peripheral membrane component  33.19 
 
 
457 aa  246  6e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1469  TrkA-N domain protein  34.47 
 
 
454 aa  246  6e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1877  potassium transporter peripheral membrane component  34.9 
 
 
445 aa  246  8e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.113601 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1590  potassium transporter peripheral membrane component  32.13 
 
 
449 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00906485  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0021  potassium transporter peripheral membrane component  32.74 
 
 
469 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4126  potassium transporter peripheral membrane component  35.02 
 
 
458 aa  245  9.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.215607  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2479  TrkA-N domain protein  34.33 
 
 
445 aa  243  5e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12243  putative potassium uptake protein  31.19 
 
 
449 aa  243  5e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0028  potassium transporter peripheral membrane component  32.54 
 
 
469 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.736909  normal  0.0141363 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0028  potassium transporter peripheral membrane component  32.54 
 
 
469 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000283519 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0024  potassium transporter peripheral membrane component  32.54 
 
 
469 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0029  potassium transporter peripheral membrane component  32.54 
 
 
469 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.313972  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0021  potassium transporter peripheral membrane component  32.33 
 
 
469 aa  243  7e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881079  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0021  potassium transporter peripheral membrane component  32.11 
 
 
469 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0014  TrkA domain-containing protein  34.07 
 
 
457 aa  242  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0240987 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1186  potassium transporter peripheral membrane component  30.94 
 
 
445 aa  241  1e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.596494  decreased coverage  0.00000028569 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3020  potassium transporter peripheral membrane component  34.07 
 
 
457 aa  241  2e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>